146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2370 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_2370  methyltransferase FkbM  100 
 
 
348 aa  726    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.363109  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0295  methyltransferase FkbM  33.91 
 
 
297 aa  100  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4981  hypothetical protein  30.17 
 
 
625 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1323  FkbM family methyltransferase  31.82 
 
 
257 aa  90.5  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0619476  hitchhiker  0.000000000782975 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2894  methyltransferase FkbM  32.04 
 
 
296 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2883  methyltransferase FkbM family  34.15 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.241941  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1608  methyltransferase FkbM family  42.19 
 
 
365 aa  80.9  0.00000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5205  methyltransferase FkbM family  29.76 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3423  FkbM family methyltransferase  28.19 
 
 
314 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0570785 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0764  methyltransferase FkbM  28.73 
 
 
283 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0124652 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2867  methyltransferase FkbM family  30.51 
 
 
386 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  hitchhiker  0.00138469 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1754  FkbM family methyltransferase  27.94 
 
 
488 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3254  methyltransferase FkbM family  30.51 
 
 
386 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0395  methyltransferase FkbM family  29.72 
 
 
287 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0386  methyltransferase FkbM family  29.72 
 
 
287 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6324  methyltransferase FkbM family  33.14 
 
 
313 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2362  methyltransferase FkbM  29.44 
 
 
258 aa  69.3  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0747821 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0743  FkbM family methyltransferase  26.76 
 
 
661 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.70648  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4304  methyltransferase FkbM family  31.68 
 
 
352 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2624  FkbM family methyltransferase  30.94 
 
 
282 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0297  FkbM family methyltransferase  28.44 
 
 
279 aa  67.4  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3172  methyltransferase FkbM family  25.33 
 
 
295 aa  67.8  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1470  FkbM family methyltransferase  32.48 
 
 
281 aa  67  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.684479  normal  0.1078 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4823  FkbM family methyltransferase  29.14 
 
 
285 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.80826  normal  0.0416972 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1567  FkbM family methyltransferase  25.6 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2773  FkbM family methyltransferase  26.59 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07250  hypothetical protein  26.19 
 
 
284 aa  65.9  0.0000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.544273  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0747  methyltransferase FkbM  26.36 
 
 
306 aa  65.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0453  methyltransferase FkbM family  27.04 
 
 
250 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0444  methyltransferase FkbM family  30.95 
 
 
275 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1173  methyltransferase FkbM  31.48 
 
 
255 aa  64.7  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.764759  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4165  FkbM family methyltransferase  26.53 
 
 
278 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4024  methyltransferase FkbM family  28.12 
 
 
351 aa  64.3  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2142  FkbM family methyltransferase  28.48 
 
 
321 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1244  methyltransferase FkbM  28.65 
 
 
254 aa  63.9  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0484  FkbM family methyltransferase  30.29 
 
 
707 aa  63.9  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2165  FkbM family methyltransferase  30.27 
 
 
242 aa  63.5  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112719  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3318  methyltransferase  30.64 
 
 
451 aa  62.8  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3684  methyltransferase FkbM  27.01 
 
 
262 aa  62.8  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3578  methyltransferase  30.64 
 
 
446 aa  62.8  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550916  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5478  methyltransferase FkbM family  27.59 
 
 
258 aa  62.8  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1852  methyltransferase FkbM family  24.69 
 
 
297 aa  62  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3281  methyltransferase  30.64 
 
 
451 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136239  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3233  SAM-dependent methyltransferase  30.64 
 
 
451 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3533  putative methyltransferase  30.64 
 
 
446 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000121197 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0756  SAM-dependent methyltransferase  25.9 
 
 
275 aa  62.8  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0123  methyltransferase FkbM family  31.41 
 
 
374 aa  62  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.785695  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12969  hypothetical protein  30.54 
 
 
321 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2673  methyltransferase FkbM family  29.89 
 
 
234 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0382849  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4953  methyltransferase FkbM family  32.35 
 
 
276 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  27.92 
 
 
792 aa  60.1  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2219  methyltransferase FkbM family  33.55 
 
