164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4793 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4793  methyltransferase FkbM family  100 
 
 
294 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.018486 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1687  FkbM family methyltransferase  36.46 
 
 
296 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1152  hypothetical protein  38.1 
 
 
261 aa  145  6e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.609848  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2142  FkbM family methyltransferase  32.97 
 
 
321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12969  hypothetical protein  33.03 
 
 
321 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5723  FkbM family methyltransferase  37.95 
 
 
265 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0496638  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1955  FkbM family methyltransferase  38.36 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00902633 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4024  methyltransferase FkbM family  33.96 
 
 
351 aa  77.4  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1754  FkbM family methyltransferase  30.26 
 
 
488 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0484  FkbM family methyltransferase  31.75 
 
 
707 aa  72.8  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2699  methyltransferase FkbM family  34.64 
 
 
266 aa  71.6  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2093  methyltransferase FkbM  31.11 
 
 
252 aa  70.9  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0475221  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4516  FkbM family methyltransferase  29.65 
 
 
277 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1567  FkbM family methyltransferase  37.5 
 
 
283 aa  68.6  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1894  methyltransferase FkbM  36.3 
 
 
268 aa  67.8  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6950  FkbM family methyltransferase  29.79 
 
 
283 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7663  methyltransferase FkbM family  31.91 
 
 
283 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2953  methyltransferase FkbM family  31.58 
 
 
271 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2773  FkbM family methyltransferase  27.27 
 
 
263 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2162  methyltransferase FkbM family  29.14 
 
 
256 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  30.57 
 
 
792 aa  66.2  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0747  methyltransferase FkbM  27.19 
 
 
306 aa  66.2  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1852  methyltransferase FkbM family  35.44 
 
 
297 aa  66.2  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2734  methyltransferase FkbM family  33.12 
 
 
265 aa  65.1  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3719  methyltransferase FkbM  30.45 
 
 
288 aa  65.5  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1716  FkbM family methyltransferase  32 
 
 
274 aa  65.5  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.174023  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3172  methyltransferase FkbM family  28.25 
 
 
295 aa  64.3  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1244  methyltransferase FkbM  31.94 
 
 
254 aa  64.7  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2360  methyltransferase FkbM  26.22 
 
 
260 aa  63.9  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0204457 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5205  methyltransferase FkbM family  27.94 
 
 
303 aa  63.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1470  FkbM family methyltransferase  28.83 
 
 
281 aa  63.5  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.684479  normal  0.1078 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3684  methyltransferase FkbM  31.08 
 
 
262 aa  63.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0764  methyltransferase FkbM  36.36 
 
 
283 aa  62.4  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0124652 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0295  methyltransferase FkbM  32.24 
 
 
297 aa  62.4  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_28419  expressed methyltransferase-like protein  27.56 
 
 
375 aa  62.4  0.000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5478  methyltransferase FkbM family  30.56 
 
 
258 aa  62  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1155  FkbM family methyltransferase  27.92 
 
 
301 aa  61.2  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1312  methyltransferase FkbM family  33.13 
 
 
286 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2545  methyltransferase FkbM  31.85 
 
 
242 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14081  hypothetical protein  29.95 
 
 
274 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00860845  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0352  methyltransferase FkbM family  27.27 
 
 
256 aa  60.8  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000196185  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1194  methyltransferase FkbM family  30.54 
 
 
1498 aa  60.8  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.288288 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4165  FkbM family methyltransferase  32.92 
 
 
278 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2894  methyltransferase FkbM  28.85 
 
 
296 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1173  methyltransferase FkbM  28.66 
 
 
255 aa  59.3  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.764759  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2076  FkbM family methyltransferase  27.08 
 
 
316 aa  59.3  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.503081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3291  methyltransferase FkbM family  25.74 
 
 
264 aa  58.9  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4981  hypothetical protein  30.25 
 
 
625 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2279  methyltransferase FkbM family  31.05 
 
 
245 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18943  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2405  methyltransferase FkbM  29.28 
 
 
321 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00173159 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1459  methyltransferase FkbM family  28.74 
 
 
301 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0751  methyltransferase FkbM  28 
 
