118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3697 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3697  FkbM family methyltransferase  100 
 
 
259 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.191836  normal  0.775464 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2673  methyltransferase FkbM family  51.57 
 
 
234 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0382849  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0254  methyltransferase FkbM  46.07 
 
 
277 aa  152  4e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4953  methyltransferase FkbM family  33.01 
 
 
276 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1954  FkbM family methyltransferase  37.37 
 
 
272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0179283 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0207  methyltransferase FkbM  35.24 
 
 
235 aa  91.3  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339437  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5298  FkbM family methyltransferase  39.64 
 
 
261 aa  86.7  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2734  methyltransferase FkbM family  36.99 
 
 
265 aa  85.9  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2883  methyltransferase FkbM family  33.64 
 
 
309 aa  76.3  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.241941  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5723  FkbM family methyltransferase  33.82 
 
 
265 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0496638  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12969  hypothetical protein  35.22 
 
 
321 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2142  FkbM family methyltransferase  34.92 
 
 
321 aa  69.3  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4516  FkbM family methyltransferase  38.46 
 
 
277 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5205  methyltransferase FkbM family  30.88 
 
 
303 aa  68.6  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2750  methyltransferase FkbM  28.63 
 
 
263 aa  67.8  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3682  FkbM family methyltransferase  28.45 
 
 
279 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.391907  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2773  FkbM family methyltransferase  29.57 
 
 
263 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1869  methyltransferase FkbM family  28.51 
 
 
264 aa  65.9  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2215  methyltransferase, FkbM family  28.51 
 
 
264 aa  65.9  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125854  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4165  FkbM family methyltransferase  33.75 
 
 
278 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2430  FkbM family methyltransferase  30.96 
 
 
277 aa  64.7  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2165  FkbM family methyltransferase  33.93 
 
 
242 aa  63.9  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112719  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1194  methyltransferase FkbM family  35.92 
 
 
1498 aa  62  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.288288 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1244  methyltransferase FkbM  30.53 
 
 
254 aa  61.6  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0756  SAM-dependent methyltransferase  25.43 
 
 
275 aa  61.6  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0764  methyltransferase FkbM  29.71 
 
 
283 aa  60.1  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0124652 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2091  FkbM family methyltransferase  36.99 
 
 
255 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0295  methyltransferase FkbM  34.25 
 
 
297 aa  58.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1852  methyltransferase FkbM family  32.34 
 
 
297 aa  58.5  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3994  methyltransferase FkbM  29.35 
 
 
256 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  32.4 
 
 
792 aa  57.4  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2290  methyltransferase FkbM family  27.67 
 
 
266 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2093  methyltransferase FkbM  35.14 
 
 
252 aa  57  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0475221  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3801  putative methyltransferase FkbM  32.74 
 
 
239 aa  57  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.403441  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3712  FkbM family methyltransferase  27.8 
 
 
411 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2894  methyltransferase FkbM  25.15 
 
 
296 aa  55.8  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3719  methyltransferase FkbM  33.33 
 
 
288 aa  55.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0747  methyltransferase FkbM  23.04 
 
 
306 aa  54.7  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0297  FkbM family methyltransferase  32.67 
 
 
279 aa  54.7  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1459  methyltransferase FkbM family  33.33 
 
 
301 aa  53.9  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2076  FkbM family methyltransferase  29.78 
 
 
316 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.503081 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4928  FkbM family methyltransferase  25.42 
 
 
332 aa  53.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.925294  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3374  FkbM family methyltransferase  27.78 
 
 
284 aa  53.1  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2953  methyltransferase FkbM family  36.09 
 
 
271 aa  52.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  23.48 
 
 
723 aa  52.8  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4276  methyltransferase FkbM  30.68 
 
 
239 aa  51.2  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00443119  normal  0.49625 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2624  FkbM family methyltransferase  30.77 
 
 
282 aa  52  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5295  hypothetical protein  30.2 
 
 
266 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.090256 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1608  methyltransferase FkbM family  26.7 
 
 
365 aa  51.6  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0352  methyltransferase FkbM family  28.42 
 
 
256 aa  51.6  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000196185  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0453  methyltransferase FkbM family  25.79 
 
