53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2470 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2470  FkbM family methyltransferase  100 
 
 
256 aa  513  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.036877  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2645  FkbM family methyltransferase  85.1 
 
 
256 aa  443  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00977905 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0310  methyltransferase FkbM  53.65 
 
 
244 aa  243  1.9999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5570  methyltransferase FkbM family  51.85 
 
 
248 aa  242  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0263  methyltransferase FkbM family  52.87 
 
 
261 aa  236  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2056  FkbM family methyltransferase  56.9 
 
 
256 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000222179 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0320  methyltransferase FkbM family  48.07 
 
 
265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1251  methyltransferase FkbM family  43.27 
 
 
265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1082  methyltransferase FkbM family  40.61 
 
 
262 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0697  FkbM family methyltransferase  37.5 
 
 
217 aa  144  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286744  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1325  methyltransferase FkbM family  34.08 
 
 
239 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.624692  normal  0.311227 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12969  hypothetical protein  33.33 
 
 
321 aa  57  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0207  methyltransferase FkbM  32.48 
 
 
235 aa  55.5  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339437  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5155  FkbM family methyltransferase  23.44 
 
 
234 aa  55.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1716  FkbM family methyltransferase  29.95 
 
 
274 aa  53.9  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.174023  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1954  FkbM family methyltransferase  35.17 
 
 
272 aa  53.5  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0179283 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1955  FkbM family methyltransferase  31.1 
 
 
283 aa  52.8  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00902633 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0942  methyltransferase FkbM  28.41 
 
 
287 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0159897  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2750  methyltransferase FkbM  28.97 
 
 
263 aa  52.4  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0959  FkbM family methyltransferase  28.41 
 
 
257 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801487  normal  0.774702 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  36.71 
 
 
792 aa  52  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14511  SAM-dependent methyltransferase  23.64 
 
 
287 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.559742  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4024  methyltransferase FkbM family  27.81 
 
 
351 aa  51.6  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5384  methyltransferase FkbM family  26.23 
 
 
275 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6950  FkbM family methyltransferase  31.08 
 
 
283 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1299  methyltransferase FkbM  34.09 
 
 
285 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.71332  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3682  FkbM family methyltransferase  29.28 
 
 
279 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.391907  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0706  FkbM family methyltransferase  33.93 
 
 
280 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0495964 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4981  hypothetical protein  28.39 
 
 
625 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  28.31 
 
 
723 aa  48.5  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2511  methyltransferase FkbM  25.73 
 
 
272 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0376  FkbM family methyltransferase  31.61 
 
 
326 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.589969  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1518  methyltransferase FkbM  30.61 
 
 
237 aa  47.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0408  methyltransferase FkbM family  31.61 
 
 
313 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482809 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28640  dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)  36.71 
 
 
269 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0614661 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4928  FkbM family methyltransferase  29.41 
 
 
332 aa  47  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.925294  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3712  FkbM family methyltransferase  29.84 
 
 
411 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7663  methyltransferase FkbM family  29.05 
 
 
283 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2894  methyltransferase FkbM  28.47 
 
 
296 aa  46.2  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4064  methyltransferase FkbM  32.47 
 
 
250 aa  45.4  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1152  hypothetical protein  30 
 
 
261 aa  45.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.609848  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1852  methyltransferase FkbM family  29.11 
 
 
297 aa  44.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2236  methyltransferase FkbM  28.67 
 
 
274 aa  45.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0294  FkbM family methyltransferase  31.76 
 
 
454 aa  44.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.314449  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1470  FkbM family methyltransferase  32.05 
 
 
281 aa  44.7  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.684479  normal  0.1078 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4276  methyltransferase FkbM  28.28 
 
 
239 aa  43.9  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00443119  normal  0.49625 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2673  methyltransferase FkbM family  28.57 
 
 
234 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0382849  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0444  methyltransferase FkbM family  32.89 
 
 
275 aa  43.5  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2896  FkbM family methyltransferase  28.67 
 
 
287 aa  43.9  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.117356 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3994  methyltransferase FkbM  27.71 
 
 
256 aa  43.1  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2095  methyltransferase FkbM  31.17 
 
 
242 aa  43.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4793  methyltransferase FkbM family  26.53 
 
 
294 aa  42.4  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.018486 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11547  hypothetical protein  28.09 
 
 
243 aa  42.4  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>