More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2510 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2510  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
345 aa  682    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.568348  normal  0.819187 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2752  glycosyl transferase group 1  85.22 
 
 
346 aa  578  1e-164  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2454  glycosyl transferase group 1  66.96 
 
 
347 aa  463  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0775  glycosyl transferase group 1  57.43 
 
 
345 aa  394  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0449927  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3845  glycosyl transferase, group 1  42.07 
 
 
802 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.880485  normal  0.505849 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1902  putative glycosyltransferase  36.81 
 
 
348 aa  237  2e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.14204  normal  0.395926 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0292  glycosyl transferase, group 1  38.51 
 
 
349 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0527106  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0291  glycosyl transferase, group 1  35.69 
 
 
345 aa  188  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.425036  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1901  putative glycosyltransferase  33.5 
 
 
793 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0537767  normal  0.403992 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0963  glycosyl transferase, group 1  34.83 
 
 
369 aa  104  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0750  glycosyl transferase, group 1  36.26 
 
 
361 aa  97.1  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366124  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1064  glycosyl transferase, group 1  30.31 
 
 
363 aa  96.7  5e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.271463  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3184  glycosyl transferase group 1  42.06 
 
 
389 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  37.68 
 
 
370 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0369  mannosyltransferase  28.43 
 
 
365 aa  90.1  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  26.13 
 
 
373 aa  90.1  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3665  glycosyl transferase group 1  41.77 
 
 
363 aa  86.7  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.31 
 
 
495 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.31 
 
 
443 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0193  glycosyl transferase, group 1  38.12 
 
 
398 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.31 
 
 
443 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.31 
 
 
498 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4022  glycosyl transferase group 1  41.27 
 
 
386 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.31 
 
 
443 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0184  glycosyl transferase, group 1  35.29 
 
 
359 aa  85.5  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.31 
 
 
443 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.31 
 
 
499 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 
387 aa  84.3  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2278  glycosyl transferase, group 1  35.43 
 
 
369 aa  84.7  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0724331  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  29.91 
 
 
446 aa  84  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1177  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
382 aa  83.6  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4009  glycosyl transferase group 1  38.95 
 
 
361 aa  82.8  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0496  glycosyl transferase, group 1  32.09 
 
 
371 aa  82.8  0.000000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.166114  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 
424 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3595  glycosyl transferase, group 1  40.35 
 
 
372 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0979508  normal  0.655061 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3076  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
365 aa  82  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3590  glycosyl transferase, group 1  40.35 
 
 
372 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3663  glycosyl transferase, group 1  40.35 
 
 
372 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.362873  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0884  glycosyltransferase  35.33 
 
 
407 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.287497  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17391  glycosyltransferase  35.33 
 
 
407 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2857  glycosyl transferase, group 1  33.68 
 
 
372 aa  80.9  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0951854  normal  0.475894 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  37.14 
 
 
390 aa  80.5  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  40.94 
 
 
377 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4045  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 
360 aa  79.7  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1037  putative glycosyltransferase group 1 family protein  34.25 
 
 
380 aa  80.1  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201678  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1124  glycosyl transferase group 1  36.54 
 
 
402 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.483149  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1553  glycosyltransferase  35.59 
 
 
415 aa  79.3  0.00000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.451561  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  30.21 
 
 
353 aa  79.3  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 
351 aa  79.3  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20091  glycosyltransferase  35.18 
 
 
410 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  43.65 
 
 
407 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4215  glycosyl transferase group 1  36.09 
 
 
374 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51246  normal  0.319994 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  22.96 
 
 
390 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0211  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 
393 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2980  glycosyl transferase group 1  33.52 
 
 
419 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 
394 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  25 
 
 
388 aa  78.2  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  33.85 
 
 
400 aa  78.2  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  34.52 
 
 
371 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  35.21 
 
 
433 aa  77  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 
426 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0959  glycosyl transferase group 1  23.91 
 
 
388 aa  77  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0926  glycosyl transferase group 1  31.18 
 
 
364 aa  76.6  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  29.32 
 
 
453 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  25.96 
 
 
361 aa  76.6  0.0000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  36.31 
 
 
385 aa  76.6  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  36.53 
 
 
419 aa  76.3  0.0000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  31.5 
 
 
422 aa  76.3  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5198  glycosyl transferase group 1  39.16 
 
 
426 aa  76.3  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.603506  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  32.02 
 
 
422 aa  76.3  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  23.24 
 
 
391 aa  76.3  0.0000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3205  glycosyl transferase, group 1  32.81 
 
 
387 aa  76.3  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2025  glycosyltransferase  32.71 
 
 
361 aa  75.5  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.872693  normal  0.897375 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  24.91 
 
 
387 aa  75.5  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3532  glycosyl transferase group 1  32.16 
 
 
389 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1538  glycosyl transferase, group 1  33.12 
 
 
379 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 
419 aa  75.1  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 
415 aa  75.1  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  34.62 
 
 
409 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0294  hypothetical protein  32.67 
 
 
395 aa  74.3  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  29.34 
 
 
365 aa  74.3  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3401  glycosyl transferase group 1  32.19 
 
 
414 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154148  normal  0.135744 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  38.24 
 
 
376 aa  74.3  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 
435 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 
435 aa  74.3  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4017  glycosyl transferase group 1  38.24 
 
 
384 aa  73.9  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.174092  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  37.97 
 
 
800 aa  73.9  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  29.45 
 
 
408 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  27.53 
 
 
434 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0836  glycosyltransferase  34.46 
 
 
409 aa  73.2  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.260131  hitchhiker  0.000830652 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3129  glycosyl transferase group 1  32.68 
 
 
414 aa  72.8  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  23.92 
 
 
369 aa  72.8  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43286  predicted protein  32.22 
 
 
456 aa  72.8  0.000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.355252  normal  0.0628635 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  29.48 
 
 
423 aa  72.4  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43238  predicted protein  32.22 
 
 
456 aa  72.8  0.000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169779  normal  0.020707 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 
366 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  32.79 
 
 
438 aa  72  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2594  glycosyl transferase, group 1  33.53 
 
 
399 aa  72.4  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0321424  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1032  glycosyl transferase group 1  33.53 
 
 
413 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0309  glycosyl transferase, group 1  29.87 
 
 
347 aa  71.2  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>