More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02448 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02448  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
381 aa  788    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0107535  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4022  glycosyl transferase group 1  38.22 
 
 
386 aa  298  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3184  glycosyl transferase group 1  38.12 
 
 
389 aa  296  5e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119517  glycosyl transferase, putative alpha-1,3-mannosyltransferase  31.67 
 
 
480 aa  79  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  26.93 
 
 
404 aa  75.9  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2278  glycosyl transferase, group 1  24.92 
 
 
369 aa  75.5  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0724331  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2857  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 
372 aa  75.5  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0951854  normal  0.475894 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1177  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 
382 aa  74.3  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3076  glycosyl transferase, group 1  26.74 
 
 
365 aa  73.9  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_002950  PG1149  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.2 
 
 
375 aa  72  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  25.44 
 
 
373 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 
373 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89290  mannosyltransferase  24.76 
 
 
458 aa  68.9  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  24.19 
 
 
390 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  27.8 
 
 
408 aa  68.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 
424 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0369  mannosyltransferase  24.08 
 
 
365 aa  67  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0750  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 
361 aa  67  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366124  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  29.51 
 
 
388 aa  67  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  23.53 
 
 
419 aa  66.2  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3665  glycosyl transferase group 1  24.63 
 
 
363 aa  66.2  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22554  mannosyltransferase  31.85 
 
 
419 aa  65.9  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2025  glycosyltransferase  23.58 
 
 
361 aa  66.2  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.872693  normal  0.897375 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 
415 aa  65.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3205  glycosyl transferase, group 1  32.62 
 
 
387 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1036  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 
378 aa  66.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 
391 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 
438 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 
384 aa  65.1  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1538  glycosyl transferase, group 1  28.25 
 
 
379 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3845  glycosyl transferase, group 1  26.9 
 
 
802 aa  64.3  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.880485  normal  0.505849 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1064  glycosyl transferase, group 1  26.97 
 
 
363 aa  64.7  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.271463  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1259  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 
457 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00525262  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  25.68 
 
 
346 aa  64.3  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2700  glycosyl transferase, group 1  24.14 
 
 
414 aa  64.3  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1901  putative glycosyltransferase  28.83 
 
 
793 aa  63.9  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0537767  normal  0.403992 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2752  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 
346 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4045  glycosyl transferase, group 1  24.32 
 
 
360 aa  63.2  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06874  alpha-1,2-mannosyltransferase (Alg2), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G13210)  23.64 
 
 
478 aa  62.4  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0172627  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  25.14 
 
 
353 aa  62.8  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  28.11 
 
 
376 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4009  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 
361 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1456  glycosyl transferase group 1  25.22 
 
 
384 aa  62  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.550034  hitchhiker  0.000088456 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 
358 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2454  glycosyl transferase group 1  24.59 
 
 
347 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  30.98 
 
 
422 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0414  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 
363 aa  61.2  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0506  glycosyl transferase, group 1  29.5 
 
 
425 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0358  glycosyl transferase group 1  25.7 
 
 
405 aa  60.5  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
435 aa  60.5  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 
396 aa  60.5  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3180  glycosyl transferase, group 1  27.11 
 
 
409 aa  60.5  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.780891  normal  0.107104 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  29.89 
 
 
355 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0211  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 
393 aa  60.1  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 
387 aa  60.1  0.00000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2078  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 
464 aa  60.1  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  24.89 
 
 
438 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2510  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 
345 aa  59.7  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.568348  normal  0.819187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  24.86 
 
 
406 aa  59.7  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2594  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
399 aa  59.7  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0321424  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 
414 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1115  glycosyl transferase, group 1  21.65 
 
 
362 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.282541 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1037  putative glycosyltransferase group 1 family protein  23.15 
 
 
380 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201678  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  26.3 
 
 
404 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4558  glycosyl transferase group 1  21.34 
 
 
381 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.478096  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 
438 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1008  glycosyl transferase group 1  28.87 
 
 
353 aa  58.9  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000479257  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 
420 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 
391 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  24.71 
 
 
466 aa  58.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
423 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4593  glycosyl transferase group 1  30.87 
 
 
363 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196645  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  25.46 
 
 
404 aa  58.2  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  25.6 
 
 
453 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5057  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 
359 aa  57.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0775  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 
345 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0449927  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  24.79 
 
 
480 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1005  glycosyl transferase group 1  23.4 
 
 
357 aa  57.8  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.105019  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1093  glycosyl transferase group 1  30.2 
 
 
384 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1410  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.93 
 
 
379 aa  57.4  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1888  glycogen synthase  29.41 
 
 
404 aa  57.4  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000814984 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1133  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  24.02 
 
 
377 aa  57.4  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 
397 aa  57.4  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  28.65 
 
 
369 aa  57.4  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  29.5 
 
 
398 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1006  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
382 aa  57.4  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1842  glycosyl transferase, group 1  31.3 
 
 
363 aa  57.4  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0382406  normal  0.82753 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  23.61 
 
 
439 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  23.61 
 
 
439 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  23.61 
 
 
439 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  24.36 
 
 
418 aa  57  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  27.31 
 
 
336 aa  56.6  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1119  glycogen synthase  23.53 
 
 
386 aa  57  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493813  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0120  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 
393 aa  56.6  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000209107 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3590  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 
372 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3663  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 
372 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.362873  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3595  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 
372 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0979508  normal  0.655061 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  28.5 
 
 
401 aa  56.6  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 
391 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  26.78 
 
 
442 aa  55.8  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>