14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2780 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2780  hypothetical protein  100 
 
 		 317 aa  661    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.349092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2581  hypothetical protein  26.65 
 
 		 335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.399589 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2484  glycosyl transferase, group 1  28.03 
 
 		 856 aa  110  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.672737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2778  glycosyl transferase, group 1  26.07 
 
 		 327 aa  105  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2577  hypothetical protein  26.64 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.409061 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  23.43 
 
 		 3301 aa  95.5  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3985  hypothetical protein  24.79 
 
 		 527 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0491  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 		 867 aa  87  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0150  glycosyl transferase, group 1  23.81 
 
 		 316 aa  79.3  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1329  hypothetical protein  23.36 
 
 		 450 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0517  hypothetical protein  23.96 
 
 		 339 aa  54.7  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5781  glycosyl transferase, group 1  23.24 
 
 		 373 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.820711 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3366  hypothetical protein  23.53 
 
 		 351 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0423  hypothetical protein  22.49 
 
 		 323 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.607873 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>