63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2883 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2883  methyltransferase FkbM  100 
 
 		 323 aa  663    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.722379  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2576  methyltransferase FkbM  88.24 
 
 		 323 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.198474  normal  0.0714467 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3296  methyltransferase FkbM family  82.04 
 
 		 323 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2217  methyltransferase FkbM  69.91 
 
 		 321 aa  478  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4559  hypothetical protein  71.97 
 
 		 319 aa  473  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2405  methyltransferase FkbM  70.53 
 
 		 321 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00173159 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1884  methyltransferase FkbM  70.22 
 
 		 321 aa  455  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.396027 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2142  FkbM family methyltransferase  31.25 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03158  putative methyltransferase  34.67 
 
 		 266 aa  65.5  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0324771  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1485  FkbM family methyltransferase  31.06 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.80434 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5205  methyltransferase FkbM family  32.43 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0295  methyltransferase FkbM  30.92 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5478  methyltransferase FkbM family  34.35 
 
 		 258 aa  57  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4793  methyltransferase FkbM family  27.27 
 
 		 294 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.018486 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3719  methyltransferase FkbM  33.75 
 
 		 288 aa  54.3  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1312  methyltransferase FkbM family  30.72 
 
 		 286 aa  54.3  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3682  FkbM family methyltransferase  27.59 
 
 		 279 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.391907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2093  methyltransferase FkbM  29.58 
 
 		 252 aa  53.9  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0475221  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0706  FkbM family methyltransferase  29.94 
 
 		 280 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0495964 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4928  FkbM family methyltransferase  26.17 
 
 		 332 aa  53.1  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.925294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5229  FkbM family methyltransferase  30.22 
 
 		 657 aa  52.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102005  normal  0.307803 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3138  methyltransferase FkbM  30.22 
 
 		 657 aa  52.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5042  FkbM family methyltransferase  30.22 
 
 		 657 aa  52.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0444  methyltransferase FkbM family  27.74 
 
 		 275 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4516  FkbM family methyltransferase  29.52 
 
 		 277 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1716  FkbM family methyltransferase  34.42 
 
 		 274 aa  52  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.174023  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7663  methyltransferase FkbM family  28.11 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2162  methyltransferase FkbM family  28.97 
 
 		 256 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0864  methyltransferase FkbM family  26.82 
 
 		 282 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  32.26 
 
 		 792 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6950  FkbM family methyltransferase  28.66 
 
 		 283 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  24.62 
 
 		 723 aa  50.1  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0435  FkbM family methyltransferase  30.07 
 
 		 657 aa  49.7  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0352  methyltransferase FkbM family  31.25 
 
 		 256 aa  48.5  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000196185  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1491  FkbM family methyltransferase  23.86 
 
 		 341 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.20081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2894  methyltransferase FkbM  26.67 
 
 		 296 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0297  FkbM family methyltransferase  27.27 
 
 		 279 aa  47.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1852  methyltransferase FkbM family  28.31 
 
 		 297 aa  47.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2896  FkbM family methyltransferase  29.75 
 
 		 287 aa  47.4  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.117356 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6312  methyltransferase FkbM family  28.87 
 
 		 318 aa  47  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4981  hypothetical protein  28.07 
 
 		 625 aa  47  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3712  FkbM family methyltransferase  28.72 
 
 		 411 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0751  methyltransferase FkbM  30.81 
 
 		 306 aa  45.8  0.0009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4165  FkbM family methyltransferase  25.89 
 
 		 278 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1174  FkbM family methyltransferase  29.86 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.830745  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1754  FkbM family methyltransferase  25.29 
 
 		 488 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2105  hypothetical protein  28.29 
 
 		 235 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.970335  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1277  hypothetical protein  25.75 
 
 		 273 aa  45.4  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.668612 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1687  FkbM family methyltransferase  27.4 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0408  methyltransferase FkbM family  26.75 
 
 		 313 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482809 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2165  FkbM family methyltransferase  30.67 
 
 		 242 aa  45.8  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0376  FkbM family methyltransferase  26.45 
 
 		 326 aa  45.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.589969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5961  methyltransferase FkbM family  29.63 
 
 		 292 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0180421 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4283  methyltransferase, FkbM family protein  28.67 
 
 		 392 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1567  FkbM family methyltransferase  29.37 
 
 		 283 aa  43.1  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1251  FkbM family methyltransferase  22.91 
 
 		 415 aa  43.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0112173 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3374  FkbM family methyltransferase  25.51 
 
 		 284 aa  43.5  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0910  methyltransferase FkbM family  24.55 
 
 		 1364 aa  43.1  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2953  methyltransferase FkbM family  26.67 
 
 		 271 aa  43.1  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2430  FkbM family methyltransferase  26.35 
 
 		 277 aa  42.7  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1793  methyltransferase FkbM  28.1 
 
 		 283 aa  42.7  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.628642  normal  0.0129859 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6324  methyltransferase FkbM family  25.27 
 
 		 313 aa  42.7  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12969  hypothetical protein  28.67 
 
 		 321 aa  42.4  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>