182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2142 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2142  FkbM family methyltransferase  100 
 
 
321 aa  656    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1687  FkbM family methyltransferase  29.15 
 
 
296 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4793  methyltransferase FkbM family  32.97 
 
 
294 aa  120  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.018486 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1152  hypothetical protein  35.19 
 
 
261 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.609848  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3719  methyltransferase FkbM  39.49 
 
 
288 aa  94  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1955  FkbM family methyltransferase  32.46 
 
 
283 aa  94  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00902633 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7663  methyltransferase FkbM family  34.66 
 
 
283 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2165  FkbM family methyltransferase  36.81 
 
 
242 aa  89.4  9e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112719  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07250  hypothetical protein  24.9 
 
 
284 aa  87  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.544273  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6950  FkbM family methyltransferase  33.52 
 
 
283 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3682  FkbM family methyltransferase  29.13 
 
 
279 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.391907  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0444  methyltransferase FkbM family  33.33 
 
 
275 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0376  FkbM family methyltransferase  31.47 
 
 
326 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.589969  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1567  FkbM family methyltransferase  34.16 
 
 
283 aa  85.1  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1852  methyltransferase FkbM family  37.71 
 
 
297 aa  84.7  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0408  methyltransferase FkbM family  31.44 
 
 
313 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482809 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2162  methyltransferase FkbM family  34.44 
 
 
256 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2894  methyltransferase FkbM  29.45 
 
 
296 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0295  methyltransferase FkbM  36.42 
 
 
297 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2773  FkbM family methyltransferase  30.8 
 
 
263 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1716  FkbM family methyltransferase  37.01 
 
 
274 aa  80.5  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.174023  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1277  hypothetical protein  35.09 
 
 
273 aa  80.1  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.668612 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0706  FkbM family methyltransferase  35.16 
 
 
280 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0495964 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5723  FkbM family methyltransferase  37.72 
 
 
265 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0496638  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2896  FkbM family methyltransferase  31.22 
 
 
287 aa  79.7  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.117356 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4516  FkbM family methyltransferase  32.75 
 
 
277 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3423  FkbM family methyltransferase  29.38 
 
 
314 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0570785 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12969  hypothetical protein  36.16 
 
 
321 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0743  FkbM family methyltransferase  33.11 
 
 
661 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.70648  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4559  hypothetical protein  32.14 
 
 
319 aa  75.9  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5205  methyltransferase FkbM family  28.29 
 
 
303 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2091  FkbM family methyltransferase  37.5 
 
 
255 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0453  methyltransferase FkbM family  30.2 
 
 
250 aa  73.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1312  methyltransferase FkbM family  31.35 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3801  putative methyltransferase FkbM  37.91 
 
 
239 aa  72  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.403441  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1470  FkbM family methyltransferase  31.15 
 
 
281 aa  71.6  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.684479  normal  0.1078 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0395  methyltransferase FkbM family  28.87 
 
 
287 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0352  methyltransferase FkbM family  32.75 
 
 
256 aa  71.6  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000196185  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4165  FkbM family methyltransferase  30.05 
 
 
278 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0386  methyltransferase FkbM family  28.87 
 
 
287 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1754  FkbM family methyltransferase  26.23 
 
 
488 aa  70.1  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2361  FkbM family methyltransferase  32.05 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000541582  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  29.27 
 
 
723 aa  68.9  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3697  FkbM family methyltransferase  34.92 
 
 
259 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.191836  normal  0.775464 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0234  hypothetical protein  35.64 
 
 
275 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.160183  normal  0.50681 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2953  methyltransferase FkbM family  32.05 
 
 
271 aa  67.4  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1251  FkbM family methyltransferase  30.41 
 
 
415 aa  67.4  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0112173 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2405  methyltransferase FkbM  33.15 
 
 
321 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00173159 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2673  methyltransferase FkbM family  31.09 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0382849  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1194  methyltransferase FkbM family  35.37 
 
 
1498 aa  65.9  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.288288 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2362  methyltransferase FkbM  34.39 
 
 
258 aa  65.9  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0747821 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2883  methyltransferase FkbM  31.25 
 
