76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4064 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4064  methyltransferase FkbM  100 
 
 		 250 aa  502  1e-141  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0648  FkbM family methyltransferase  66.4 
 
 		 251 aa  327  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.716259  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2582  Ata11 protein  34.78 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0553282  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0207  methyltransferase FkbM  38.12 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339437  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2091  FkbM family methyltransferase  33.53 
 
 		 255 aa  68.6  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2142  FkbM family methyltransferase  30.57 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2279  methyltransferase FkbM family  26.9 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5205  methyltransferase FkbM family  29.67 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3684  methyltransferase FkbM  31.85 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4928  FkbM family methyltransferase  32.3 
 
 		 332 aa  58.5  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.925294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0751  methyltransferase FkbM  26.24 
 
 		 306 aa  58.5  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1082  methyltransferase FkbM family  34.34 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2673  methyltransferase FkbM family  30.46 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0382849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3801  putative methyltransferase FkbM  31.49 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.403441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2430  FkbM family methyltransferase  32.21 
 
 		 277 aa  54.7  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0747  methyltransferase FkbM  21.01 
 
 		 306 aa  53.5  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1954  FkbM family methyltransferase  32.37 
 
 		 272 aa  53.1  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0179283 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2750  methyltransferase FkbM  25.26 
 
 		 263 aa  52.8  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0942  methyltransferase FkbM  31.62 
 
 		 287 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0159897  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6312  methyltransferase FkbM family  30.73 
 
 		 318 aa  52.4  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0959  FkbM family methyltransferase  31.62 
 
 		 257 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801487  normal  0.774702 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1323  FkbM family methyltransferase  27.06 
 
 		 257 aa  52  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0619476  hitchhiker  0.000000000782975 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3682  FkbM family methyltransferase  30.34 
 
 		 279 aa  52  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.391907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4276  methyltransferase FkbM  31.47 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00443119  normal  0.49625 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11547  hypothetical protein  28.16 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1793  methyltransferase FkbM  27.16 
 
 		 283 aa  50.4  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.628642  normal  0.0129859 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2555  FkbM family methyltransferase  25.17 
 
 		 383 aa  50.4  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2165  FkbM family methyltransferase  29.05 
 
 		 242 aa  50.4  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4024  methyltransferase FkbM family  31.91 
 
 		 351 aa  50.1  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0295  methyltransferase FkbM  32.72 
 
 		 297 aa  50.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0324  FkbM family methyltransferase  25.27 
 
 		 256 aa  49.7  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256046  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1435  FkbM family methyltransferase  26.9 
 
 		 267 aa  49.7  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2867  methyltransferase FkbM family  27.27 
 
 		 386 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  hitchhiker  0.00138469 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2886  methyltransferase FkbM  24.37 
 
 		 285 aa  48.9  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3254  methyltransferase FkbM family  27.27 
 
 		 386 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0697  FkbM family methyltransferase  30.3 
 
 		 217 aa  48.5  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286744  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2624  FkbM family methyltransferase  28.12 
 
 		 282 aa  48.5  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1194  methyltransferase FkbM family  34.23 
 
 		 1498 aa  48.5  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.288288 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2370  methyltransferase FkbM  24.31 
 
 		 348 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.363109  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1687  FkbM family methyltransferase  27.39 
 
 		 296 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2636  RfbT protein  22.65 
 
 		 286 aa  47.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2105  hypothetical protein  28.77 
 
 		 235 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.970335  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2734  methyltransferase FkbM family  29.75 
 
 		 265 aa  47  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2883  methyltransferase FkbM family  26.44 
 
 		 309 aa  47  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.241941  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3883  FkbM family methyltransferase  24.85 
 
 		 228 aa  46.6  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.242767  normal  0.0192927 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4179  methyltransferase FkbM family  26.63 
 
 		 397 aa  46.2  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0764  methyltransferase FkbM  39.73 
 
 		 321 aa  46.6  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5723  FkbM family methyltransferase  30.38 
 
 		 265 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0496638  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0756  SAM-dependent methyltransferase  27.12 
 
 		 275 aa  45.8  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1716  FkbM family methyltransferase  33.83 
 
 		 274 aa  45.8  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.174023  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3697  FkbM family methyltransferase  32.37 
 
 		 259 aa  45.8  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.191836  normal  0.775464 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1485  FkbM family methyltransferase  25.41 
 
 		 376 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.80434 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6324  methyltransferase FkbM family  28.57 
 
 		 313 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4199  methyltransferase FkbM family  29.93 
 
 		 271 aa  45.4  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.228447 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2470  FkbM family methyltransferase  32.47 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.036877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0254  methyltransferase FkbM  27.05 
 
 		 277 aa  44.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4793  methyltransferase FkbM family  26.28 
 
 		 294 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.018486 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0310  methyltransferase FkbM  30.41 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2093  methyltransferase FkbM  29.05 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0475221  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1299  methyltransferase FkbM  26.97 
 
 		 285 aa  43.9  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.71332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4283  methyltransferase, FkbM family protein  31.29 
 
 		 392 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12970  hypothetical protein  25.73 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12969  hypothetical protein  31.87 
 
 		 321 aa  43.9  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1955  FkbM family methyltransferase  30.09 
 
 		 283 aa  43.5  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00902633 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2236  methyltransferase FkbM  29.68 
 
 		 274 aa  43.5  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  24.17 
 
 		 723 aa  43.1  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4174  methyltransferase FkbM family  27.15 
 
 		 385 aa  43.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0743  FkbM family methyltransferase  26.92 
 
 		 661 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.70648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4516  FkbM family methyltransferase  24.69 
 
 		 277 aa  43.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1703  hypothetical protein  32.84 
 
 		 459 aa  42.7  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2645  FkbM family methyltransferase  31.97 
 
 		 256 aa  42.7  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00977905 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0759  methyltransferase FkbM family  32.08 
 
 		 444 aa  42.4  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0294  FkbM family methyltransferase  27 
 
 		 454 aa  42.7  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.314449  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03158  putative methyltransferase  27.49 
 
 		 266 aa  42.4  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0324771  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1518  methyltransferase FkbM  27.52 
 
 		 237 aa  42.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1852  methyltransferase FkbM family  29.93 
 
 		 297 aa  42  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>