137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4516 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_4516  FkbM family methyltransferase  100 
 
 
277 aa  569  1e-161  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5723  FkbM family methyltransferase  46.69 
 
 
265 aa  233  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0496638  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2734  methyltransferase FkbM family  41.38 
 
 
265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4165  FkbM family methyltransferase  36.14 
 
 
278 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2162  methyltransferase FkbM family  30.45 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2142  FkbM family methyltransferase  32.75 
 
 
321 aa  79.7  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1277  hypothetical protein  37.41 
 
 
273 aa  77.4  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.668612 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2883  methyltransferase FkbM family  37.11 
 
 
309 aa  76.3  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.241941  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0254  methyltransferase FkbM  28.4 
 
 
277 aa  75.1  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2773  FkbM family methyltransferase  28.48 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0295  methyltransferase FkbM  33.54 
 
 
297 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2673  methyltransferase FkbM family  31.21 
 
 
234 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0382849  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1323  FkbM family methyltransferase  31.58 
 
 
257 aa  70.5  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0619476  hitchhiker  0.000000000782975 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12969  hypothetical protein  29.63 
 
 
321 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4793  methyltransferase FkbM family  29.65 
 
 
294 aa  70.1  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.018486 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4981  hypothetical protein  28.18 
 
 
625 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3697  FkbM family methyltransferase  38.46 
 
 
259 aa  68.9  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.191836  normal  0.775464 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2582  Ata11 protein  27.65 
 
 
255 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0553282  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0207  methyltransferase FkbM  31.11 
 
 
235 aa  68.2  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339437  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2894  methyltransferase FkbM  28.32 
 
 
296 aa  66.2  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4953  methyltransferase FkbM family  31.29 
 
 
276 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1470  FkbM family methyltransferase  32.78 
 
 
281 aa  65.9  0.0000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.684479  normal  0.1078 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2953  methyltransferase FkbM family  38.35 
 
 
271 aa  65.9  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  31.4 
 
 
792 aa  64.7  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5205  methyltransferase FkbM family  30.38 
 
 
303 aa  64.7  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1687  FkbM family methyltransferase  30.15 
 
 
296 aa  65.1  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0352  methyltransferase FkbM family  30.3 
 
 
256 aa  65.1  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000196185  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03158  putative methyltransferase  31.65 
 
 
266 aa  64.7  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0324771  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4024  methyltransferase FkbM family  28.31 
 
 
351 aa  64.3  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0618  hypothetical protein  29.73 
 
 
264 aa  63.9  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.510827 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2165  FkbM family methyltransferase  27.61 
 
 
242 aa  63.5  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112719  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1688  FkbM family methyltransferase  32.1 
 
 
288 aa  63.5  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1716  FkbM family methyltransferase  32.67 
 
 
274 aa  61.6  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.174023  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1852  methyltransferase FkbM family  32.65 
 
 
297 aa  61.6  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3423  FkbM family methyltransferase  28.57 
 
 
314 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0570785 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1152  hypothetical protein  34.48 
 
 
261 aa  60.1  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.609848  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1567  FkbM family methyltransferase  28.08 
 
 
283 aa  59.7  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1954  FkbM family methyltransferase  30 
 
 
272 aa  58.9  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0179283 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0764  methyltransferase FkbM  28.3 
 
 
283 aa  58.2  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0124652 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1244  methyltransferase FkbM  29.45 
 
 
254 aa  58.5  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07250  hypothetical protein  27.33 
 
 
284 aa  58.5  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.544273  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3801  putative methyltransferase FkbM  31.72 
 
 
239 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.403441  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5298  FkbM family methyltransferase  31.08 
 
 
261 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0484  FkbM family methyltransferase  33.1 
 
 
707 aa  57.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2896  FkbM family methyltransferase  30.94 
 
 
287 aa  57.4  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.117356 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5961  methyltransferase FkbM family  28.31 
 
 
292 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0180421 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2290  methyltransferase FkbM family  29.67 
 
 
266 aa  57  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  28.66 
 
 
723 aa  56.6  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7105  methyltransferase FkbM family  28.31 
 
