50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1127 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1127  putative methyltransferase  100 
 
 
383 aa  790    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3343  FkbM family methyltransferase  31.67 
 
 
371 aa  205  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2845  methyltransferase FkbM  28.92 
 
 
407 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.853304  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4174  methyltransferase FkbM family  27.15 
 
 
385 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4179  methyltransferase FkbM family  27.3 
 
 
397 aa  103  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2571  methyltransferase FkbM family  23.76 
 
 
357 aa  98.2  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.278208  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1485  FkbM family methyltransferase  25 
 
 
376 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.80434 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2555  FkbM family methyltransferase  24.86 
 
 
383 aa  93.6  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4283  methyltransferase, FkbM family protein  29.14 
 
 
392 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1495  hypothetical protein  25.43 
 
 
318 aa  77.4  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0587292 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2219  methyltransferase FkbM family  26.88 
 
 
382 aa  74.7  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00984  methyltransferase, FkbM family protein  26.62 
 
 
456 aa  69.3  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06182  methyltransferase, FkbM family protein  26.62 
 
 
456 aa  69.3  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.054415  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2059  methyltransferase FkbM family  24.48 
 
 
318 aa  63.5  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2699  methyltransferase FkbM family  25.42 
 
 
266 aa  62.4  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3281  methyltransferase  28.72 
 
 
451 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136239  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3233  SAM-dependent methyltransferase  28.72 
 
 
451 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3533  putative methyltransferase  28.72 
 
 
446 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000121197 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1608  methyltransferase FkbM family  22.48 
 
 
365 aa  61.2  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3578  methyltransferase  28.19 
 
 
446 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3318  methyltransferase  28.19 
 
 
451 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4981  hypothetical protein  28.03 
 
 
625 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0123  methyltransferase FkbM family  24.6 
 
 
374 aa  53.5  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.785695  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2091  FkbM family methyltransferase  29.28 
 
 
255 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2648  methyltransferase FkbM  24 
 
 
408 aa  52.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0352  methyltransferase FkbM family  25.52 
 
 
256 aa  50.8  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000196185  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5205  methyltransferase FkbM family  29.63 
 
 
303 aa  50.1  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1423  methyltransferase FkbM family  26.88 
 
 
739 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2528  methyltransferase FkbM  27.81 
 
 
738 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2718  FkbM family methyltransferase  25.84 
 
 
381 aa  48.5  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1321  methyltransferase FkbM family  27.81 
 
 
741 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.145752  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2430  FkbM family methyltransferase  25.31 
 
 
277 aa  47  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1244  methyltransferase FkbM  26.85 
 
 
254 aa  46.6  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3423  FkbM family methyltransferase  30.19 
 
 
314 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0570785 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2953  methyltransferase FkbM family  33.91 
 
 
271 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2142  FkbM family methyltransferase  27.35 
 
 
321 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2162  methyltransferase FkbM family  29.37 
 
 
256 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  24.87 
 
 
723 aa  45.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4165  FkbM family methyltransferase  27.33 
 
 
278 aa  44.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5295  hypothetical protein  44.44 
 
 
266 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.090256 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1098  FkbM family methyltransferase  37.04 
 
 
264 aa  44.3  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2624  FkbM family methyltransferase  26.99 
 
 
282 aa  44.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4304  methyltransferase FkbM family  24.73 
 
 
352 aa  44.3  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1152  hypothetical protein  27.82 
 
 
261 aa  43.9  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.609848  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5298  FkbM family methyltransferase  27.27 
 
 
261 aa  43.5  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12969  hypothetical protein  28 
 
 
321 aa  43.5  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4783  methyltransferase FkbM  42.55 
 
 
265 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4793  methyltransferase FkbM family  23.7 
 
 
294 aa  43.1  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.018486 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0435  FkbM family methyltransferase  29.17 
 
 
657 aa  43.1  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4276  methyltransferase FkbM  28.05 
 
 
239 aa  42.7  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00443119  normal  0.49625 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>