93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1435 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1435  FkbM family methyltransferase  100 
 
 
267 aa  554  1e-157  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2886  methyltransferase FkbM  34.1 
 
 
285 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2093  methyltransferase FkbM  30.83 
 
 
252 aa  95.1  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0475221  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2290  methyltransferase FkbM family  28.68 
 
 
266 aa  84  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3684  methyltransferase FkbM  32.03 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0295  methyltransferase FkbM  31.71 
 
 
297 aa  73.2  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  33.77 
 
 
921 aa  71.2  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14081  hypothetical protein  27.18 
 
 
274 aa  68.9  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00860845  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5478  methyltransferase FkbM family  31.34 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2582  Ata11 protein  31.61 
 
 
255 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0553282  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1183  methyltransferase FkbM family  29.15 
 
 
861 aa  60.1  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1009  amino acid adenylation domain-containing protein  26.16 
 
 
2706 aa  58.9  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3719  methyltransferase FkbM  33.33 
 
 
288 aa  58.5  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2105  hypothetical protein  32.24 
 
 
235 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.970335  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3883  FkbM family methyltransferase  27.96 
 
 
228 aa  56.6  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.242767  normal  0.0192927 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2430  FkbM family methyltransferase  25.64 
 
 
277 aa  57  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2883  methyltransferase FkbM family  30.26 
 
 
309 aa  56.2  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.241941  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0207  methyltransferase FkbM  29.53 
 
 
235 aa  55.8  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339437  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1906  hypothetical protein  28.49 
 
 
630 aa  54.7  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  25.39 
 
 
7122 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1567  FkbM family methyltransferase  29.28 
 
 
283 aa  54.3  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1852  methyltransferase FkbM family  25.64 
 
 
297 aa  54.3  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1173  methyltransferase FkbM  25.27 
 
 
255 aa  54.3  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.764759  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2894  methyltransferase FkbM  23.78 
 
 
296 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4024  methyltransferase FkbM family  25.12 
 
 
351 aa  53.1  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1917  hypothetical protein  27.96 
 
 
630 aa  53.1  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1325  methyltransferase FkbM family  29.03 
 
 
239 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.624692  normal  0.311227 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2091  FkbM family methyltransferase  25.84 
 
 
255 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4276  methyltransferase FkbM  28.12 
 
 
239 aa  52.4  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00443119  normal  0.49625 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2750  methyltransferase FkbM  30.12 
 
 
263 aa  52  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1323  FkbM family methyltransferase  26.81 
 
 
257 aa  52  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0619476  hitchhiker  0.000000000782975 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1470  FkbM family methyltransferase  28.04 
 
 
281 aa  52  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.684479  normal  0.1078 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3682  FkbM family methyltransferase  25.89 
 
 
279 aa  52  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.391907  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1754  FkbM family methyltransferase  22.73 
 
 
488 aa  50.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1687  FkbM family methyltransferase  27.5 
 
 
296 aa  50.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11547  hypothetical protein  33.11 
 
 
243 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3361  methyltransferase FkbM family  30.82 
 
 
312 aa  49.7  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000091762  normal  0.0310728 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2076  FkbM family methyltransferase  29.24 
 
 
316 aa  49.7  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.503081 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4064  methyltransferase FkbM  26.9 
 
 
250 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3035  methyltransferase FkbM  29.82 
 
 
235 aa  49.3  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3712  FkbM family methyltransferase  25 
 
 
411 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2896  FkbM family methyltransferase  27.92 
 
 
287 aa  49.3  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.117356 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7663  methyltransferase FkbM family  27.44 
 
 
283 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5723  FkbM family methyltransferase  30.22 
 
 
265 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0496638  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0444  methyltransferase FkbM family  26.67 
 
 
275 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0648  FkbM family methyltransferase  26.87 
 
 
251 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.716259  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2162  methyltransferase FkbM family  25.48 
 
 
256 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2169  FkbM family methyltransferase  25.58 
 