 
323 aa  66.2  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.722379  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0297  FkbM family methyltransferase  33.7 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0294  FkbM family methyltransferase  34.27 
 
 
454 aa  65.5  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.314449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4981  hypothetical protein  28.98 
 
 
625 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0207  methyltransferase FkbM  31.28 
 
 
235 aa  64.3  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339437  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6633  FkbM family methyltransferase  28.87 
 
 
272 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00015631  hitchhiker  0.000119437 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4276  methyltransferase FkbM  35.51 
 
 
239 aa  64.7  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00443119  normal  0.49625 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1244  methyltransferase FkbM  33.76 
 
 
254 aa  64.7  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1325  methyltransferase FkbM family  28.09 
 
 
239 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.624692  normal  0.311227 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2370  methyltransferase FkbM  28.48 
 
 
348 aa  64.3  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.363109  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2699  methyltransferase FkbM family  33.33 
 
 
266 aa  62.8  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0751  methyltransferase FkbM  31.14 
 
 
306 aa  62.8  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0484  FkbM family methyltransferase  34.68 
 
 
707 aa  62.8  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0747  methyltransferase FkbM  28.31 
 
 
306 aa  62.4  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2582  Ata11 protein  27.95 
 
 
255 aa  62  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0553282  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4823  FkbM family methyltransferase  30.22 
 
 
285 aa  62  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.80826  normal  0.0416972 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3296  methyltransferase FkbM family  30.57 
 
 
323 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4024  methyltransferase FkbM family  32.26 
 
 
351 aa  61.6  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1173  methyltransferase FkbM  32.14 
 
 
255 aa  61.2  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.764759  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4064  methyltransferase FkbM  30.57 
 
 
250 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  36.99 
 
 
792 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0764  methyltransferase FkbM  29.53 
 
 
283 aa  61.6  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0124652 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2883  methyltransferase FkbM family  28.89 
 
 
309 aa  61.2  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.241941  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2624  FkbM family methyltransferase  30 
 
 
282 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4283  methyltransferase, FkbM family protein  33.54 
 
 
392 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2734  methyltransferase FkbM family  32.93 
 
 
265 aa  61.2  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4271  methyltransferase FkbM family  32.08 
 
 
268 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0254  methyltransferase FkbM  31.98 
 
 
277 aa  59.7  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3172  methyltransferase FkbM family  28.1 
 
 
295 aa  59.3  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5478  methyltransferase FkbM family  34.32 
 
 
258 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4928  FkbM family methyltransferase  29.11 
 
 
332 aa  57.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.925294  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2360  methyltransferase FkbM  28.02 
 
 
260 aa  58.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0204457 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3712  FkbM family methyltransferase  27.95 
 
 
411 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1459  methyltransferase FkbM family  32.4 
 
 
301 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1688  FkbM family methyltransferase  36 
 
 
288 aa  58.2  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1954  FkbM family methyltransferase  31.45 
 
 
272 aa  58.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0179283 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2576  methyltransferase FkbM  31.43 
 
 
323 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.198474  normal  0.0714467 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3138  methyltransferase FkbM  31.34 
 
 
657 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5229  FkbM family methyltransferase  31.34 
 
 
657 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102005  normal  0.307803 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1155  FkbM family methyltransferase  29.26 
 
 
301 aa  56.6  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4953  methyltransferase FkbM family  27.37 
 
 
276 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1323  FkbM family methyltransferase  29.41 
 
 
257 aa  56.2  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0619476  hitchhiker  0.000000000782975 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3374  FkbM family methyltransferase  28.48 
 
 
284 aa  56.2  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5042  FkbM family methyltransferase  31.5 
 
 
657 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266877  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2217  methyltransferase FkbM  28.65 
 
 
321 aa  55.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1082  methyltransferase FkbM family  29.84 
 
 
262 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0618  hypothetical protein  29.68 
 
 
264 aa  55.8  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.510827 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03158  putative methyltransferase  28.35 
 
 
266 aa  55.8  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0324771  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0764  methyltransferase FkbM  30.12 
 
 
321 aa  54.7  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>