 
250 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07250  hypothetical protein  24.26 
 
 
284 aa  50.8  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.544273  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0044  methyltransferase FkbM family  27.49 
 
 
278 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.170743  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1323  FkbM family methyltransferase  29.65 
 
 
257 aa  51.2  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0619476  hitchhiker  0.000000000782975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0046  methyltransferase FkbM family  27.49 
 
 
278 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2370  methyltransferase FkbM  27.08 
 
 
348 aa  50.4  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.363109  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1955  FkbM family methyltransferase  29.91 
 
 
283 aa  50.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00902633 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2162  methyltransferase FkbM family  26.29 
 
 
256 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4783  methyltransferase FkbM  28.33 
 
 
265 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1716  FkbM family methyltransferase  25.22 
 
 
274 aa  50.1  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.174023  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0263  methyltransferase FkbM family  34.68 
 
 
261 aa  50.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0386  methyltransferase FkbM family  26.96 
 
 
287 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0395  methyltransferase FkbM family  26.96 
 
 
287 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4451  methyltransferase FkbM family  31.15 
 
 
306 aa  48.9  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0344893  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1155  FkbM family methyltransferase  28.57 
 
 
301 aa  48.9  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6633  FkbM family methyltransferase  30 
 
 
272 aa  48.9  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00015631  hitchhiker  0.000119437 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4793  methyltransferase FkbM family  30.84 
 
 
294 aa  48.9  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.018486 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2699  methyltransferase FkbM family  28.24 
 
 
266 aa  48.5  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1173  methyltransferase FkbM  28.9 
 
 
255 aa  48.1  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.764759  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1251  FkbM family methyltransferase  26.35 
 
 
415 aa  48.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0112173 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1567  FkbM family methyltransferase  26.39 
 
 
283 aa  47.4  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1423  methyltransferase FkbM family  34.59 
 
 
739 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3813  methyltransferase FkbM  31.85 
 
 
310 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.931416  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1321  methyltransferase FkbM family  35.76 
 
 
741 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.145752  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4064  methyltransferase FkbM  32.37 
 
 
250 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0310  methyltransferase FkbM  31.95 
 
 
244 aa  46.6  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3423  FkbM family methyltransferase  25.38 
 
 
314 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0570785 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2867  methyltransferase FkbM family  27.93 
 
 
386 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  hitchhiker  0.00138469 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3883  FkbM family methyltransferase  30.99 
 
 
228 aa  45.8  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.242767  normal  0.0192927 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3254  methyltransferase FkbM family  27.93 
 
 
386 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3028  methyltransferase FkbM  28.19 
 
 
260 aa  45.4  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6950  FkbM family methyltransferase  30.38 
 
 
283 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1795  methyltransferase FkbM  27.52 
 
 
254 aa  45.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.62261  normal  0.0138427 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1299  methyltransferase FkbM  29.73 
 
 
285 aa  44.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.71332  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14081  hypothetical protein  26.97 
 
 
274 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00860845  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1251  FkbM family methyltransferase  25.32 
 
 
262 aa  44.7  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000622553  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4024  methyltransferase FkbM family  24.2 
 
 
351 aa  45.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1157  FkbM family methyltransferase  26.23 
 
 
253 aa  44.3  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.231016  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2528  methyltransferase FkbM  45.31 
 
 
738 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0751  methyltransferase FkbM  26.77 
 
 
306 aa  44.3  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2236  methyltransferase FkbM  28.02 
 
 
274 aa  44.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2362  methyltransferase FkbM  30.39 
 
 
258 aa  44.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0747821 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3138  methyltransferase FkbM  29.73 
 
 
657 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5229  FkbM family methyltransferase  29.73 
 
 
657 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102005  normal  0.307803 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5042  FkbM family methyltransferase  29.73 
 
 
657 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266877  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1160  methyltransferase FkbM family  31.85 
 
 
879 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.080922  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4304  methyltransferase FkbM family  29.38 
 
 
352 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3684  methyltransferase FkbM  24.81 
 
 
262 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1277  hypothetical protein  24.84 
 
 
273 aa  43.9  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.668612 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2645  FkbM family methyltransferase  30.39 
 
 
256 aa  43.5  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00977905 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>