116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3423 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3423  FkbM family methyltransferase  100 
 
 
314 aa  654    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0570785 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5205  methyltransferase FkbM family  31.4 
 
 
303 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2894  methyltransferase FkbM  33.54 
 
 
296 aa  96.7  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0295  methyltransferase FkbM  30.1 
 
 
297 aa  95.1  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0747  methyltransferase FkbM  31.51 
 
 
306 aa  92  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0743  FkbM family methyltransferase  22.98 
 
 
661 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.70648  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3719  methyltransferase FkbM  32.97 
 
 
288 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2162  methyltransferase FkbM family  30.2 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0751  methyltransferase FkbM  28.32 
 
 
306 aa  79  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2142  FkbM family methyltransferase  29.38 
 
 
321 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2370  methyltransferase FkbM  28.19 
 
 
348 aa  77  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.363109  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2076  FkbM family methyltransferase  27.31 
 
 
316 aa  73.9  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.503081 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1716  FkbM family methyltransferase  26.78 
 
 
274 aa  73.6  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.174023  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1955  FkbM family methyltransferase  29.05 
 
 
283 aa  73.6  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00902633 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3374  FkbM family methyltransferase  24.83 
 
 
284 aa  73.9  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1567  FkbM family methyltransferase  26.85 
 
 
283 aa  72.8  0.000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0294  FkbM family methyltransferase  33.33 
 
 
454 aa  72.4  0.000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.314449  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5202  FkbM family methyltransferase  26.82 
 
 
416 aa  71.6  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.327791  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2773  FkbM family methyltransferase  30.32 
 
 
263 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2362  methyltransferase FkbM  28.57 
 
 
258 aa  70.1  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0747821 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2361  FkbM family methyltransferase  25.71 
 
 
270 aa  68.9  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000541582  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1244  methyltransferase FkbM  28.65 
 
 
254 aa  68.9  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1754  FkbM family methyltransferase  25.25 
 
 
488 aa  67.4  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7663  methyltransferase FkbM family  25.55 
 
 
283 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  29.65 
 
 
792 aa  66.6  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5723  FkbM family methyltransferase  30.18 
 
 
265 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0496638  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4024  methyltransferase FkbM family  30.51 
 
 
351 aa  64.3  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1852  methyltransferase FkbM family  26.55 
 
 
297 aa  63.9  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0352  methyltransferase FkbM family  26.88 
 
 
256 aa  63.5  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000196185  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1323  FkbM family methyltransferase  26.37 
 
 
257 aa  62.8  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0619476  hitchhiker  0.000000000782975 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2360  methyltransferase FkbM  28.57 
 
 
260 aa  61.6  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0204457 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4516  FkbM family methyltransferase  28.57 
 
 
277 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6950  FkbM family methyltransferase  25.11 
 
 
283 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2953  methyltransferase FkbM family  30.06 
 
 
271 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  27.67 
 
 
723 aa  61.6  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0376  FkbM family methyltransferase  25.71 
 
 
326 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.589969  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3172  methyltransferase FkbM family  25.48 
 
 
295 aa  60.8  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0408  methyltransferase FkbM family  25.71 
 
 
313 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482809 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2883  methyltransferase FkbM family  26.97 
 
 
309 aa  60.5  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.241941  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4283  methyltransferase, FkbM family protein  29.86 
 
 
392 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0453  methyltransferase FkbM family  26.37 
 
 
250 aa  59.3  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5298  FkbM family methyltransferase  26.92 
 
 
261 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0444  methyltransferase FkbM family  27.95 
 
 
275 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0764  methyltransferase FkbM  25.64 
 
 
283 aa  57.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0124652 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2624  FkbM family methyltransferase  28.4 
 
 
282 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3682  FkbM family methyltransferase  26.74 
 
 
279 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.391907  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2867  methyltransferase FkbM family  25.61 
 
 
386 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  hitchhiker  0.00138469 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3254  methyltransferase FkbM family  25.61 
 
 
386 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4304  methyltransferase FkbM family  29.69 
 
 
352 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1312  methyltransferase FkbM family  29.94 
 
 
286 aa  56.6  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2734  methyltransferase FkbM family  27.08 
 
