22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3366 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3366  hypothetical protein  100 
 
 
351 aa  720    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2347  glycosyl transferase family 2  50.63 
 
 
1562 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0423  hypothetical protein  38.31 
 
 
323 aa  215  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.607873 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1551  hypothetical protein  38.33 
 
 
329 aa  196  6e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.983382  normal  0.672175 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1771  hypothetical protein  37.16 
 
 
366 aa  176  5e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0716326  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0934  hypothetical protein  35 
 
 
573 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0250  hypothetical protein  36.79 
 
 
335 aa  171  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0673  putative glycosyltransferase  37.59 
 
 
327 aa  168  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.353586  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3527  hypothetical Glycosyltransferase  29.69 
 
 
689 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1704  hypothetical Glycosyltransferase  29.69 
 
 
689 aa  153  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.663936  hitchhiker  0.0000000000000460309 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  25.37 
 
 
3301 aa  92.4  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5781  glycosyl transferase, group 1  27.61 
 
 
373 aa  89.4  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.820711 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1329  hypothetical protein  28.29 
 
 
450 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2778  glycosyl transferase, group 1  23.72 
 
 
327 aa  80.9  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3985  hypothetical protein  24.51 
 
 
527 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0517  hypothetical protein  26.17 
 
 
339 aa  73.6  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2484  glycosyl transferase, group 1  23.94 
 
 
856 aa  69.3  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.672737  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0150  glycosyl transferase, group 1  25.77 
 
 
316 aa  67.8  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240028  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0491  glycosyl transferase group 1  32 
 
 
867 aa  63.2  0.000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2577  hypothetical protein  21.59 
 
 
356 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.409061 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2581  hypothetical protein  22.65 
 
 
335 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.399589 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2780  hypothetical protein  23.53 
 
 
317 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.349092 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>