 
485 aa  48.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0869424 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1399  methyltransferase FkbM family protein  26.98 
 
 
294 aa  48.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4793  methyltransferase FkbM family  26.64 
 
 
294 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.018486 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2279  methyltransferase FkbM family  26.17 
 
 
245 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18943  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12970  hypothetical protein  30.87 
 
 
243 aa  47  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2342  FkbM family methyltransferase  25.37 
 
 
681 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0697  FkbM family methyltransferase  26.71 
 
 
217 aa  47.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286744  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1459  methyltransferase FkbM family  28.8 
 
 
301 aa  47  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2059  methyltransferase FkbM family  27.61 
 
 
318 aa  47  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1608  methyltransferase FkbM family  24.06 
 
 
365 aa  46.6  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3423  FkbM family methyltransferase  23.94 
 
 
314 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0570785 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4554  FkbM family methyltransferase  27.67 
 
 
263 aa  46.2  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.02089  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0764  methyltransferase FkbM  26.97 
 
 
283 aa  45.8  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0124652 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1157  FkbM family methyltransferase  32.16 
 
 
253 aa  45.4  0.0009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.231016  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4981  hypothetical protein  25.17 
 
 
625 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4762  FkbM family methyltransferase  30.4 
 
 
243 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175794  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0324  FkbM family methyltransferase  25.7 
 
 
256 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256046  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1082  methyltransferase FkbM family  25.29 
 
 
262 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4451  methyltransferase FkbM family  28.33 
 
 
306 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0344893  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1518  methyltransferase FkbM  28.57 
 
 
237 aa  44.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14511  SAM-dependent methyltransferase  22.73 
 
 
287 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.559742  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0376  FkbM family methyltransferase  30.23 
 
 
326 aa  44.3  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.589969  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0408  methyltransferase FkbM family  30.23 
 
 
313 aa  44.3  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482809 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2773  FkbM family methyltransferase  28.3 
 
 
263 aa  43.9  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2699  methyltransferase FkbM family  27.48 
 
 
266 aa  43.9  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6950  FkbM family methyltransferase  28.06 
 
 
283 aa  43.5  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2571  methyltransferase FkbM family  24.03 
 
 
357 aa  43.5  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.278208  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34840  putative non-ribosomal peptide synthetase  27.27 
 
 
2125 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297864  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2142  FkbM family methyltransferase  26.48 
 
 
321 aa  43.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5202  FkbM family methyltransferase  24.24 
 
 
416 aa  42.7  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.327791  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0743  FkbM family methyltransferase  26.89 
 
 
661 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.70648  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  26.24 
 
 
792 aa  42.7  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3172  methyltransferase FkbM family  24.5 
 
 
295 aa  42.7  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4516  FkbM family methyltransferase  27.78 
 
 
277 aa  42.7  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3801  putative methyltransferase FkbM  25.89 
 
 
239 aa  42.7  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.403441  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0123  methyltransferase FkbM family  25.9 
 
 
374 aa  42.7  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.785695  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0254  methyltransferase FkbM  24.37 
 
 
277 aa  42.7  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0294  FkbM family methyltransferase  24.25 
 
 
454 aa  42.4  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.314449  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4304  methyltransferase FkbM family  25.93 
 
 
352 aa  42.7  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1954  FkbM family methyltransferase  25.57 
 
 
272 aa  42.7  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0179283 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1174  FkbM family methyltransferase  23.22 
 
 
299 aa  42  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.830745  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0405  FkbM family methyltransferase  32.79 
 
 
237 aa  42.4  0.009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0658878  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1716  FkbM family methyltransferase  28.67 
 
 
274 aa  42  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.174023  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2219  methyltransferase FkbM family  26.39 
 
 
382 aa  42  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2115  methyltransferase FkbM family  32.05 
 
 
333 aa  42  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4928  FkbM family methyltransferase  23.86 
 
 
332 aa  42  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.925294  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>