70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3994 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3994  methyltransferase FkbM  100 
 
 
256 aa  526  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1795  methyltransferase FkbM  31.6 
 
 
254 aa  119  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.62261  normal  0.0138427 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6938  FkbM family methyltransferase  34.83 
 
 
243 aa  92  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04490  hypothetical protein  37.06 
 
 
265 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210415  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0307  methyltransferase FkbM  33.33 
 
 
271 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000376535  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4282  methyltransferase FkbM  31.55 
 
 
409 aa  89.7  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2942  FkbM family methyltransferase  30.81 
 
 
477 aa  89.4  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.342102  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0229  FkbM family methyltransferase  30.43 
 
 
320 aa  87.4  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00730  methyltransferase, FkbM family  30.45 
 
 
314 aa  87.4  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.614397  normal  0.455624 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1730  methyltransferase FkbM  31.63 
 
 
342 aa  85.9  7e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0759  methyltransferase FkbM family  33.72 
 
 
444 aa  80.5  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1632  FkbM family methyltransferase  35.29 
 
 
456 aa  79.7  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.973104  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1328  methyltransferase FkbM family protein  30 
 
 
785 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1703  hypothetical protein  34.71 
 
 
459 aa  78.6  0.00000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2964  methyltransferase, FkbM family domain protein  29.65 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2577  methyltransferase FkbM family  29.65 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.40457  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1043  methyltransferase FkbM  32 
 
 
234 aa  74.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00348419  hitchhiker  0.00514259 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0748  FkbM family methyltransferase  30.59 
 
 
447 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  27.73 
 
 
1644 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  27.73 
 
 
1644 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2284  hypothetical protein  28.86 
 
 
231 aa  70.1  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0555539  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1497  hypothetical protein  24.14 
 
 
241 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0111137  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13911  hypothetical protein  28.41 
 
 
264 aa  68.6  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0046  methyltransferase FkbM family  23.69 
 
 
278 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0743  methyltransferase FkbM family  29.19 
 
 
219 aa  66.6  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522267  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0044  methyltransferase FkbM family  23.69 
 
 
278 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.170743  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0538  methyltransferase FkbM family  30.14 
 
 
228 aa  65.9  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3754  FkbM family methyltransferase  31.68 
 
 
569 aa  65.1  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1160  methyltransferase FkbM family  30 
 
 
879 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.080922  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2698  methyltransferase FkbM family  28.38 
 
 
579 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00917993 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36060  predicted protein  26.13 
 
 
322 aa  60.8  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  27.23 
 
 
430 aa  59.7  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3697  FkbM family methyltransferase  29.35 
 
 
259 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.191836  normal  0.775464 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50607  predicted protein  22.95 
 
 
351 aa  57.4  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3354  hypothetical protein  25.9 
 
 
238 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.96457  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0263  methyltransferase FkbM family  30.18 
 
 
261 aa  57.4  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49826  predicted protein  24.85 
 
 
317 aa  56.2  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.078765  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50348  predicted protein  24.85 
 
 
317 aa  56.2  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00515891  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2673  methyltransferase FkbM family  29.41 
 
 
234 aa  55.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0382849  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37903  predicted protein  23.7 
 
 
293 aa  54.7  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.166915  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0320  methyltransferase FkbM family  27.31 
 
 
265 aa  53.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1207  hypothetical protein  27.42 
 
 
250 aa  52  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2886  methyltransferase FkbM  33.09 
 
 
285 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1782  hypothetical protein  23.46 
 
 
249 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.659008 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1704  hypothetical protein  24 
 
 
249 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2734  methyltransferase FkbM family  25.94 
 
 
265 aa  50.4  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5298  FkbM family methyltransferase  26.67 
 
 
261 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1954  FkbM family methyltransferase  27.52 
 
 
272 aa  51.2  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0179283 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6310  hypothetical protein  21.79 
 
 
249 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45808  predicted protein  25.24 
 
 
784 aa  50.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.558065  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1769  hypothetical protein  21.79 
 
 
249 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5067  hypothetical protein  22.91 
 
 
249 aa  49.7  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.632174  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1299  methyltransferase FkbM  29.38 
 
 
285 aa  49.3  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.71332  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0310  methyltransferase FkbM  30.99 
 
 
244 aa  48.5  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5723  FkbM family methyltransferase  31.85 
 
 
265 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0496638  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4928  FkbM family methyltransferase  27.48 
 
 
332 aa  46.2  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.925294  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1267  methyltransferase FkbM family  23.5 
 
 
255 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4064  FkbM family methyltransferase  29.14 
 
 
237 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345765  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2645  FkbM family methyltransferase  29.52 
 
 
256 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00977905 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0297  FkbM family methyltransferase  26.92 
 
 
279 aa  44.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0254  methyltransferase FkbM  29.44 
 
 
277 aa  43.9  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2470  FkbM family methyltransferase  27.71 
 
 
256 aa  43.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.036877  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0764  methyltransferase FkbM  25 
 
 
283 aa  42.7  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0124652 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5570  methyltransferase FkbM family  31.72 
 
 
248 aa  42.7  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7663  methyltransferase FkbM family  27.03 
 
 
283 aa  42.4  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1894  methyltransferase FkbM  26.99 
 
 
268 aa  42.4  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1325  methyltransferase FkbM family  27.33 
 
 
239 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.624692  normal  0.311227 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4516  FkbM family methyltransferase  26.83 
 
 
277 aa  42.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4451  methyltransferase FkbM family  27.23 
 
 
306 aa  42  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0344893  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4953  methyltransferase FkbM family  25.58 
 
 
276 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>