248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3138 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0435  FkbM family methyltransferase  85.84 
 
 
657 aa  1120    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3138  methyltransferase FkbM  100 
 
 
657 aa  1327    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5042  FkbM family methyltransferase  99.7 
 
 
657 aa  1322    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266877  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5229  FkbM family methyltransferase  100 
 
 
657 aa  1327    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102005  normal  0.307803 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  33.23 
 
 
542 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  33.96 
 
 
592 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1511  TPR domain-containing protein  26.94 
 
 
525 aa  120  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000212111  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  32.33 
 
 
546 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  31.23 
 
 
601 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6633  FkbM family methyltransferase  37.63 
 
 
272 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00015631  hitchhiker  0.000119437 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
472 aa  109  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1219  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.39 
 
 
604 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 
760 aa  107  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
595 aa  107  7e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1869  methyltransferase FkbM family  31.97 
 
 
264 aa  106  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2215  methyltransferase, FkbM family  31.97 
 
 
264 aa  106  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125854  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1098  FkbM family methyltransferase  30.2 
 
 
264 aa  105  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  32.21 
 
 
473 aa  103  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
1450 aa  104  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  33.95 
 
 
1451 aa  103  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  30.53 
 
 
1077 aa  103  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  33.95 
 
 
1454 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  32.61 
 
 
620 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3326  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
607 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  31.66 
 
 
550 aa  102  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  34.2 
 
 
626 aa  101  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  29.26 
 
 
602 aa  101  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7089  hypothetical protein  33.46 
 
 
551 aa  101  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  29.51 
 
 
503 aa  99.4  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 
566 aa  99  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  30.6 
 
 
653 aa  99  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 
653 aa  99  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3682  FkbM family methyltransferase  31.47 
 
 
279 aa  97.8  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.391907  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  31.48 
 
 
1677 aa  97.4  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4783  methyltransferase FkbM  29.1 
 
 
265 aa  97.4  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  35.32 
 
 
614 aa  97.1  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  35.32 
 
 
614 aa  97.1  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  35.32 
 
 
614 aa  97.1  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  35.32 
 
 
614 aa  97.1  9e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  34.33 
 
 
614 aa  97.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  35.32 
 
 
626 aa  97.1  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  35.32 
 
 
626 aa  97.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 
935 aa  97.1  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
556 aa  96.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  32.22 
 
 
1005 aa  96.3  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  30.72 
 
 
703 aa  95.9  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 
484 aa  96.3  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2618  hypothetical protein  25.6 
 
 
630 aa  95.9  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  29.76 
 
 
1038 aa  96.3  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  29.76 
 
 
502 aa  94.7  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  33.45 
 
 
620 aa  95.1  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4165  FkbM family methyltransferase  36.36 
 
 
278 aa  94.7  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7090  hypothetical protein  28.25 
 
 
441 aa  94.4  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  34.97 
 
 
639 aa  94.4  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  30.94 
 
 
457 aa  94  7e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  30.82 
 
 
955 aa  94  9e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  29.78 
 
 
1212 aa  93.2  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
688 aa  92.8  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2766  Tetratricopeptide TPR_4  29.63 
 
 
492 aa  92.4  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392213  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  29.4 
 
 
505 aa  92.4  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 
608 aa  92  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  33.71 
 
 
636 aa  92  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 
612 aa  91.7  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.44 
 
 
1034 aa  90.9  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 
636 aa  90.9  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1856  hypothetical protein  27.91 
 
 
360 aa  89.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  31.75 
 
 
615 aa  90.1  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 
646 aa  89.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 
780 aa  90.1  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1212  hypothetical protein  28.03 
 
 
385 aa  89.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  28.97 
 
 
502 aa  89.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 
3145 aa  89.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 
502 aa  89.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  32.85 
 
 
529 aa  89  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4127  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 
655 aa  88.6  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248641  normal  0.206732 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1361  hypothetical protein  29.52 
 
 
499 aa  89  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.995153  normal  0.533699 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.27 
 
 
689 aa  88.2  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1251  FkbM family methyltransferase  31.15 
 
 
262 aa  88.2  5e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000622553  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  30.04 
 
 
387 aa  87.4  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  27.5 
 
 
1764 aa  87.4  8e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  30.74 
 
 
767 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  31 
 
 
714 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 
611 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0045  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 
451 aa  85.5  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717523  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1568  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 
487 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  28.52 
 
 
438 aa  85.5  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  29.05 
 
 
723 aa  85.1  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  30.04 
 
 
747 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 
635 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 
635 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 
412 aa  84  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  31.32 
 
 
649 aa  84.3  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  31.32 
 
 
649 aa  84.3  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.87 
 
 
454 aa  83.2  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5295  hypothetical protein  33.16 
 
 
266 aa  82.8  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.090256 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  30.82 
 
 
546 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  32.96 
 
 
637 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3430  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.3 
 
 
512 aa  81.6  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  24.23 
 
 
603 aa  81.6  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  29.04 
 
 
574 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>