 
306 aa  58.2  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2896  FkbM family methyltransferase  32.86 
 
 
287 aa  57.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.117356 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0408  methyltransferase FkbM family  27.01 
 
 
313 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482809 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1485  FkbM family methyltransferase  30.46 
 
 
376 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.80434 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4953  methyltransferase FkbM family  27.71 
 
 
276 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0376  FkbM family methyltransferase  27.01 
 
 
326 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.589969  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4283  methyltransferase, FkbM family protein  32.86 
 
 
392 aa  57  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03158  putative methyltransferase  28.4 
 
 
266 aa  56.2  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0324771  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0234  hypothetical protein  29.7 
 
 
275 aa  56.2  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.160183  normal  0.50681 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4559  hypothetical protein  26.78 
 
 
319 aa  56.2  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2370  methyltransferase FkbM  24.16 
 
 
348 aa  55.8  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.363109  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1277  hypothetical protein  29.32 
 
 
273 aa  55.8  0.0000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.668612 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2362  methyltransferase FkbM  27.66 
 
 
258 aa  55.5  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0747821 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2760  methyltransferase FkbM family  29.37 
 
 
264 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  hitchhiker  0.00553627 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2883  methyltransferase FkbM  27.27 
 
 
323 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.722379  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0756  SAM-dependent methyltransferase  24.78 
 
 
275 aa  53.9  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2624  FkbM family methyltransferase  29.94 
 
 
282 aa  53.9  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2361  FkbM family methyltransferase  31.68 
 
 
270 aa  53.9  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000541582  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0706  FkbM family methyltransferase  30.51 
 
 
280 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0495964 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2883  methyltransferase FkbM family  26.9 
 
 
309 aa  53.5  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.241941  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2217  methyltransferase FkbM  27.87 
 
 
321 aa  52.8  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3296  methyltransferase FkbM family  26.78 
 
 
323 aa  52.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6684  putative methyltransferase  28.57 
 
 
256 aa  52.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0297  FkbM family methyltransferase  27.35 
 
 
279 aa  52.8  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1421  FkbH like protein  30.6 
 
 
3811 aa  52  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0444  methyltransferase FkbM family  28.42 
 
 
275 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2886  methyltransferase FkbM  29.01 
 
 
285 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4276  methyltransferase FkbM  30.77 
 
 
239 aa  52.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00443119  normal  0.49625 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  25.49 
 
 
7122 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2091  FkbM family methyltransferase  28.4 
 
 
255 aa  52  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0764  methyltransferase FkbM  30.07 
 
 
321 aa  51.2  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0123  methyltransferase FkbM family  29.28 
 
 
374 aa  51.2  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.785695  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1608  methyltransferase FkbM family  28.19 
 
 
365 aa  51.2  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  25.42 
 
 
723 aa  51.2  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0453  methyltransferase FkbM family  27.44 
 
 
250 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4928  FkbM family methyltransferase  32.34 
 
 
332 aa  51.6  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.925294  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2576  methyltransferase FkbM  27.47 
 
 
323 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.198474  normal  0.0714467 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4304  methyltransferase FkbM family  31.52 
 
 
352 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3254  methyltransferase FkbM family  28.76 
 
 
386 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2867  methyltransferase FkbM family  28.76 
 
 
386 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  hitchhiker  0.00138469 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0759  methyltransferase FkbM family  28.57 
 
 
444 aa  49.7  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2165  FkbM family methyltransferase  27.61 
 
 
242 aa  49.7  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112719  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1174  FkbM family methyltransferase  31.03 
 
 
299 aa  49.3  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.830745  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0061  FkbM family methyltransferase  27.21 
 
 
259 aa  49.3  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0207  methyltransferase FkbM  31.14 
 
 
235 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339437  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1251  FkbM family methyltransferase  26.28 
 
 
415 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0112173 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04490  hypothetical protein  30.32 
 
 
265 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210415  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1846  FkbM family methyltransferase  31.13 
 
 
303 aa  48.1  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000367724  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0263  methyltransferase FkbM family  33.33 
 
 
261 aa  48.9  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>