77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1174 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1174  FkbM family methyltransferase  100 
 
 		 299 aa  622  1e-177  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.830745  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2699  methyltransferase FkbM family  34.25 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  29.86 
 
 		 792 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07250  hypothetical protein  31.36 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.544273  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2953  methyltransferase FkbM family  27.68 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12969  hypothetical protein  32.29 
 
 		 321 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2760  methyltransferase FkbM family  34.67 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  hitchhiker  0.00553627 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6684  putative methyltransferase  28.09 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2405  methyltransferase FkbM  27.11 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00173159 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5202  FkbM family methyltransferase  32.19 
 
 		 416 aa  55.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.327791  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0295  methyltransferase FkbM  30.41 
 
 		 297 aa  55.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1567  FkbM family methyltransferase  28.99 
 
 		 283 aa  55.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2165  FkbM family methyltransferase  30.34 
 
 		 242 aa  54.3  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03158  putative methyltransferase  27.45 
 
 		 266 aa  55.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0324771  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2894  methyltransferase FkbM  30.28 
 
 		 296 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2217  methyltransferase FkbM  31.54 
 
 		 321 aa  53.9  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1470  FkbM family methyltransferase  27.08 
 
 		 281 aa  53.9  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.684479  normal  0.1078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4559  hypothetical protein  26.36 
 
 		 319 aa  53.5  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4953  methyltransferase FkbM family  27.71 
 
 		 276 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7663  methyltransferase FkbM family  28.36 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1459  methyltransferase FkbM family  27.95 
 
 		 301 aa  51.6  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0706  FkbM family methyltransferase  30.33 
 
 		 280 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0495964 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2142  FkbM family methyltransferase  31.21 
 
 		 321 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5205  methyltransferase FkbM family  29.14 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6950  FkbM family methyltransferase  29.1 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0747  methyltransferase FkbM  27.01 
 
 		 306 aa  50.8  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2290  methyltransferase FkbM family  26.26 
 
 		 266 aa  50.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  27.71 
 
 		 723 aa  50.4  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0132  methyltransferase FkbM family  28.22 
 
 		 326 aa  50.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2370  methyltransferase FkbM  27.46 
 
 		 348 aa  50.1  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.363109  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3296  methyltransferase FkbM family  30.56 
 
 		 323 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0618  hypothetical protein  29.65 
 
 		 264 aa  49.3  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.510827 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4793  methyltransferase FkbM family  31.03 
 
 		 294 aa  49.3  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.018486 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0297  FkbM family methyltransferase  23.67 
 
 		 279 aa  49.3  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3172  methyltransferase FkbM family  25.46 
 
 		 295 aa  49.3  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1884  methyltransferase FkbM  28.12 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.396027 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0444  methyltransferase FkbM family  29.51 
 
 		 275 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0352  methyltransferase FkbM family  25.95 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000196185  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14511  SAM-dependent methyltransferase  29.3 
 
 		 287 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.559742  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4276  methyltransferase FkbM  27.27 
 
 		 239 aa  48.1  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00443119  normal  0.49625 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1495  hypothetical protein  22.16 
 
 		 318 aa  47.4  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0587292 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2896  FkbM family methyltransferase  28.36 
 
 		 287 aa  47.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.117356 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0764  methyltransferase FkbM  29.22 
 
 		 283 aa  47  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0124652 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0408  methyltransferase FkbM family  29.51 
 
 		 313 aa  47  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482809 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1955  FkbM family methyltransferase  29.05 
 
 		 283 aa  46.6  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00902633 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2162  methyltransferase FkbM family  27.27 
 
 		 256 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0376  FkbM family methyltransferase  29.51 
 
 		 326 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.589969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4602  FkbM family methyltransferase  25.7 
 
 		 249 aa  46.6  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0743  FkbM family methyltransferase  23.75 
 
 		 661 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.70648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2362  methyltransferase FkbM  30.41 
 
 		 258 aa  46.2  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747821 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3684  methyltransferase FkbM  30.05 
 
 		 262 aa  46.2  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4516  FkbM family methyltransferase  30 
 
 		 277 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2576  methyltransferase FkbM  26.7 
 
 		 323 aa  45.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.198474  normal  0.0714467 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3682  FkbM family methyltransferase  31.41 
 
 		 279 aa  45.8  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.391907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0061  FkbM family methyltransferase  29.8 
 
 		 259 aa  45.8  0.0009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2883  methyltransferase FkbM  29.86 
 
 		 323 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.722379  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1277  hypothetical protein  26.25 
 
 		 273 aa  45.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.668612 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1421  FkbH like protein  32.31 
 
 		 3811 aa  44.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1917  hypothetical protein  32.2 
 
 		 630 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1906  hypothetical protein  32.76 
 
 		 630 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4165  FkbM family methyltransferase  26.39 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3719  methyltransferase FkbM  25.97 
 
 		 288 aa  43.9  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1716  FkbM family methyltransferase  25.52 
 
 		 274 aa  43.9  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.174023  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0864  methyltransferase FkbM family  25.35 
 
 		 282 aa  43.5  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2059  methyltransferase FkbM family  21.18 
 
 		 318 aa  43.5  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2946  FkbM family methyltransferase  27.97 
 
 		 786 aa  43.5  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50506  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3423  FkbM family methyltransferase  25.38 
 
 		 314 aa  43.5  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0570785 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4174  methyltransferase FkbM family  28.99 
 
 		 385 aa  43.1  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2773  FkbM family methyltransferase  27.17 
 
 		 263 aa  43.1  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2093  methyltransferase FkbM  25.64 
 
 		 252 aa  42.7  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0475221  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  27.1 
 
 		 921 aa  42.7  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0294  FkbM family methyltransferase  27.04 
 
 		 454 aa  42.7  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.314449  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14081  hypothetical protein  26.17 
 
 		 274 aa  42.7  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00860845  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0756  SAM-dependent methyltransferase  28.65 
 
 		 275 aa  42.4  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1312  methyltransferase FkbM family  28.95 
 
 		 286 aa  42.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0234  hypothetical protein  30.14 
 
 		 275 aa  42.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.160183  normal  0.50681 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2886  methyltransferase FkbM  25.32 
 
 		 285 aa  42.4  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>