62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2217 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2217  methyltransferase FkbM  100 
 
 		 321 aa  659    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1884  methyltransferase FkbM  90.65 
 
 		 321 aa  574  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.396027 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4559  hypothetical protein  71.88 
 
 		 319 aa  489  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2883  methyltransferase FkbM  69.91 
 
 		 323 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.722379  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2405  methyltransferase FkbM  68.85 
 
 		 321 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00173159 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3296  methyltransferase FkbM family  68.03 
 
 		 323 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2576  methyltransferase FkbM  67.4 
 
 		 323 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.198474  normal  0.0714467 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  32.9 
 
 		 792 aa  63.5  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3719  methyltransferase FkbM  30.43 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2953  methyltransferase FkbM family  29.93 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03158  putative methyltransferase  28.98 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0324771  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1754  FkbM family methyltransferase  30.23 
 
 		 488 aa  57  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2142  FkbM family methyltransferase  28.65 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1485  FkbM family methyltransferase  28.03 
 
 		 376 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.80434 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3712  FkbM family methyltransferase  29.74 
 
 		 411 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1174  FkbM family methyltransferase  31.54 
 
 		 299 aa  53.9  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.830745  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2162  methyltransferase FkbM family  28.67 
 
 		 256 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0297  FkbM family methyltransferase  27.04 
 
 		 279 aa  53.5  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1955  FkbM family methyltransferase  35.71 
 
 		 283 aa  53.1  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00902633 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4793  methyltransferase FkbM family  27.87 
 
 		 294 aa  52.8  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.018486 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1716  FkbM family methyltransferase  28.24 
 
 		 274 aa  52  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.174023  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1277  hypothetical protein  26.07 
 
 		 273 aa  52.4  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.668612 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5205  methyltransferase FkbM family  30.07 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2883  methyltransferase FkbM family  33.1 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.241941  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2290  methyltransferase FkbM family  28.12 
 
 		 266 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0864  methyltransferase FkbM family  23.96 
 
 		 282 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0527  FkbM family methyltransferase  29.71 
 
 		 245 aa  50.8  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0352  methyltransferase FkbM family  29.92 
 
 		 256 aa  50.8  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000196185  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4516  FkbM family methyltransferase  26.99 
 
 		 277 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6684  putative methyltransferase  36 
 
 		 256 aa  49.7  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2105  hypothetical protein  29.22 
 
 		 235 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.970335  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4981  hypothetical protein  30.52 
 
 		 625 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3682  FkbM family methyltransferase  25.58 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.391907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0706  FkbM family methyltransferase  29.75 
 
 		 280 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0495964 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0484  FkbM family methyltransferase  32.45 
 
 		 707 aa  47  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1453  FkbM family methyltransferase  24.83 
 
 		 293 aa  46.6  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.214095  hitchhiker  0.000083365 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1567  FkbM family methyltransferase  30.94 
 
 		 283 aa  46.6  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1688  FkbM family methyltransferase  29.81 
 
 		 288 aa  46.6  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3423  FkbM family methyltransferase  25.43 
 
 		 314 aa  46.2  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0570785 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0061  FkbM family methyltransferase  28.04 
 
 		 259 aa  46.2  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1852  methyltransferase FkbM family  28.04 
 
 		 297 aa  46.2  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0453  methyltransferase FkbM family  28.48 
 
 		 250 aa  46.2  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12969  hypothetical protein  30.07 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3254  methyltransferase FkbM family  26.44 
 
 		 386 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2867  methyltransferase FkbM family  26.44 
 
 		 386 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  hitchhiker  0.00138469 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2360  methyltransferase FkbM  26.9 
 
 		 260 aa  45.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0204457 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2279  methyltransferase FkbM family  28.37 
 
 		 245 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4024  methyltransferase FkbM family  30.88 
 
 		 351 aa  45.4  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6312  methyltransferase FkbM family  30.07 
 
 		 318 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0295  methyltransferase FkbM  22.37 
 
 		 297 aa  45.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5478  methyltransferase FkbM family  29.08 
 
 		 258 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7663  methyltransferase FkbM family  28.19 
 
 		 283 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1491  FkbM family methyltransferase  23.08 
 
 		 341 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.20081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2773  FkbM family methyltransferase  28.25 
 
 		 263 aa  43.9  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0444  methyltransferase FkbM family  28.03 
 
 		 275 aa  43.9  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1152  hypothetical protein  29.46 
 
 		 261 aa  43.5  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.609848  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0743  FkbM family methyltransferase  32.94 
 
 		 661 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.70648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0910  methyltransferase FkbM family  28.11 
 
 		 1364 aa  42.7  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0405  FkbM family methyltransferase  27.08 
 
 		 237 aa  42.7  0.009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0658878  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0764  methyltransferase FkbM  29.17 
 
 		 321 aa  42.7  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4783  methyltransferase FkbM  27.72 
 
 		 265 aa  42.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1312  methyltransferase FkbM family  28.05 
 
 		 286 aa  42.4  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>