109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03158 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03158  putative methyltransferase  100 
 
 
266 aa  548  1e-155  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0324771  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0747  methyltransferase FkbM  28.22 
 
 
306 aa  92.4  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5205  methyltransferase FkbM family  28.57 
 
 
303 aa  70.5  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3296  methyltransferase FkbM family  35.62 
 
 
323 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4559  hypothetical protein  32.19 
 
 
319 aa  65.5  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2883  methyltransferase FkbM  34.67 
 
 
323 aa  65.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.722379  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4516  FkbM family methyltransferase  31.65 
 
 
277 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2953  methyltransferase FkbM family  27.71 
 
 
271 aa  63.9  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2883  methyltransferase FkbM family  29.1 
 
 
309 aa  64.7  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.241941  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0294  FkbM family methyltransferase  32.63 
 
 
454 aa  63.9  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.314449  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1157  FkbM family methyltransferase  30.99 
 
 
253 aa  63.2  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.231016  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2290  methyltransferase FkbM family  27.27 
 
 
266 aa  62.4  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2576  methyltransferase FkbM  31.52 
 
 
323 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.198474  normal  0.0714467 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2362  methyltransferase FkbM  33.33 
 
 
258 aa  61.2  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0747821 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2165  FkbM family methyltransferase  30 
 
 
242 aa  61.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112719  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0751  methyltransferase FkbM  29.25 
 
 
306 aa  60.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  28 
 
 
792 aa  60.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0234  hypothetical protein  29.74 
 
 
275 aa  59.3  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.160183  normal  0.50681 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3801  putative methyltransferase FkbM  30.9 
 
 
239 aa  58.9  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.403441  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4981  hypothetical protein  28.48 
 
 
625 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2217  methyltransferase FkbM  28.98 
 
 
321 aa  57.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1323  FkbM family methyltransferase  25.27 
 
 
257 aa  57.4  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0619476  hitchhiker  0.000000000782975 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2699  methyltransferase FkbM family  30.18 
 
 
266 aa  57  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1754  FkbM family methyltransferase  30.67 
 
 
488 aa  57  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2162  methyltransferase FkbM family  33.33 
 
 
256 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4793  methyltransferase FkbM family  28.4 
 
 
294 aa  56.2  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.018486 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1894  methyltransferase FkbM  30.97 
 
 
268 aa  55.5  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2142  FkbM family methyltransferase  28.35 
 
 
321 aa  55.8  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0743  FkbM family methyltransferase  29.73 
 
 
661 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.70648  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1174  FkbM family methyltransferase  27.45 
 
 
299 aa  55.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.830745  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1716  FkbM family methyltransferase  33.58 
 
 
274 aa  55.1  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.174023  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4165  FkbM family methyltransferase  29.57 
 
 
278 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1793  methyltransferase FkbM  28.4 
 
 
283 aa  54.3  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.628642  normal  0.0129859 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2405  methyltransferase FkbM  29.88 
 
 
321 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00173159 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12969  hypothetical protein  29.82 
 
 
321 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0254  methyltransferase FkbM  29.95 
 
 
277 aa  53.5  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1687  FkbM family methyltransferase  25.26 
 
 
296 aa  53.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  36 
 
 
7122 aa  53.9  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0295  methyltransferase FkbM  27.57 
 
 
297 aa  53.1  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3712  FkbM family methyltransferase  29.52 
 
 
411 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6950  FkbM family methyltransferase  32.56 
 
 
283 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2734  methyltransferase FkbM family  29.08 
 
 
265 aa  53.1  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  28.26 
 
 
921 aa  53.1  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2361  FkbM family methyltransferase  25.57 
 
 
270 aa  53.1  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000541582  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3254  methyltransferase FkbM family  31.1 
 
 
386 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2867  methyltransferase FkbM family  31.1 
 
 
386 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  hitchhiker  0.00138469 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2673  methyltransferase FkbM family  27.69 
 
 
234 aa  52.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0382849  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4953  methyltransferase FkbM family  27.89 
 
 
276 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2636  RfbT protein  26.85 
 
 
286 aa  52  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1608  methyltransferase FkbM family  24.34 
 
 
365 aa  52  0.000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1518  methyltransferase FkbM  27.78 
 
