83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5295 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5295  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  548  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.090256 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4783  methyltransferase FkbM  55.38 
 
 
265 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1869  methyltransferase FkbM family  53.08 
 
 
264 aa  279  3e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2215  methyltransferase, FkbM family  53.08 
 
 
264 aa  279  3e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125854  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1098  FkbM family methyltransferase  51.15 
 
 
264 aa  277  1e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6633  FkbM family methyltransferase  51.69 
 
 
272 aa  277  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00015631  hitchhiker  0.000119437 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1251  FkbM family methyltransferase  50 
 
 
262 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000622553  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  33.99 
 
 
723 aa  87.8  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5229  FkbM family methyltransferase  33.16 
 
 
657 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102005  normal  0.307803 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3138  methyltransferase FkbM  33.16 
 
 
657 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5042  FkbM family methyltransferase  33.16 
 
 
657 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266877  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0435  FkbM family methyltransferase  31.65 
 
 
657 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4165  FkbM family methyltransferase  26.44 
 
 
278 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3682  FkbM family methyltransferase  30.51 
 
 
279 aa  75.5  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.391907  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1251  FkbM family methyltransferase  29.03 
 
 
415 aa  70.5  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0112173 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0297  FkbM family methyltransferase  34.8 
 
 
279 aa  67  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2883  methyltransferase FkbM family  29.24 
 
 
309 aa  64.7  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.241941  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5205  methyltransferase FkbM family  27.62 
 
 
303 aa  63.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3254  methyltransferase FkbM family  27.31 
 
 
386 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2867  methyltransferase FkbM family  27.31 
 
 
386 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  hitchhiker  0.00138469 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1608  methyltransferase FkbM family  28.75 
 
 
365 aa  58.9  0.00000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2894  methyltransferase FkbM  25.82 
 
 
296 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0295  methyltransferase FkbM  31.36 
 
 
297 aa  57.4  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2360  methyltransferase FkbM  26.4 
 
 
260 aa  56.6  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0204457 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0743  FkbM family methyltransferase  26.69 
 
 
661 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.70648  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1244  methyltransferase FkbM  29.26 
 
 
254 aa  56.6  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1194  methyltransferase FkbM family  28.06 
 
 
1498 aa  55.8  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.288288 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0395  methyltransferase FkbM family  27.89 
 
 
287 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2624  FkbM family methyltransferase  30.2 
 
 
282 aa  55.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0386  methyltransferase FkbM family  27.89 
 
 
287 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0764  methyltransferase FkbM  28.35 
 
 
283 aa  53.9  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0124652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12969  hypothetical protein  25.31 
 
 
321 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3719  methyltransferase FkbM  28.66 
 
 
288 aa  52.8  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3712  FkbM family methyltransferase  28.57 
 
 
411 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4981  hypothetical protein  24.71 
 
 
625 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2430  FkbM family methyltransferase  40.78 
 
 
277 aa  52.8  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1955  FkbM family methyltransferase  29.03 
 
 
283 aa  52.4  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00902633 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7663  methyltransferase FkbM family  32.23 
 
 
283 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2362  methyltransferase FkbM  24.19 
 
 
258 aa  51.6  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0747821 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5723  FkbM family methyltransferase  28.71 
 
 
265 aa  52  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0496638  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2091  FkbM family methyltransferase  31.01 
 
 
255 aa  52  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1754  FkbM family methyltransferase  27.23 
 
 
488 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2370  methyltransferase FkbM  28.19 
 
 
348 aa  51.2  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.363109  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2773  FkbM family methyltransferase  29.17 
 
 
263 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1836  methyltransferase FkbM family  26.52 
 
 
1673 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0352  methyltransferase FkbM family  27.98 
 
 
256 aa  51.2  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000196185  normal  0.401562 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2699  methyltransferase FkbM family  26.32 
 
 
266 aa  50.4  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3697  FkbM family methyltransferase  30.2 
 
 
259 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.191836  normal  0.775464 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0294  FkbM family methyltransferase  28.66 
 
 
454 aa  50.4  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.314449  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2734  methyltransferase FkbM family  28.9 
 
 
265 aa  50.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1852  methyltransferase FkbM family  29.19 
 
 
297 aa  50.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4024  methyltransferase FkbM family  26.59 
 
 
351 aa  49.7  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2162  methyltransferase FkbM family  22.27 
 
 
256 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2142  FkbM family methyltransferase  30.68 
 
 
321 aa  49.3  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0408  methyltransferase FkbM family  28.92 
 
 
313 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0376  FkbM family methyltransferase  28.92 
 
 
326 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.589969  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6950  FkbM family methyltransferase  34.16 
 
 
283 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0444  methyltransferase FkbM family  27.8 
 
 
275 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0123  methyltransferase FkbM family  26.92 
 
 
374 aa  48.5  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.785695  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1173  methyltransferase FkbM  28.74 
 
 
255 aa  48.5  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.764759  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2528  methyltransferase FkbM  29.12 
 
 
738 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1299  methyltransferase FkbM  26.39 
 
 
285 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.71332  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4823  FkbM family methyltransferase  28.99 
 
 
285 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.80826  normal  0.0416972 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4928  FkbM family methyltransferase  26.84 
 
 
332 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.925294  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3801  putative methyltransferase FkbM  26.09 
 
 
239 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.403441  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3172  methyltransferase FkbM family  27.39 
 
 
295 aa  47.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0207  methyltransferase FkbM  28.18 
 
 
235 aa  47  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339437  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3028  methyltransferase FkbM  26.71 
 
 
260 aa  46.6  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1423  methyltransferase FkbM family  29.28 
 
 
739 aa  45.8  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6324  methyltransferase FkbM family  28.42 
 
 
313 aa  45.4  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0706  FkbM family methyltransferase  31.22 
 
 
280 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0495964 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1321  methyltransferase FkbM family  29.78 
 
 
741 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.145752  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0747  methyltransferase FkbM  22.63 
 
 
306 aa  45.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2896  FkbM family methyltransferase  30 
 
 
287 aa  45.4  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.117356 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2673  methyltransferase FkbM family  27.18 
 
 
234 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0382849  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0751  methyltransferase FkbM  28.73 
 
 
306 aa  44.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1323  FkbM family methyltransferase  32.98 
 
 
257 aa  44.3  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0619476  hitchhiker  0.000000000782975 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5298  FkbM family methyltransferase  28.95 
 
 
261 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1127  putative methyltransferase  44.44 
 
 
383 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2405  methyltransferase FkbM  28.5 
 
 
321 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00173159 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2582  Ata11 protein  27.22 
 
 
255 aa  43.5  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0553282  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4304  methyltransferase FkbM family  26.62 
 
 
352 aa  43.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5202  FkbM family methyltransferase  27.21 
 
 
416 aa  43.1  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.327791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>