73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1082 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1082  methyltransferase FkbM family  100 
 
 
262 aa  530  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0310  methyltransferase FkbM  44.3 
 
 
244 aa  192  4e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0320  methyltransferase FkbM family  45.93 
 
 
265 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2645  FkbM family methyltransferase  42.36 
 
 
256 aa  180  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00977905 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5570  methyltransferase FkbM family  44.18 
 
 
248 aa  179  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1251  methyltransferase FkbM family  47.41 
 
 
265 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0263  methyltransferase FkbM family  41.27 
 
 
261 aa  171  7.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2056  FkbM family methyltransferase  43.32 
 
 
256 aa  168  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000222179 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2470  FkbM family methyltransferase  40.61 
 
 
256 aa  160  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.036877  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0697  FkbM family methyltransferase  36.97 
 
 
217 aa  142  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286744  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1325  methyltransferase FkbM family  33.93 
 
 
239 aa  131  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.624692  normal  0.311227 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4928  FkbM family methyltransferase  29.41 
 
 
332 aa  65.1  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.925294  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4024  methyltransferase FkbM family  33.73 
 
 
351 aa  63.2  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2673  methyltransferase FkbM family  29.33 
 
 
234 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0382849  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2867  methyltransferase FkbM family  26.64 
 
 
386 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  hitchhiker  0.00138469 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3254  methyltransferase FkbM family  26.64 
 
 
386 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1716  FkbM family methyltransferase  30.59 
 
 
274 aa  58.5  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.174023  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4064  methyltransferase FkbM  34.34 
 
 
250 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  29.63 
 
 
723 aa  57.4  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4554  FkbM family methyltransferase  29.9 
 
 
263 aa  56.6  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.02089  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0618  FkbM family methyltransferase  33.09 
 
 
232 aa  55.5  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1852  methyltransferase FkbM family  31.18 
 
 
297 aa  55.5  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2091  FkbM family methyltransferase  30.49 
 
 
255 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2142  FkbM family methyltransferase  29.84 
 
 
321 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1954  FkbM family methyltransferase  29.27 
 
 
272 aa  54.7  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0179283 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0207  methyltransferase FkbM  29.44 
 
 
235 aa  53.5  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339437  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1687  FkbM family methyltransferase  32.9 
 
 
296 aa  53.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4981  hypothetical protein  25.14 
 
 
625 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12969  hypothetical protein  34.94 
 
 
321 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2162  methyltransferase FkbM family  27.37 
 
 
256 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1299  methyltransferase FkbM  31.75 
 
 
285 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.71332  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11547  hypothetical protein  30.15 
 
 
243 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2886  methyltransferase FkbM  23.3 
 
 
285 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2896  FkbM family methyltransferase  28.73 
 
 
287 aa  50.8  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.117356 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0352  methyltransferase FkbM family  26.51 
 
 
256 aa  50.4  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000196185  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3801  putative methyltransferase FkbM  31.88 
 
 
239 aa  50.4  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.403441  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0747  methyltransferase FkbM  27.33 
 
 
306 aa  50.4  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6312  methyltransferase FkbM family  27.52 
 
 
318 aa  50.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1453  FkbM family methyltransferase  28.68 
 
 
293 aa  49.7  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.214095  hitchhiker  0.000083365 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3712  FkbM family methyltransferase  30.41 
 
 
411 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0324  FkbM family methyltransferase  31.91 
 
 
256 aa  48.9  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256046  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3682  FkbM family methyltransferase  28.1 
 
 
279 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.391907  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5384  methyltransferase FkbM family  20.73 
 
 
275 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2511  methyltransferase FkbM  28.57 
 
 
272 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.297498 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2699  methyltransferase FkbM family  24.74 
 
 
266 aa  47.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  30.77 
 
 
792 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0294  FkbM family methyltransferase  29.3 
 
 
454 aa  47.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.314449  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0706  FkbM family methyltransferase  30.24 
 
 
280 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0495964 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2279  methyltransferase FkbM family  26.06 
 
 
245 aa  47  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18943  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1194  methyltransferase FkbM family  33.57 
 
 
1498 aa  47  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.288288 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1470  FkbM family methyltransferase  31.61 
 
 
281 aa  46.6  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.684479  normal  0.1078 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3684  methyltransferase FkbM  24.46 
 
 
262 aa  46.6  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2894  methyltransferase FkbM  25.54 
 
 
296 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2582  Ata11 protein  25.53 
 
 
255 aa  46.6  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0553282  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1955  FkbM family methyltransferase  30.72 
 
 
283 aa  46.2  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00902633 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6633  FkbM family methyltransferase  28.8 
 
 
272 aa  45.4  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00015631  hitchhiker  0.000119437 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2165  FkbM family methyltransferase  28.26 
 
 
242 aa  45.8  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112719  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1152  hypothetical protein  30.28 
 
 
261 aa  44.7  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.609848  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2215  methyltransferase, FkbM family  33.11 
 
 
264 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125854  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1869  methyltransferase FkbM family  33.11 
 
 
264 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6950  FkbM family methyltransferase  32.5 
 
 
283 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1435  FkbM family methyltransferase  25.29 
 
 
267 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0123  methyltransferase FkbM family  27.71 
 
 
374 aa  44.3  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.785695  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1251  FkbM family methyltransferase  27.54 
 
 
415 aa  43.9  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0112173 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0756  SAM-dependent methyltransferase  24.87 
 
 
275 aa  44.3  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2883  methyltransferase FkbM family  30.87 
 
 
309 aa  43.9  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.241941  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1754  FkbM family methyltransferase  24.16 
 
 
488 aa  43.5  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4276  methyltransferase FkbM  27.66 
 
 
239 aa  43.9  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00443119  normal  0.49625 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2059  methyltransferase FkbM family  24.18 
 
 
318 aa  43.9  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14081  hypothetical protein  22.22 
 
 
274 aa  43.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00860845  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3697  FkbM family methyltransferase  31.94 
 
 
259 aa  42.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.191836  normal  0.775464 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03158  putative methyltransferase  28.78 
 
 
266 aa  42  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0324771  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14511  SAM-dependent methyltransferase  20.93 
 
 
287 aa  42  0.009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.559742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>