 
265 aa  55.8  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1155  FkbM family methyltransferase  29.15 
 
 
301 aa  55.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0706  FkbM family methyltransferase  26.58 
 
 
280 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0495964 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1459  methyltransferase FkbM family  26.18 
 
 
301 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1793  methyltransferase FkbM  23.26 
 
 
283 aa  54.7  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.628642  normal  0.0129859 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0484  FkbM family methyltransferase  29.86 
 
 
707 aa  54.3  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2405  methyltransferase FkbM  24.47 
 
 
321 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00173159 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1299  methyltransferase FkbM  25.86 
 
 
285 aa  53.5  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.71332  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2430  FkbM family methyltransferase  28.64 
 
 
277 aa  53.1  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4165  FkbM family methyltransferase  22.91 
 
 
278 aa  53.1  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6324  methyltransferase FkbM family  23.98 
 
 
313 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07250  hypothetical protein  28.07 
 
 
284 aa  52.4  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.544273  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0123  methyltransferase FkbM family  29.32 
 
 
374 aa  52  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.785695  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3801  putative methyltransferase FkbM  26.2 
 
 
239 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.403441  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1251  FkbM family methyltransferase  25.29 
 
 
415 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0112173 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2896  FkbM family methyltransferase  26.28 
 
 
287 aa  50.8  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.117356 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03158  putative methyltransferase  24.2 
 
 
266 aa  50.1  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0324771  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1485  FkbM family methyltransferase  28.65 
 
 
376 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.80434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0648  FkbM family methyltransferase  24.46 
 
 
251 aa  49.3  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.716259  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1809  FkbM family methyltransferase  28.8 
 
 
233 aa  49.3  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198862 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2699  methyltransferase FkbM family  23.66 
 
 
266 aa  48.5  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0395  methyltransferase FkbM family  24.12 
 
 
287 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0910  methyltransferase FkbM family  24.89 
 
 
1364 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0386  methyltransferase FkbM family  24.12 
 
 
287 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1470  FkbM family methyltransferase  27.81 
 
 
281 aa  48.5  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.684479  normal  0.1078 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4928  FkbM family methyltransferase  25.31 
 
 
332 aa  48.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.925294  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4981  hypothetical protein  24.18 
 
 
625 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3138  methyltransferase FkbM  28.57 
 
 
657 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5229  FkbM family methyltransferase  28.57 
 
 
657 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102005  normal  0.307803 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14511  SAM-dependent methyltransferase  25.34 
 
 
287 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.559742  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4823  FkbM family methyltransferase  24.26 
 
 
285 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.80826  normal  0.0416972 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5042  FkbM family methyltransferase  28.57 
 
 
657 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266877  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4559  hypothetical protein  23.61 
 
 
319 aa  47  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2165  FkbM family methyltransferase  28.57 
 
 
242 aa  47  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112719  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2528  methyltransferase FkbM  29.24 
 
 
738 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2555  FkbM family methyltransferase  34.58 
 
 
383 aa  47  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1608  methyltransferase FkbM family  28.12 
 
 
365 aa  46.6  0.0005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7105  methyltransferase FkbM family  24.84 
 
 
292 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.233504 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1688  FkbM family methyltransferase  25.35 
 
 
288 aa  46.2  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1127  putative methyltransferase  30.19 
 
 
383 aa  46.2  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2217  methyltransferase FkbM  25.43 
 
 
321 aa  46.2  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  30.52 
 
 
921 aa  46.2  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3697  FkbM family methyltransferase  25.38 
 
 
259 aa  46.2  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.191836  normal  0.775464 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1435  FkbM family methyltransferase  23.94 
 
 
267 aa  46.2  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5961  methyltransferase FkbM family  24.84 
 
 
292 aa  46.2  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0180421 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1424  FkbM family methyltransferase  27.97 
 
 
348 aa  46.2  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312344 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4793  methyltransferase FkbM family  26.82 
 
 
294 aa  46.2  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.018486 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0435  FkbM family methyltransferase  26.47 
 
 
657 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0756  SAM-dependent methyltransferase  35.42 
 
 
275 aa  45.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3293  hypothetical protein  24.57 
 
 
272 aa  45.4  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>