30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4451 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4451  methyltransferase FkbM family  100 
 
 		 306 aa  618  1e-176  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0344893  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3813  methyltransferase FkbM  81.4 
 
 		 310 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.931416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0352  methyltransferase FkbM family  28.57 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000196185  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2162  methyltransferase FkbM family  34.68 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2894  methyltransferase FkbM  27.53 
 
 		 296 aa  53.1  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4981  hypothetical protein  30.71 
 
 		 625 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45058  predicted protein  29.79 
 
 		 404 aa  49.7  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0273  methyltransferase FkbM family  30.23 
 
 		 278 aa  49.3  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1716  FkbM family methyltransferase  30.51 
 
 		 274 aa  48.5  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.174023  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3697  FkbM family methyltransferase  31.15 
 
 		 259 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.191836  normal  0.775464 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12969  hypothetical protein  31.25 
 
 		 321 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0764  methyltransferase FkbM  31.93 
 
 		 283 aa  48.1  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0124652 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2142  FkbM family methyltransferase  26.45 
 
 		 321 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1954  FkbM family methyltransferase  30.65 
 
 		 272 aa  47  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0179283 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4516  FkbM family methyltransferase  31.45 
 
 		 277 aa  47  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0263  methyltransferase FkbM family  30.43 
 
 		 261 aa  46.6  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5205  methyltransferase FkbM family  29.51 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1894  methyltransferase FkbM  31.29 
 
 		 268 aa  45.8  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3000  FkbM family methyltransferase  27.87 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.22275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3035  methyltransferase FkbM  32.14 
 
 		 235 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2361  FkbM family methyltransferase  31.82 
 
 		 270 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000541582  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1435  FkbM family methyltransferase  28.33 
 
 		 267 aa  44.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1688  FkbM family methyltransferase  28.65 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2165  FkbM family methyltransferase  27.81 
 
 		 242 aa  44.3  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4024  methyltransferase FkbM family  28.68 
 
 		 351 aa  44.3  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1737  Methyltransferase-16, putative  33.87 
 
 		 246 aa  43.5  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.762946 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5723  FkbM family methyltransferase  30.66 
 
 		 265 aa  43.1  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0496638  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4789  methyltransferase FkbM family  22.51 
 
 		 268 aa  42.7  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0197254 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5961  methyltransferase FkbM family  32.53 
 
 		 292 aa  42.7  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0180421 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4165  FkbM family methyltransferase  27.87 
 
 		 278 aa  42.4  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>