More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4022 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3184  glycosyl transferase group 1  89.79 
 
 
389 aa  699    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4022  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
386 aa  779    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02448  glycosyl transferase, group 1  38.22 
 
 
381 aa  298  1e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0107535  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1064  glycosyl transferase, group 1  30.53 
 
 
363 aa  95.9  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.271463  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2278  glycosyl transferase, group 1  24.71 
 
 
369 aa  94.7  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0724331  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  31.38 
 
 
381 aa  94.4  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2857  glycosyl transferase, group 1  32.37 
 
 
372 aa  93.6  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0951854  normal  0.475894 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0750  glycosyl transferase, group 1  32.3 
 
 
361 aa  92.4  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366124  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  30.82 
 
 
394 aa  91.7  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3076  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
365 aa  87.8  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119517  glycosyl transferase, putative alpha-1,3-mannosyltransferase  32.32 
 
 
480 aa  87.8  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  31.17 
 
 
370 aa  87  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2752  glycosyl transferase group 1  49.11 
 
 
346 aa  86.7  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0963  glycosyl transferase, group 1  29.43 
 
 
369 aa  86.3  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1901  putative glycosyltransferase  34.1 
 
 
793 aa  86.3  9e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0537767  normal  0.403992 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2510  glycosyl transferase, group 1  41.27 
 
 
345 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.568348  normal  0.819187 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  23.8 
 
 
390 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0184  glycosyl transferase, group 1  30.71 
 
 
359 aa  84.7  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  35.79 
 
 
450 aa  84.7  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  25.36 
 
 
391 aa  84  0.000000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3000  glycosyl transferase, group 1  29.47 
 
 
384 aa  83.2  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0763479  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0369  mannosyltransferase  26.47 
 
 
365 aa  83.2  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0193  glycosyl transferase, group 1  31.28 
 
 
398 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  24.29 
 
 
398 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  24.01 
 
 
391 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  31.49 
 
 
353 aa  80.9  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  24.22 
 
 
391 aa  80.5  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  26.35 
 
 
437 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  34.78 
 
 
424 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  32.58 
 
 
370 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6093  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 
389 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.456986  decreased coverage  0.00115696 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  32.74 
 
 
466 aa  79.7  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  34.3 
 
 
381 aa  79.7  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1051  glycosyl transferase, group 1  28.51 
 
 
445 aa  79.3  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3595  glycosyl transferase, group 1  31.76 
 
 
372 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0979508  normal  0.655061 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  23.51 
 
 
420 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3590  glycosyl transferase, group 1  31.76 
 
 
372 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0242  glycosyl transferase, group 1  30.37 
 
 
386 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.19746 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3663  glycosyl transferase, group 1  31.76 
 
 
372 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.362873  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2454  glycosyl transferase group 1  31.5 
 
 
347 aa  79.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 
361 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  34.41 
 
 
437 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  34.41 
 
 
437 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  31.64 
 
 
434 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  31.5 
 
 
384 aa  77.8  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  38.82 
 
 
419 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  33.15 
 
 
373 aa  77.4  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 
435 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  23.78 
 
 
361 aa  77.4  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0211  glycosyl transferase group 1  28.28 
 
 
393 aa  77  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  38.01 
 
 
438 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  38.01 
 
 
438 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  32.91 
 
 
810 aa  76.6  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0588  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 
349 aa  76.6  0.0000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00564235  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  28.82 
 
 
355 aa  76.6  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5863  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 
444 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  26.79 
 
 
353 aa  76.6  0.0000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 
426 aa  76.3  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  36.11 
 
 
442 aa  75.5  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 
419 aa  75.5  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 
434 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  32.02 
 
 
346 aa  75.5  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0775  glycosyl transferase group 1  36.43 
 
 
345 aa  75.5  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0449927  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  35.23 
 
 
370 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0051  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 
366 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22554  mannosyltransferase  25.71 
 
 
419 aa  75.1  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0049  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 
366 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4558  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 
381 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.478096  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0414  glycosyl transferase group 1  31.79 
 
 
363 aa  74.3  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  32.09 
 
 
423 aa  74.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1443  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 
363 aa  74.3  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.739499  hitchhiker  0.0000273098 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  30.32 
 
 
458 aa  74.3  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.78 
 
 
443 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.78 
 
 
443 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 
396 aa  73.9  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.78 
 
 
499 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.78 
 
 
443 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.78 
 
 
498 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 
361 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.78 
 
 
495 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.78 
 
 
443 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0426  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 
386 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5500  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 
455 aa  73.6  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0983279 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
415 aa  73.6  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0182  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 
389 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700197  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  29.66 
 
 
408 aa  73.2  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10227  hypothetical protein  33.61 
 
 
384 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.990297  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3312  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 
359 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1413  mannosyltransferase  26.67 
 
 
354 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.953806  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  23.45 
 
 
351 aa  72.8  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 
434 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  37.43 
 
 
376 aa  72.8  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
378 aa  72.8  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4162  glycosyl transferase, group 1  29.46 
 
 
359 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  35.29 
 
 
439 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4204  glycosyl transferase, group 1  29.46 
 
 
359 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4402  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 
359 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4045  glycosyl transferase, group 1  31.7 
 
 
360 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  30.6 
 
 
363 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2772  glycosyl transferase, group 1  27.56 
 
 
967 aa  71.6  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.602029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>