49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2555 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2555  FkbM family methyltransferase  100 
 
 
383 aa  776    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4174  methyltransferase FkbM family  31.36 
 
 
385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4179  methyltransferase FkbM family  31.54 
 
 
397 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2845  methyltransferase FkbM  27.88 
 
 
407 aa  147  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.853304  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2571  methyltransferase FkbM family  27.41 
 
 
357 aa  109  8.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.278208  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1495  hypothetical protein  32.03 
 
 
318 aa  106  6e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0587292 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1485  FkbM family methyltransferase  24.02 
 
 
376 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.80434 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1127  putative methyltransferase  24.86 
 
 
383 aa  93.6  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3533  putative methyltransferase  33.95 
 
 
446 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000121197 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3281  methyltransferase  33.95 
 
 
451 aa  92  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136239  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3318  methyltransferase  33.02 
 
 
451 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3578  methyltransferase  33.02 
 
 
446 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550916  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3233  SAM-dependent methyltransferase  33.49 
 
 
451 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3343  FkbM family methyltransferase  25.73 
 
 
371 aa  89.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1608  methyltransferase FkbM family  29.11 
 
 
365 aa  85.9  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0123  methyltransferase FkbM family  34.64 
 
 
374 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.785695  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2219  methyltransferase FkbM family  33.69 
 
 
382 aa  83.2  0.000000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4304  methyltransferase FkbM family  28.38 
 
 
352 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2648  methyltransferase FkbM  27.84 
 
 
408 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4283  methyltransferase, FkbM family protein  29.31 
 
 
392 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2059  methyltransferase FkbM family  30 
 
 
318 aa  78.6  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1423  methyltransferase FkbM family  38.37 
 
 
739 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1321  methyltransferase FkbM family  38.55 
 
 
741 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.145752  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2528  methyltransferase FkbM  34.04 
 
 
738 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06182  methyltransferase, FkbM family protein  27.88 
 
 
456 aa  57.4  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.054415  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00984  methyltransferase, FkbM family protein  27.88 
 
 
456 aa  57.4  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0207  methyltransferase FkbM  30.43 
 
 
235 aa  54.7  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339437  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2162  methyltransferase FkbM family  27.89 
 
 
256 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2699  methyltransferase FkbM family  33.33 
 
 
266 aa  52  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2894  methyltransferase FkbM  29.94 
 
 
296 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4064  methyltransferase FkbM  25.17 
 
 
250 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2718  FkbM family methyltransferase  19.72 
 
 
381 aa  49.7  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0297  FkbM family methyltransferase  25.12 
 
 
279 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4981  hypothetical protein  28.33 
 
 
625 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1277  hypothetical protein  29.01 
 
 
273 aa  47.8  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.668612 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2362  methyltransferase FkbM  28.37 
 
 
258 aa  48.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0747821 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0386  methyltransferase FkbM family  30.47 
 
 
287 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0395  methyltransferase FkbM family  30.47 
 
 
287 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2370  methyltransferase FkbM  39.66 
 
 
348 aa  47.4  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.363109  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3423  FkbM family methyltransferase  34.58 
 
 
314 aa  47  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0570785 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3254  methyltransferase FkbM family  43.48 
 
 
386 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2215  methyltransferase, FkbM family  25 
 
 
264 aa  43.9  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125854  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2867  methyltransferase FkbM family  43.48 
 
 
386 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  hitchhiker  0.00138469 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1869  methyltransferase FkbM family  25 
 
 
264 aa  43.9  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4953  methyltransferase FkbM family  30.71 
 
 
276 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0756  SAM-dependent methyltransferase  42.31 
 
 
275 aa  43.5  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2360  methyltransferase FkbM  30.67 
 
 
260 aa  43.5  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0204457 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4793  methyltransferase FkbM family  24.53 
 
 
294 aa  43.1  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.018486 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0295  methyltransferase FkbM  36.84 
 
 
297 aa  43.1  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>