 
237 aa  52  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3172  methyltransferase FkbM family  27.01 
 
 
295 aa  51.6  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2105  hypothetical protein  31.87 
 
 
235 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.970335  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0352  methyltransferase FkbM family  26.98 
 
 
256 aa  50.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000196185  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7663  methyltransferase FkbM family  29.41 
 
 
283 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1244  methyltransferase FkbM  28.86 
 
 
254 aa  50.4  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1884  methyltransferase FkbM  28.31 
 
 
321 aa  50.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.396027 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3423  FkbM family methyltransferase  24.2 
 
 
314 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0570785 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0706  FkbM family methyltransferase  30.89 
 
 
280 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0495964 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5723  FkbM family methyltransferase  26.16 
 
 
265 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0496638  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1173  methyltransferase FkbM  28.85 
 
 
255 aa  49.7  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.764759  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0756  SAM-dependent methyltransferase  25.31 
 
 
275 aa  49.7  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1879  amino acid adenylation domain-containing protein  32.14 
 
 
2419 aa  49.7  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  24.86 
 
 
723 aa  49.7  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5478  methyltransferase FkbM family  25.93 
 
 
258 aa  49.7  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2360  methyltransferase FkbM  28.87 
 
 
260 aa  49.3  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0204457 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2279  methyltransferase FkbM family  31.11 
 
 
245 aa  49.3  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18943  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4276  methyltransferase FkbM  28.25 
 
 
239 aa  48.9  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00443119  normal  0.49625 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0444  methyltransferase FkbM family  29.6 
 
 
275 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1495  hypothetical protein  28.8 
 
 
318 aa  47.4  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0587292 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6684  putative methyltransferase  28.21 
 
 
256 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4174  methyltransferase FkbM family  26.94 
 
 
385 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0061  FkbM family methyltransferase  31.25 
 
 
259 aa  47  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14511  SAM-dependent methyltransferase  26.45 
 
 
287 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.559742  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07250  hypothetical protein  27.39 
 
 
284 aa  47.4  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.544273  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2076  FkbM family methyltransferase  23.81 
 
 
316 aa  47.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.503081 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0207  methyltransferase FkbM  28.35 
 
 
235 aa  47  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339437  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2091  FkbM family methyltransferase  27.23 
 
 
255 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4024  methyltransferase FkbM family  22.54 
 
 
351 aa  46.2  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4789  methyltransferase FkbM family  26.51 
 
 
268 aa  45.8  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0197254 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14081  hypothetical protein  27.78 
 
 
274 aa  45.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00860845  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0910  methyltransferase FkbM family  24.11 
 
 
1364 aa  45.8  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6312  methyltransferase FkbM family  29.41 
 
 
318 aa  45.4  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1277  hypothetical protein  23.27 
 
 
273 aa  45.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.668612 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1009  amino acid adenylation domain-containing protein  31.75 
 
 
2706 aa  45.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1459  methyltransferase FkbM family  24.64 
 
 
301 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2680  methyltransferase FkbM family  26.2 
 
 
429 aa  45.4  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2059  methyltransferase FkbM family  25.29 
 
 
318 aa  44.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0376  FkbM family methyltransferase  28.37 
 
 
326 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.589969  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0408  methyltransferase FkbM family  28.37 
 
 
313 aa  44.3  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482809 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4199  methyltransferase FkbM family  26.95 
 
 
271 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.228447 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0132  methyltransferase FkbM family  26.42 
 
 
326 aa  43.5  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0864  methyltransferase FkbM family  27.33 
 
 
282 aa  43.5  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1567  FkbM family methyltransferase  28.67 
 
 
283 aa  43.5  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1955  FkbM family methyltransferase  34.07 
 
 
283 aa  43.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00902633 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2093  methyltransferase FkbM  25.82 
 
 
252 aa  43.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0475221  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2342  FkbM family methyltransferase  23.35 
 
 
681 aa  43.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3684  methyltransferase FkbM  25.58 
 
 
262 aa  42.7  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4283  methyltransferase, FkbM family protein  23.9 
 
 
392 aa  42.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2430  FkbM family methyltransferase  23.23 
 
 
277 aa  42.7  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>