54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0648 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0648  FkbM family methyltransferase  100 
 
 
251 aa  511  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.716259  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4064  methyltransferase FkbM  66.4 
 
 
250 aa  348  6e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2582  Ata11 protein  35.76 
 
 
255 aa  89  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0553282  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0207  methyltransferase FkbM  33.53 
 
 
235 aa  72.8  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339437  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2091  FkbM family methyltransferase  35.62 
 
 
255 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5205  methyltransferase FkbM family  33.33 
 
 
303 aa  61.6  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0751  methyltransferase FkbM  27.16 
 
 
306 aa  62  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3801  putative methyltransferase FkbM  30.22 
 
 
239 aa  55.8  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.403441  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2430  FkbM family methyltransferase  30.72 
 
 
277 aa  55.5  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1954  FkbM family methyltransferase  30.16 
 
 
272 aa  55.5  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0179283 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4276  methyltransferase FkbM  32.61 
 
 
239 aa  54.7  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00443119  normal  0.49625 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1793  methyltransferase FkbM  25.42 
 
 
283 aa  55.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.628642  normal  0.0129859 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2673  methyltransferase FkbM family  29.19 
 
 
234 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0382849  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2886  methyltransferase FkbM  25.81 
 
 
285 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0295  methyltransferase FkbM  30.49 
 
 
297 aa  54.7  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3684  methyltransferase FkbM  30.15 
 
 
262 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1435  FkbM family methyltransferase  27.36 
 
 
267 aa  53.5  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2370  methyltransferase FkbM  27.27 
 
 
348 aa  53.9  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.363109  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2142  FkbM family methyltransferase  28.93 
 
 
321 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2165  FkbM family methyltransferase  33.1 
 
 
242 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112719  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3682  FkbM family methyltransferase  28.77 
 
 
279 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.391907  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2279  methyltransferase FkbM family  30.87 
 
 
245 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18943  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3423  FkbM family methyltransferase  25 
 
 
314 aa  49.3  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0570785 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0324  FkbM family methyltransferase  26.52 
 
 
256 aa  48.9  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256046  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2624  FkbM family methyltransferase  27.23 
 
 
282 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2105  hypothetical protein  31.51 
 
 
235 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.970335  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0942  methyltransferase FkbM  30.34 
 
 
287 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0159897  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0959  FkbM family methyltransferase  30.34 
 
 
257 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801487  normal  0.774702 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0756  SAM-dependent methyltransferase  25.75 
 
 
275 aa  47.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2750  methyltransferase FkbM  25.93 
 
 
263 aa  47.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4165  FkbM family methyltransferase  27.39 
 
 
278 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1299  methyltransferase FkbM  35.71 
 
 
285 aa  47  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.71332  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4928  FkbM family methyltransferase  28.95 
 
 
332 aa  46.6  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.925294  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1082  methyltransferase FkbM family  31.55 
 
 
262 aa  46.2  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1567  FkbM family methyltransferase  24.83 
 
 
283 aa  45.8  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4024  methyltransferase FkbM family  35.85 
 
 
351 aa  45.4  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2636  RfbT protein  23.89 
 
 
286 aa  44.7  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3719  methyltransferase FkbM  29.94 
 
 
288 aa  45.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0294  FkbM family methyltransferase  31.61 
 
 
454 aa  44.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.314449  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0747  methyltransferase FkbM  22.44 
 
 
306 aa  43.9  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5478  methyltransferase FkbM family  30.66 
 
 
258 aa  43.5  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4516  FkbM family methyltransferase  25.14 
 
 
277 aa  43.9  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2773  FkbM family methyltransferase  29.41 
 
 
263 aa  43.5  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2555  FkbM family methyltransferase  27.41 
 
 
383 aa  43.9  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1703  hypothetical protein  31.29 
 
 
459 aa  43.1  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1632  FkbM family methyltransferase  31.29 
 
 
456 aa  43.1  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.973104  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5723  FkbM family methyltransferase  26.51 
 
 
265 aa  43.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0496638  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2342  FkbM family methyltransferase  27.08 
 
 
681 aa  42.7  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6312  methyltransferase FkbM family  29.77 
 
 
318 aa  42.7  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1323  FkbM family methyltransferase  25 
 
 
257 aa  42.7  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0619476  hitchhiker  0.000000000782975 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7663  methyltransferase FkbM family  32.61 
 
 
283 aa  42.4  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0444  methyltransferase FkbM family  31.88 
 
 
275 aa  42  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1485  FkbM family methyltransferase  43.75 
 
 
376 aa  42  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.80434 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4981  hypothetical protein  29.31 
 
 
625 aa  42  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>