 
292 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.233504 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3296  methyltransferase FkbM family  31.93 
 
 
323 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45058  predicted protein  32.89 
 
 
404 aa  55.8  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1251  FkbM family methyltransferase  27.83 
 
 
415 aa  55.8  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0112173 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1955  FkbM family methyltransferase  34.17 
 
 
283 aa  55.8  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00902633 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5202  FkbM family methyltransferase  29.68 
 
 
416 aa  55.8  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.327791  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3719  methyltransferase FkbM  35.81 
 
 
288 aa  55.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2362  methyltransferase FkbM  25.77 
 
 
258 aa  55.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0747821 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0297  FkbM family methyltransferase  29.18 
 
 
279 aa  55.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1459  methyltransferase FkbM family  32.39 
 
 
301 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4276  methyltransferase FkbM  32.48 
 
 
239 aa  54.3  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00443119  normal  0.49625 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0376  FkbM family methyltransferase  31.43 
 
 
326 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.589969  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0408  methyltransferase FkbM family  31.43 
 
 
313 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482809 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2105  hypothetical protein  26.94 
 
 
235 aa  53.5  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.970335  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2076  FkbM family methyltransferase  31.49 
 
 
316 aa  53.9  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.503081 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0747  methyltransferase FkbM  26 
 
 
306 aa  53.5  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4304  methyltransferase FkbM family  30.54 
 
 
352 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2430  FkbM family methyltransferase  29.45 
 
 
277 aa  53.1  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2091  FkbM family methyltransferase  30.39 
 
 
255 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3172  methyltransferase FkbM family  30.94 
 
 
295 aa  53.1  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1155  FkbM family methyltransferase  26.25 
 
 
301 aa  52.8  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0959  FkbM family methyltransferase  31.11 
 
 
257 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801487  normal  0.774702 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2699  methyltransferase FkbM family  30.53 
 
 
266 aa  52  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3281  methyltransferase  29.79 
 
 
451 aa  51.6  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136239  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2370  methyltransferase FkbM  28.57 
 
 
348 aa  52  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.363109  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0942  methyltransferase FkbM  31.11 
 
 
287 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0159897  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1754  FkbM family methyltransferase  27.91 
 
 
488 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3533  putative methyltransferase  29.79 
 
 
446 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000121197 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3233  SAM-dependent methyltransferase  29.79 
 
 
451 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2883  methyltransferase FkbM  29.52 
 
 
323 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.722379  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2624  FkbM family methyltransferase  29.33 
 
 
282 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6324  methyltransferase FkbM family  28.51 
 
 
313 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0444  methyltransferase FkbM family  31.21 
 
 
275 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2236  methyltransferase FkbM  28.3 
 
 
274 aa  50.4  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3318  methyltransferase  29.08 
 
 
451 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3578  methyltransferase  29.08 
 
 
446 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550916  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2217  methyltransferase FkbM  26.99 
 
 
321 aa  50.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7663  methyltransferase FkbM family  31.33 
 
 
283 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2886  methyltransferase FkbM  29.08 
 
 
285 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3138  methyltransferase FkbM  28.65 
 
 
657 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5229  FkbM family methyltransferase  28.65 
 
 
657 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102005  normal  0.307803 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4559  hypothetical protein  29.17 
 
 
319 aa  49.7  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4602  FkbM family methyltransferase  30.77 
 
 
249 aa  49.7  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5042  FkbM family methyltransferase  28.65 
 
 
657 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266877  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1793  methyltransferase FkbM  23.11 
 
 
283 aa  49.3  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.628642  normal  0.0129859 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0527  FkbM family methyltransferase  26.97 
 
 
245 aa  49.3  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3684  methyltransferase FkbM  29.08 
 
 
262 aa  49.3  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1173  methyltransferase FkbM  30.88 
 
 
255 aa  49.3  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.764759  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0764  methyltransferase FkbM  23.13 
 
 
321 aa  48.5  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5478  methyltransferase FkbM family  30.43 
 
 
258 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0386  methyltransferase FkbM family  25.43 
 
 
287 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2405  methyltransferase FkbM  30.72 
 
 
321 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00173159 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>