More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1902 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1902  putative glycosyltransferase  100 
 
 
348 aa  720    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.14204  normal  0.395926 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2454  glycosyl transferase group 1  37.28 
 
 
347 aa  239  5.999999999999999e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3845  glycosyl transferase, group 1  36.1 
 
 
802 aa  229  6e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.880485  normal  0.505849 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0775  glycosyl transferase group 1  36.92 
 
 
345 aa  225  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0449927  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2752  glycosyl transferase group 1  37.26 
 
 
346 aa  223  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2510  glycosyl transferase, group 1  36.52 
 
 
345 aa  222  7e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.568348  normal  0.819187 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0291  glycosyl transferase, group 1  35.04 
 
 
345 aa  204  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.425036  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0292  glycosyl transferase, group 1  33.05 
 
 
349 aa  161  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0527106  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1901  putative glycosyltransferase  30.41 
 
 
793 aa  151  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0537767  normal  0.403992 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3076  glycosyl transferase, group 1  32.53 
 
 
365 aa  86.3  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2980  glycosyl transferase group 1  30.45 
 
 
419 aa  84.7  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0369  mannosyltransferase  27.47 
 
 
365 aa  83.6  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2938  glycosyl transferase, group 1  35.2 
 
 
351 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1553  glycosyltransferase  31.5 
 
 
415 aa  79.3  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.451561  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0182  glycosyl transferase group 1  29.72 
 
 
389 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700197  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 
390 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1064  glycosyl transferase, group 1  27 
 
 
363 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.271463  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4955  glycosyl transferase group 1  31.29 
 
 
405 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  30.67 
 
 
374 aa  77.4  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4045  glycosyl transferase, group 1  25.68 
 
 
360 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0750  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
361 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366124  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 
373 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20091  glycosyltransferase  33.52 
 
 
410 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4009  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 
361 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 
750 aa  73.6  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3111  group 1 glycosyl transferase  34.97 
 
 
383 aa  72.8  0.000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2264  glycosyl transferase, group 1  25.3 
 
 
385 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000647656 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  35.34 
 
 
400 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1036  glycosyl transferase, group 1  25.53 
 
 
378 aa  71.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3665  glycosyl transferase group 1  31.64 
 
 
363 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0836  glycosyltransferase  32.72 
 
 
409 aa  70.9  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.260131  hitchhiker  0.000830652 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  35.43 
 
 
411 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  32.91 
 
 
387 aa  70.9  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  35.43 
 
 
400 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1456  glycosyl transferase, group 1  32.33 
 
 
409 aa  70.5  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0526  glycosyl transferase, group 1  34.65 
 
 
363 aa  70.1  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.548625  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.43 
 
 
400 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 
374 aa  69.7  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  28.22 
 
 
364 aa  69.7  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2889  glycosyl transferase, group 1  32.03 
 
 
389 aa  69.7  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.228881  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2857  glycosyl transferase, group 1  28.1 
 
 
372 aa  69.7  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0951854  normal  0.475894 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2025  glycosyltransferase  28.28 
 
 
361 aa  69.3  0.00000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.872693  normal  0.897375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  35.04 
 
 
800 aa  68.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  31.9 
 
 
376 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 
391 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3573  glycosyl transferase, group 1  31.15 
 
 
378 aa  68.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.823094  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  29.14 
 
 
386 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1538  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 
379 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01937  putative glycosyltransferase WbbC  31.51 
 
 
370 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01924  hypothetical protein  31.51 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1530  glycosyltransferase  28.99 
 
 
366 aa  67.8  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000442427  normal  0.18466 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 
415 aa  67.8  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  34.59 
 
 
407 aa  67.4  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0963  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
369 aa  67.4  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1368  hypothetical protein  28.83 
 
 
393 aa  67  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  31.28 
 
 
386 aa  66.6  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  34.87 
 
 
419 aa  67  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0972  glycosyl transferase, group 1  30.36 
 
 
379 aa  67  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.775545  normal  0.23686 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  30.57 
 
 
369 aa  66.6  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0884  glycosyltransferase  30.86 
 
 
407 aa  66.2  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.287497  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0184  glycosyl transferase, group 1  24.02 
 
 
359 aa  66.2  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2645  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 
369 aa  66.2  0.0000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.490098  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17391  glycosyltransferase  30.86 
 
 
407 aa  65.9  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 
408 aa  65.9  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.531302 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22554  mannosyltransferase  33.62 
 
 
419 aa  65.5  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  33.13 
 
 
367 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0964  glycosyl transferase, group 1  42.57 
 
 
613 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  32.65 
 
 
414 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 
370 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  33.58 
 
 
439 aa  65.1  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  28.97 
 
 
408 aa  65.1  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0557  glycosyl transferase group 1  37.12 
 
 
377 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2594  glycosyl transferase, group 1  31.46 
 
 
399 aa  64.7  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0321424  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13661  glycosyltransferase  28.28 
 
 
401 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.244313  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2278  glycosyl transferase, group 1  29.73 
 
 
369 aa  65.1  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0724331  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3090  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 
440 aa  64.7  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  27.21 
 
 
419 aa  64.7  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 
377 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6093  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 
389 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.456986  decreased coverage  0.00115696 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3641  hypothetical protein  27.61 
 
 
384 aa  64.3  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.802577  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  30.91 
 
 
398 aa  64.7  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1701  glycosyl transferase, group 1  26.27 
 
 
363 aa  63.9  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0309421  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 
384 aa  64.3  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 
374 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 
422 aa  63.9  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  27.03 
 
 
388 aa  63.9  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1275  glycosyl transferase, group 1  27.5 
 
 
377 aa  63.9  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200618 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119517  glycosyl transferase, putative alpha-1,3-mannosyltransferase  34.38 
 
 
480 aa  63.9  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  25.93 
 
 
370 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4215  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
374 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51246  normal  0.319994 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0414  glycosyl transferase group 1  30.67 
 
 
363 aa  63.9  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3230  glycosyl transferase, group 1  28.72 
 
 
409 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.577335  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  34.07 
 
 
405 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 
367 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3728  glycosyl transferase group 1  25.21 
 
 
397 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0346462 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 
426 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0294  hypothetical protein  27.61 
 
 
395 aa  63.5  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  27.45 
 
 
413 aa  63.5  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.18 
 
 
405 aa  63.2  0.000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29990  Glycosyl transferase, group 1 family protein  35.9 
 
 
378 aa  63.2  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>