 
382 aa  60.5  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0706  FkbM family methyltransferase  26.99 
 
 
280 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0495964 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0435  FkbM family methyltransferase  28.33 
 
 
657 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0408  methyltransferase FkbM family  29.76 
 
 
313 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0376  FkbM family methyltransferase  29.76 
 
 
326 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.589969  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2162  methyltransferase FkbM family  25.6 
 
 
256 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2093  methyltransferase FkbM  30.3 
 
 
252 aa  58.9  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0475221  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3374  FkbM family methyltransferase  27.59 
 
 
284 aa  58.9  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4276  methyltransferase FkbM  28.76 
 
 
239 aa  58.5  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00443119  normal  0.49625 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2734  methyltransferase FkbM family  27.42 
 
 
265 aa  57.8  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  27.61 
 
 
723 aa  57.8  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1955  FkbM family methyltransferase  26.09 
 
 
283 aa  57  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00902633 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2076  FkbM family methyltransferase  28.49 
 
 
316 aa  57  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.503081 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5723  FkbM family methyltransferase  29.76 
 
 
265 aa  57  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0496638  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3138  methyltransferase FkbM  27.06 
 
 
657 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5229  FkbM family methyltransferase  27.06 
 
 
657 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102005  normal  0.307803 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5042  FkbM family methyltransferase  27.06 
 
 
657 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266877  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0352  methyltransferase FkbM family  26.88 
 
 
256 aa  56.2  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000196185  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3682  FkbM family methyltransferase  28 
 
 
279 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.391907  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4793  methyltransferase FkbM family  24.16 
 
 
294 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.018486 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2844  methyltransferase FkbM  28.51 
 
 
312 aa  55.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2360  methyltransferase FkbM  24.51 
 
 
260 aa  54.7  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0204457 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6950  FkbM family methyltransferase  27.63 
 
 
283 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2896  FkbM family methyltransferase  28.99 
 
 
287 aa  54.7  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.117356 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2059  methyltransferase FkbM family  26.9 
 
 
318 aa  55.1  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4283  methyltransferase, FkbM family protein  24.38 
 
 
392 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3719  methyltransferase FkbM  30.82 
 
 
288 aa  53.9  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5202  FkbM family methyltransferase  25.17 
 
 
416 aa  53.9  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.327791  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2279  methyltransferase FkbM family  27.27 
 
 
245 aa  53.9  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18943  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14511  SAM-dependent methyltransferase  29.68 
 
 
287 aa  53.5  0.000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.559742  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7663  methyltransferase FkbM family  30.52 
 
 
283 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2680  methyltransferase FkbM family  25.18 
 
 
429 aa  53.5  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1251  FkbM family methyltransferase  28.49 
 
 
262 aa  53.1  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000622553  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2528  methyltransferase FkbM  30.19 
 
 
738 aa  52.8  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2215  methyltransferase, FkbM family  28.92 
 
 
264 aa  52.8  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125854  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1869  methyltransferase FkbM family  28.92 
 
 
264 aa  52.8  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2886  methyltransferase FkbM  29.45 
 
 
285 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4783  methyltransferase FkbM  32.69 
 
 
265 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1251  FkbM family methyltransferase  26.71 
 
 
415 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0112173 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1687  FkbM family methyltransferase  27.69 
 
 
296 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2760  methyltransferase FkbM family  25.17 
 
 
264 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  hitchhiker  0.00553627 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4516  FkbM family methyltransferase  28.57 
 
 
277 aa  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5295  hypothetical protein  28.19 
 
 
266 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.090256 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0648  FkbM family methyltransferase  26.06 
 
 
251 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.716259  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6633  FkbM family methyltransferase  31.17 
 
 
272 aa  50.1  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00015631  hitchhiker  0.000119437 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1174  FkbM family methyltransferase  27.46 
 
 
299 aa  50.1  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.830745  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2953  methyltransferase FkbM family  27.82 
 
 
271 aa  49.7  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4928  FkbM family methyltransferase  23.66 
 
 
332 aa  49.7  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.925294  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14081  hypothetical protein  26.87 
 
 
274 aa  49.7  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00860845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>