128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2093 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2093  methyltransferase FkbM  100 
 
 		 252 aa  520  1e-146  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0475221  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2290  methyltransferase FkbM family  47.26 
 
 		 266 aa  205  7e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2886  methyltransferase FkbM  35.11 
 
 		 285 aa  126  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1435  FkbM family methyltransferase  30.83 
 
 		 267 aa  95.1  9e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3684  methyltransferase FkbM  34.57 
 
 		 262 aa  85.9  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14511  SAM-dependent methyltransferase  29.83 
 
 		 287 aa  85.9  6e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.559742  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14081  hypothetical protein  31 
 
 		 274 aa  85.5  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00860845  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5478  methyltransferase FkbM family  32.72 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4793  methyltransferase FkbM family  31.11 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.018486 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2279  methyltransferase FkbM family  30.25 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0959  FkbM family methyltransferase  26.44 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801487  normal  0.774702 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0295  methyltransferase FkbM  32.28 
 
 		 297 aa  67  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0942  methyltransferase FkbM  26.44 
 
 		 287 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0159897  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34840  putative non-ribosomal peptide synthetase  33.12 
 
 		 2125 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12969  hypothetical protein  37.68 
 
 		 321 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2894  methyltransferase FkbM  28.14 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1157  FkbM family methyltransferase  30.6 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.231016  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  28.98 
 
 		 7122 aa  60.1  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5205  methyltransferase FkbM family  31.08 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2370  methyltransferase FkbM  30.3 
 
 		 348 aa  58.9  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.363109  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1687  FkbM family methyltransferase  29.55 
 
 		 296 aa  58.5  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1173  methyltransferase FkbM  24.08 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.764759  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3138  methyltransferase FkbM  35.92 
 
 		 657 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5229  FkbM family methyltransferase  35.92 
 
 		 657 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102005  normal  0.307803 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11547  hypothetical protein  30.52 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5042  FkbM family methyltransferase  35.92 
 
 		 657 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1754  FkbM family methyltransferase  28.3 
 
 		 488 aa  57  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3697  FkbM family methyltransferase  36.05 
 
 		 259 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.191836  normal  0.775464 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2773  FkbM family methyltransferase  28.7 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2883  methyltransferase FkbM  29.58 
 
 		 323 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.722379  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0294  FkbM family methyltransferase  30.6 
 
 		 454 aa  53.9  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.314449  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1954  FkbM family methyltransferase  32.89 
 
 		 272 aa  54.7  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0179283 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0706  FkbM family methyltransferase  32.64 
 
 		 280 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0495964 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1183  methyltransferase FkbM family  28.12 
 
 		 861 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2142  FkbM family methyltransferase  32.37 
 
 		 321 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6950  FkbM family methyltransferase  30.08 
 
 		 283 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1251  FkbM family methyltransferase  25.25 
 
 		 415 aa  53.1  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0112173 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2951  methyltransferase FkbM family  25.31 
 
 		 829 aa  52.8  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2760  methyltransferase FkbM family  29.05 
 
 		 264 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  hitchhiker  0.00553627 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3719  methyltransferase FkbM  28.1 
 
 		 288 aa  52.4  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1459  methyltransferase FkbM family  31.54 
 
 		 301 aa  52.4  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2076  FkbM family methyltransferase  26.29 
 
 		 316 aa  52.4  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.503081 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3071  amino acid adenylation domain protein  29.81 
 
 		 3291 aa  52  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1894  methyltransferase FkbM  29.66 
 
 		 268 aa  52  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2699  methyltransferase FkbM family  26.71 
 
 		 266 aa  51.2  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2105  hypothetical protein  28.49 
 
 		 235 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.970335  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1688  FkbM family methyltransferase  28.26 
 
 		 288 aa  52  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1608  methyltransferase FkbM family  27.66 
 
 		 365 aa  51.6  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0435  FkbM family methyltransferase  33.09 
 
 		 657 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0123  methyltransferase FkbM family  30.5 
 
