30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1160 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_1160  methyltransferase FkbM family  100 
 
 
879 aa  1778    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.080922  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1328  methyltransferase FkbM family protein  37.47 
 
 
785 aa  434  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2964  methyltransferase, FkbM family domain protein  65.13 
 
 
249 aa  325  3e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2577  methyltransferase FkbM family  65.13 
 
 
249 aa  325  3e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.40457  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0229  FkbM family methyltransferase  48.51 
 
 
320 aa  306  1.0000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2942  FkbM family methyltransferase  42.93 
 
 
477 aa  297  6e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.342102  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1703  hypothetical protein  39.01 
 
 
459 aa  283  8.000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1632  FkbM family methyltransferase  55.65 
 
 
456 aa  280  1e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.973104  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0759  methyltransferase FkbM family  49.08 
 
 
444 aa  274  6e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1730  methyltransferase FkbM  39.31 
 
 
342 aa  233  1e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  39.94 
 
 
1644 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  39.94 
 
 
1644 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0307  methyltransferase FkbM  49.12 
 
 
271 aa  213  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000376535  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0748  FkbM family methyltransferase  47.35 
 
 
447 aa  208  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4282  methyltransferase FkbM  48 
 
 
409 aa  207  7e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6938  FkbM family methyltransferase  49.52 
 
 
243 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04490  hypothetical protein  42.22 
 
 
265 aa  174  9e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210415  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00730  methyltransferase, FkbM family  44.64 
 
 
314 aa  173  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.614397  normal  0.455624 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0743  methyltransferase FkbM family  31.89 
 
 
219 aa  95.1  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522267  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2284  hypothetical protein  30.54 
 
 
231 aa  83.2  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0555539  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1795  methyltransferase FkbM  30.22 
 
 
254 aa  72.8  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.62261  normal  0.0138427 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2368  hypothetical protein  43.06 
 
 
249 aa  68.9  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148296 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3994  methyltransferase FkbM  30 
 
 
256 aa  64.7  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2575  ABC-2 type transporter  37.35 
 
 
377 aa  58.5  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2965  hypothetical protein  27.55 
 
 
213 aa  55.5  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2578  hypothetical protein  37.35 
 
 
213 aa  55.5  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.447522  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3754  FkbM family methyltransferase  26.47 
 
 
569 aa  50.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3354  hypothetical protein  26.81 
 
 
238 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.96457  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03270  conserved hypothetical protein  27.64 
 
 
1572 aa  45.1  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.630468  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07250  hypothetical protein  29.63 
 
 
284 aa  45.4  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.544273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>