74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1485 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1485  FkbM family methyltransferase  100 
 
 		 376 aa  767    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.80434 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2845  methyltransferase FkbM  29.53 
 
 		 407 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.853304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4174  methyltransferase FkbM family  28.57 
 
 		 385 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1495  hypothetical protein  32.3 
 
 		 318 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0587292 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2571  methyltransferase FkbM family  22.25 
 
 		 357 aa  109  9.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.278208  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2555  FkbM family methyltransferase  24.02 
 
 		 383 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4179  methyltransferase FkbM family  25.45 
 
 		 397 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1127  putative methyltransferase  25 
 
 		 383 aa  94.7  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2648  methyltransferase FkbM  26.34 
 
 		 408 aa  88.6  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0123  methyltransferase FkbM family  38.94 
 
 		 374 aa  87  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.785695  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3343  FkbM family methyltransferase  24.24 
 
 		 371 aa  82.4  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4283  methyltransferase, FkbM family protein  32.94 
 
 		 392 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00984  methyltransferase, FkbM family protein  30.98 
 
 		 456 aa  79  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06182  methyltransferase, FkbM family protein  30.98 
 
 		 456 aa  79  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.054415  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1423  methyltransferase FkbM family  44 
 
 		 739 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2059  methyltransferase FkbM family  25.93 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2718  FkbM family methyltransferase  30.04 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1321  methyltransferase FkbM family  44.29 
 
 		 741 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.145752  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4304  methyltransferase FkbM family  44.44 
 
 		 352 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2219  methyltransferase FkbM family  34.69 
 
 		 382 aa  66.2  0.0000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2528  methyltransferase FkbM  42.86 
 
 		 738 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2883  methyltransferase FkbM  31.06 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.722379  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3281  methyltransferase  21.49 
 
 		 451 aa  60.5  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136239  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3318  methyltransferase  21.93 
 
 		 451 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3578  methyltransferase  21.93 
 
 		 446 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550916  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3233  SAM-dependent methyltransferase  21.49 
 
 		 451 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3533  putative methyltransferase  21.49 
 
 		 446 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000121197 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1608  methyltransferase FkbM family  24.87 
 
 		 365 aa  58.5  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3296  methyltransferase FkbM family  29.77 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4793  methyltransferase FkbM family  30.46 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.018486 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4559  hypothetical protein  27.85 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2217  methyltransferase FkbM  28.03 
 
 		 321 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5298  FkbM family methyltransferase  29.14 
 
 		 261 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2342  FkbM family methyltransferase  26.09 
 
 		 681 aa  54.3  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1244  methyltransferase FkbM  31.29 
 
 		 254 aa  53.1  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2699  methyltransferase FkbM family  29.63 
 
 		 266 aa  52.4  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1688  FkbM family methyltransferase  29.87 
 
 		 288 aa  51.6  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2362  methyltransferase FkbM  29.5 
 
 		 258 aa  51.6  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747821 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6938  FkbM family methyltransferase  29.83 
 
 		 243 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12969  hypothetical protein  36.21 
 
 		 321 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3423  FkbM family methyltransferase  28.65 
 
 		 314 aa  50.1  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0570785 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2405  methyltransferase FkbM  28.31 
 
 		 321 aa  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00173159 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4981  hypothetical protein  28.36 
 
 		 625 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1567  FkbM family methyltransferase  35.77 
 
 		 283 aa  48.9  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0352  methyltransferase FkbM family  29.63 
 
 		 256 aa  48.5  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000196185  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2576  methyltransferase FkbM  24.73 
 
 		 323 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.198474  normal  0.0714467 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0376  FkbM family methyltransferase  30 
 
 		 326 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.589969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2142  FkbM family methyltransferase  27.14 
 
 		 321 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2760  methyltransferase FkbM family  26.47 
 
 		 264 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  hitchhiker  0.00553627 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1506  hypothetical protein  28.68 
 
 		 319 aa  47  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.332748  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0706  FkbM family methyltransferase  28.8 
 
 		 280 aa  47  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0495964 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0444  methyltransferase FkbM family  29.56 
 
 		 275 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1277  hypothetical protein  30.12 
 
 		 273 aa  46.6  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.668612 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1687  FkbM family methyltransferase  29.13 
 
 		 296 aa  46.6  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0408  methyltransferase FkbM family  30.27 
 
 		 313 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482809 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7663  methyltransferase FkbM family  26.52 
 
 		 283 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2091  FkbM family methyltransferase  35.44 
 
 		 255 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3801  putative methyltransferase FkbM  28.17 
 
 		 239 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.403441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5205  methyltransferase FkbM family  26.03 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4064  methyltransferase FkbM  25.41 
 
 		 250 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2162  methyltransferase FkbM family  28.86 
 
 		 256 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0295  methyltransferase FkbM  24.18 
 
 		 297 aa  45.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2430  FkbM family methyltransferase  28 
 
 		 277 aa  45.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6633  FkbM family methyltransferase  40 
 
 		 272 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00015631  hitchhiker  0.000119437 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2360  methyltransferase FkbM  25.17 
 
 		 260 aa  44.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0204457 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0747  methyltransferase FkbM  38.46 
 
 		 306 aa  44.7  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1884  methyltransferase FkbM  26.35 
 
 		 321 aa  44.3  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.396027 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4199  methyltransferase FkbM family  25.58 
 
 		 271 aa  44.3  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.228447 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2894  methyltransferase FkbM  40 
 
 		 296 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0207  methyltransferase FkbM  31.34 
 
 		 235 aa  43.5  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339437  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1098  FkbM family methyltransferase  59.38 
 
 		 264 aa  43.5  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6950  FkbM family methyltransferase  24.73 
 
 		 283 aa  43.1  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2673  methyltransferase FkbM family  27.75 
 
 		 234 aa  43.1  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0382849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2883  methyltransferase FkbM family  29.79 
 
 		 309 aa  42.7  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.241941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>