More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3184 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4022  glycosyl transferase group 1  89.79 
 
 
386 aa  699    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3184  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
389 aa  791    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02448  glycosyl transferase, group 1  38.12 
 
 
381 aa  296  5e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0107535  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1064  glycosyl transferase, group 1  30.88 
 
 
363 aa  99.4  9e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.271463  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2278  glycosyl transferase, group 1  25.66 
 
 
369 aa  96.7  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0724331  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0750  glycosyl transferase, group 1  35.36 
 
 
361 aa  95.5  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366124  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0963  glycosyl transferase, group 1  28.53 
 
 
369 aa  94  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2857  glycosyl transferase, group 1  31.18 
 
 
372 aa  93.2  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0951854  normal  0.475894 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2510  glycosyl transferase, group 1  42.06 
 
 
345 aa  90.5  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.568348  normal  0.819187 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
381 aa  89  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2454  glycosyl transferase group 1  32.4 
 
 
347 aa  88.6  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  31.87 
 
 
384 aa  86.7  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  30.8 
 
 
423 aa  86.3  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2752  glycosyl transferase group 1  42.25 
 
 
346 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  30.72 
 
 
394 aa  85.5  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  37.16 
 
 
370 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1901  putative glycosyltransferase  36.18 
 
 
793 aa  85.1  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0537767  normal  0.403992 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  23.45 
 
 
390 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3076  glycosyl transferase, group 1  24.91 
 
 
365 aa  84  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 
391 aa  83.6  0.000000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  37.68 
 
 
424 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119517  glycosyl transferase, putative alpha-1,3-mannosyltransferase  31.87 
 
 
480 aa  82.8  0.000000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  35.85 
 
 
419 aa  82.8  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  33.71 
 
 
370 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0184  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
359 aa  81.6  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 
396 aa  80.9  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0369  mannosyltransferase  25.84 
 
 
365 aa  80.9  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  36.32 
 
 
370 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  30.36 
 
 
408 aa  80.9  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10227  hypothetical protein  36.51 
 
 
384 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.990297  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0426  glycosyl transferase, group 1  30.72 
 
 
386 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2772  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
967 aa  80.1  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.602029  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0193  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 
398 aa  80.1  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  35.67 
 
 
437 aa  80.1  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  35.67 
 
 
437 aa  80.1  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1051  glycosyl transferase, group 1  30.48 
 
 
445 aa  79.7  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6093  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 
389 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.456986  decreased coverage  0.00115696 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5250  glycosyl transferase group 1  35.23 
 
 
430 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.01095 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1443  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 
363 aa  78.2  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.739499  hitchhiker  0.0000273098 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  36.84 
 
 
438 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  27.52 
 
 
419 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  36.84 
 
 
438 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  24.5 
 
 
391 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  31.8 
 
 
353 aa  77.8  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  23.73 
 
 
391 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  33.33 
 
 
373 aa  77.4  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  26.59 
 
 
373 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 
434 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2700  glycosyl transferase, group 1  27.2 
 
 
414 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0049  glycosyl transferase group 1  28.27 
 
 
366 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  34.74 
 
 
439 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  32.05 
 
 
466 aa  76.6  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0051  glycosyl transferase group 1  28.27 
 
 
366 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  36.42 
 
 
406 aa  76.6  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  34.74 
 
 
439 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  34.74 
 
 
439 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  31.09 
 
 
435 aa  76.3  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0926  glycosyl transferase group 1  24.3 
 
 
364 aa  76.3  0.0000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  24.12 
 
 
361 aa  76.3  0.0000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  23.66 
 
 
398 aa  76.3  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0182  glycosyl transferase group 1  27 
 
 
389 aa  76.3  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700197  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1115  glycosyl transferase, group 1  24.56 
 
 
362 aa  75.5  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.282541 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 
355 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0775  glycosyl transferase group 1  37.98 
 
 
345 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0449927  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  25.6 
 
 
404 aa  75.9  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  32.04 
 
 
450 aa  75.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0242  glycosyl transferase, group 1  33.06 
 
 
386 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.19746 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.89 
 
 
443 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3665  glycosyl transferase group 1  26.95 
 
 
363 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  29.86 
 
 
376 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3590  glycosyl transferase, group 1  31.5 
 
 
372 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1177  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 
382 aa  75.1  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3000  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 
384 aa  75.5  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0763479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3663  glycosyl transferase, group 1  31.5 
 
 
372 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.362873  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.89 
 
 
443 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3595  glycosyl transferase, group 1  31.5 
 
 
372 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0979508  normal  0.655061 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.89 
 
 
498 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0588  glycosyl transferase group 1  24.55 
 
 
349 aa  74.3  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00564235  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.89 
 
 
443 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  30.93 
 
 
448 aa  74.3  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.89 
 
 
499 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
426 aa  74.3  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.89 
 
 
443 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.89 
 
 
495 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
387 aa  74.3  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3845  glycosyl transferase, group 1  31.34 
 
 
802 aa  73.9  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.880485  normal  0.505849 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  31.55 
 
 
442 aa  73.6  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22554  mannosyltransferase  25.96 
 
 
419 aa  73.6  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1413  mannosyltransferase  25.58 
 
 
354 aa  73.6  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.953806  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 
453 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
420 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 
361 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  27.83 
 
 
361 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0211  glycosyl transferase group 1  35.97 
 
 
393 aa  73.6  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0627  UDP-N-acetylglucosamine  28.21 
 
 
438 aa  73.2  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  28.63 
 
 
370 aa  72.8  0.000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0219  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 
360 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0229  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 
386 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0736189  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 
384 aa  72.8  0.000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0209  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 
386 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.959787  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>