 		 374 aa  51.2  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.785695  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1312  methyltransferase FkbM family  26.67 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0324  FkbM family methyltransferase  24.21 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256046  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0444  methyltransferase FkbM family  29.37 
 
 		 275 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3172  methyltransferase FkbM family  26.01 
 
 		 295 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4024  methyltransferase FkbM family  29.94 
 
 		 351 aa  51.2  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2734  methyltransferase FkbM family  31.52 
 
 		 265 aa  50.8  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4276  methyltransferase FkbM  33.56 
 
 		 239 aa  50.4  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00443119  normal  0.49625 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12970  hypothetical protein  30.26 
 
 		 243 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2095  methyltransferase FkbM  27.91 
 
 		 242 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0764  methyltransferase FkbM  26.35 
 
 		 283 aa  49.7  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0124652 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4304  methyltransferase FkbM family  29.93 
 
 		 352 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  30.08 
 
 		 921 aa  49.7  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3883  FkbM family methyltransferase  31.08 
 
 		 228 aa  49.7  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.242767  normal  0.0192927 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2883  methyltransferase FkbM family  29.09 
 
 		 309 aa  49.7  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.241941  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1152  hypothetical protein  30.3 
 
 		 261 aa  49.3  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.609848  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1852  methyltransferase FkbM family  28.66 
 
 		 297 aa  49.3  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0382  FkbM family methyltransferase  29.69 
 
 		 242 aa  48.9  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3682  FkbM family methyltransferase  26.46 
 
 		 279 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.391907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4928  FkbM family methyltransferase  26.42 
 
 		 332 aa  48.9  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.925294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6684  putative methyltransferase  32.39 
 
 		 256 aa  48.5  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2896  FkbM family methyltransferase  31.76 
 
 		 287 aa  48.5  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.117356 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  27.66 
 
 		 723 aa  48.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2115  methyltransferase FkbM family  28.42 
 
 		 333 aa  48.5  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1917  hypothetical protein  34.94 
 
 		 630 aa  47.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1906  hypothetical protein  34.94 
 
 		 630 aa  47.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0376  FkbM family methyltransferase  29.37 
 
 		 326 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.589969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3296  methyltransferase FkbM family  29.08 
 
 		 323 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3721  methyltransferase FkbM family  26.55 
 
 		 279 aa  47.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0408  methyltransferase FkbM family  29.37 
 
 		 313 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482809 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0254  methyltransferase FkbM  32 
 
 		 277 aa  47  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4250  methyltransferase FkbM  27.39 
 
 		 256 aa  47  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.155825 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2091  FkbM family methyltransferase  30 
 
 		 255 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4165  FkbM family methyltransferase  28.17 
 
 		 278 aa  46.6  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4516  FkbM family methyltransferase  25.59 
 
 		 277 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1325  methyltransferase FkbM family  28.22 
 
 		 239 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.624692  normal  0.311227 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5723  FkbM family methyltransferase  32.95 
 
 		 265 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0496638  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1518  methyltransferase FkbM  27.39 
 
 		 237 aa  45.8  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2405  methyltransferase FkbM  26.09 
 
 		 321 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00173159 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1421  FkbH like protein  27.22 
 
 		 3811 aa  45.8  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2430  FkbM family methyltransferase  25.9 
 
 		 277 aa  45.8  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0751  methyltransferase FkbM  27.61 
 
 		 306 aa  45.4  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3028  methyltransferase FkbM  31.37 
 
 		 260 aa  45.4  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0453  methyltransferase FkbM family  29.19 
 
 		 250 aa  45.4  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0061  FkbM family methyltransferase  26.85 
 
 		 259 aa  45.4  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7663  methyltransferase FkbM family  27.64 
 
 		 283 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1423  methyltransferase FkbM family  57.89 
 
 		 739 aa  45.4  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1321  methyltransferase FkbM family  57.89 
 
 		 741 aa  45.4  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.145752  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1323  FkbM family methyltransferase  28.47 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0619476  hitchhiker  0.000000000782975 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2165  FkbM family methyltransferase  27.34 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2162  methyltransferase FkbM family  27.01 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>