76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2576 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2576  methyltransferase FkbM  100 
 
 		 323 aa  661    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.198474  normal  0.0714467 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2883  methyltransferase FkbM  88.24 
 
 		 323 aa  587  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.722379  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3296  methyltransferase FkbM family  81.42 
 
 		 323 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2217  methyltransferase FkbM  67.4 
 
 		 321 aa  464  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2405  methyltransferase FkbM  69.91 
 
 		 321 aa  461  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00173159 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4559  hypothetical protein  69.43 
 
 		 319 aa  460  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1884  methyltransferase FkbM  68.65 
 
 		 321 aa  449  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.396027 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03158  putative methyltransferase  32.61 
 
 		 266 aa  72  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0324771  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2142  FkbM family methyltransferase  31.43 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  32.26 
 
 		 792 aa  60.5  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0295  methyltransferase FkbM  30.26 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0706  FkbM family methyltransferase  30.19 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0495964 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7663  methyltransferase FkbM family  29.95 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6950  FkbM family methyltransferase  27 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5205  methyltransferase FkbM family  30.46 
 
 		 303 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1312  methyltransferase FkbM family  28.83 
 
 		 286 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1485  FkbM family methyltransferase  25.7 
 
 		 376 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.80434 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4928  FkbM family methyltransferase  24.69 
 
 		 332 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.925294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2105  hypothetical protein  30 
 
 		 235 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.970335  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4793  methyltransferase FkbM family  26.11 
 
 		 294 aa  54.3  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.018486 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3682  FkbM family methyltransferase  25.33 
 
 		 279 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.391907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2953  methyltransferase FkbM family  29.93 
 
 		 271 aa  53.1  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1716  FkbM family methyltransferase  34.19 
 
 		 274 aa  52  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.174023  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3719  methyltransferase FkbM  33.12 
 
 		 288 aa  52  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2162  methyltransferase FkbM family  26.35 
 
 		 256 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1754  FkbM family methyltransferase  26.29 
 
 		 488 aa  50.4  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5478  methyltransferase FkbM family  32.06 
 
 		 258 aa  50.4  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1491  FkbM family methyltransferase  23.68 
 
 		 341 aa  50.1  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.20081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0444  methyltransferase FkbM family  27.39 
 
 		 275 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12969  hypothetical protein  29.88 
 
 		 321 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6684  putative methyltransferase  33.33 
 
 		 256 aa  50.1  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3712  FkbM family methyltransferase  29.23 
 
 		 411 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0435  FkbM family methyltransferase  28.66 
 
 		 657 aa  49.7  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5042  FkbM family methyltransferase  28.03 
 
 		 657 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0352  methyltransferase FkbM family  28.35 
 
 		 256 aa  49.7  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000196185  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5229  FkbM family methyltransferase  28.03 
 
 		 657 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102005  normal  0.307803 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3138  methyltransferase FkbM  28.03 
 
 		 657 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0910  methyltransferase FkbM family  27.78 
 
 		 1364 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0864  methyltransferase FkbM family  26.09 
 
 		 282 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2093  methyltransferase FkbM  28.17 
 
 		 252 aa  48.9  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0475221  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2894  methyltransferase FkbM  26.04 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4981  hypothetical protein  28.65 
 
 		 625 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0297  FkbM family methyltransferase  25.6 
 
 		 279 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1174  FkbM family methyltransferase  26.96 
 
 		 299 aa  47.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.830745  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6312  methyltransferase FkbM family  28.17 
 
 		 318 aa  47.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0376  FkbM family methyltransferase  26.42 
 
 		 326 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.589969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4283  methyltransferase, FkbM family protein  27.31 
 
 		 392 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0408  methyltransferase FkbM family  26.42 
 
 		 313 aa  47  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482809 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4165  FkbM family methyltransferase  26.9 
 
 		 278 aa  47  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2430  FkbM family methyltransferase  25 
 
 		 277 aa  47  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2896  FkbM family methyltransferase  30.43 
 
 		 287 aa  46.2  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.117356 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4516  FkbM family methyltransferase  30.72 
 
 		 277 aa  45.8  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0747  methyltransferase FkbM  24.55 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0743  FkbM family methyltransferase  24.87 
 
 		 661 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.70648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1687  FkbM family methyltransferase  25.69 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0061  FkbM family methyltransferase  32.41 
 
 		 259 aa  45.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1955  FkbM family methyltransferase  33.59 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00902633 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2370  methyltransferase FkbM  30.57 
 
 		 348 aa  45.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.363109  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5298  FkbM family methyltransferase  34.36 
 
 		 261 aa  44.3  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3423  FkbM family methyltransferase  25.42 
 
 		 314 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0570785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3374  FkbM family methyltransferase  25 
 
 		 284 aa  43.9  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0751  methyltransferase FkbM  31.85 
 
 		 306 aa  43.5  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2673  methyltransferase FkbM family  26.32 
 
 		 234 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0382849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2290  methyltransferase FkbM family  24.65 
 
 		 266 aa  43.5  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4783  methyltransferase FkbM  28.63 
 
 		 265 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  25 
 
 		 723 aa  43.5  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2076  FkbM family methyltransferase  29.34 
 
 		 316 aa  43.1  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.503081 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4276  methyltransferase FkbM  30.05 
 
 		 239 aa  43.1  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00443119  normal  0.49625 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2165  FkbM family methyltransferase  28.29 
 
 		 242 aa  43.1  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3000  FkbM family methyltransferase  27.36 
 
 		 288 aa  42.7  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.22275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5961  methyltransferase FkbM family  29.63 
 
 		 292 aa  42.7  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0180421 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11547  hypothetical protein  27.74 
 
 		 243 aa  42.7  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0618  FkbM family methyltransferase  25.55 
 
 		 232 aa  42.7  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1098  FkbM family methyltransferase  25.29 
 
 		 264 aa  42.4  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4250  methyltransferase FkbM  28.36 
 
 		 256 aa  42.4  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.155825 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1173  methyltransferase FkbM  27.98 
 
 		 255 aa  42.4  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.764759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>