142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3801 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_3801  putative methyltransferase FkbM  100 
 
 
239 aa  487  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.403441  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0207  methyltransferase FkbM  45.06 
 
 
235 aa  212  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339437  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1954  FkbM family methyltransferase  34.89 
 
 
272 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0179283 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0254  methyltransferase FkbM  35.62 
 
 
277 aa  89  6e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5298  FkbM family methyltransferase  34.45 
 
 
261 aa  86.3  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0295  methyltransferase FkbM  34.03 
 
 
297 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3254  methyltransferase FkbM family  32.89 
 
 
386 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2162  methyltransferase FkbM family  31.91 
 
 
256 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2867  methyltransferase FkbM family  32.89 
 
 
386 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  hitchhiker  0.00138469 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4953  methyltransferase FkbM family  29.44 
 
 
276 aa  75.9  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2883  methyltransferase FkbM family  30.88 
 
 
309 aa  75.9  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.241941  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2673  methyltransferase FkbM family  34.34 
 
 
234 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0382849  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0751  methyltransferase FkbM  30.81 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1955  FkbM family methyltransferase  35.2 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00902633 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1716  FkbM family methyltransferase  34.64 
 
 
274 aa  72.4  0.000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.174023  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3712  FkbM family methyltransferase  31.61 
 
 
411 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3719  methyltransferase FkbM  34.55 
 
 
288 aa  71.6  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0352  methyltransferase FkbM family  31.11 
 
 
256 aa  71.6  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000196185  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2142  FkbM family methyltransferase  37.91 
 
 
321 aa  72  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1793  methyltransferase FkbM  27.84 
 
 
283 aa  71.2  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.628642  normal  0.0129859 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0123  methyltransferase FkbM family  35.66 
 
 
374 aa  69.7  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.785695  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2091  FkbM family methyltransferase  35.62 
 
 
255 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0294  FkbM family methyltransferase  38.52 
 
 
454 aa  67  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.314449  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1323  FkbM family methyltransferase  29.84 
 
 
257 aa  67.4  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0619476  hitchhiker  0.000000000782975 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2059  methyltransferase FkbM family  29.5 
 
 
318 aa  66.2  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0706  FkbM family methyltransferase  39.69 
 
 
280 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0495964 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2894  methyltransferase FkbM  30.18 
 
 
296 aa  65.1  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3682  FkbM family methyltransferase  30.22 
 
 
279 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.391907  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  35.22 
 
 
792 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1194  methyltransferase FkbM family  35.71 
 
 
1498 aa  63.2  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.288288 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3172  methyltransferase FkbM family  32.58 
 
 
295 aa  63.2  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0764  methyltransferase FkbM  30.49 
 
 
283 aa  62.8  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0124652 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4165  FkbM family methyltransferase  35.29 
 
 
278 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2750  methyltransferase FkbM  31.25 
 
 
263 aa  61.2  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2773  FkbM family methyltransferase  33.72 
 
 
263 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6950  FkbM family methyltransferase  35.81 
 
 
283 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1244  methyltransferase FkbM  29.61 
 
 
254 aa  60.8  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1251  FkbM family methyltransferase  26.26 
 
 
415 aa  60.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0112173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5205  methyltransferase FkbM family  27.07 
 
 
303 aa  59.7  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1608  methyltransferase FkbM family  28.38 
 
 
365 aa  59.7  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2582  Ata11 protein  33.55 
 
 
255 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0553282  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03158  putative methyltransferase  30.9 
 
 
266 aa  58.9  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0324771  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7663  methyltransferase FkbM family  34.33 
 
 
283 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2215  methyltransferase, FkbM family  29.69 
 
 
264 aa  58.5  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125854  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1869  methyltransferase FkbM family  29.69 
 
 
264 aa  58.5  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0747  methyltransferase FkbM  26.04 
 
 
306 aa  58.2  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4516  FkbM family methyltransferase  31.72 
 
 
277 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2362  methyltransferase FkbM  30.12 
 
 
258 aa  57.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0747821 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1312  methyltransferase FkbM family  27.23 
 
 
286 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0444  methyltransferase FkbM family  33.08 
 
 
275 aa  57  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3684  methyltransferase FkbM  28.38 
 
 
262 aa  56.6  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3697  FkbM family methyltransferase  32.74 
 
 
259 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.191836  normal  0.775464 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0942  methyltransferase FkbM  32.39 
 
 
287 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0159897  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0959  FkbM family methyltransferase  32.39 
 
 
257 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801487  normal  0.774702 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5723  FkbM family methyltransferase  31.51 
 
 
265 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0496638  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0234  hypothetical protein  35.71 
 
 
275 aa  55.1  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.160183  normal  0.50681 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2760  methyltransferase FkbM family  25.37 
 
 
264 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  hitchhiker  0.00553627 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4064  methyltransferase FkbM  31.49 
 
 
250 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1754  FkbM family methyltransferase  26.9 
 
 
488 aa  54.7  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2279  methyltransferase FkbM family  28.89 
 
 
245 aa  54.3  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18943  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4981  hypothetical protein  24.58 
 
 
625 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4276  methyltransferase FkbM  33.33 
 
 
239 aa  53.9  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00443119  normal  0.49625 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2165  FkbM family methyltransferase  29.24 
 
 
242 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112719  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0395  methyltransferase FkbM family  28.19 
 
 
287 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0386  methyltransferase FkbM family  28.19 
 
 
287 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0743  FkbM family methyltransferase  30.07 
 
 
661 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.70648  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1894  methyltransferase FkbM  36.69 
 
 
268 aa  53.5  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5202  FkbM family methyltransferase  30.77 
 
 
416 aa  53.5  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.327791  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2734  methyltransferase FkbM family  31.72 
 
 
265 aa  53.5  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2528  methyltransferase FkbM  33.33 
 
 
738 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07250  hypothetical protein  25.32 
 
 
284 aa  53.1  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.544273  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2430  FkbM family methyltransferase  30.65 
 
 
277 aa  53.5  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2624  FkbM family methyltransferase  27.75 
 
 
282 aa  53.1  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4789  methyltransferase FkbM family  26.67 
 
 
268 aa  53.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0197254 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3423  FkbM family methyltransferase  26.2 
 
 
314 aa  52.4  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0570785 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0297  FkbM family methyltransferase  28.74 
 
 
279 aa  52.4  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0408  methyltransferase FkbM family  32.31 
 
 
313 aa  52  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0376  FkbM family methyltransferase  32.31 
 
 
326 aa  52  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.589969  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1152  hypothetical protein  31.33 
 
 
261 aa  52  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.609848  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3318  methyltransferase  27.1 
 
 
451 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3233  SAM-dependent methyltransferase  26.45 
 
 
451 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3578  methyltransferase  27.1 
 
 
446 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550916  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  26.53 
 
 
723 aa  51.6  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4783  methyltransferase FkbM  27.35 
 
 
265 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1423  methyltransferase FkbM family  32.24 
 
 
739 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1321  methyltransferase FkbM family  32.24 
 
 
741 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.145752  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1082  methyltransferase FkbM family  31.88 
 
 
262 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3281  methyltransferase  25.95 
 
 
451 aa  50.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136239  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2360  methyltransferase FkbM  28.92 
 
 
260 aa  50.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0204457 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1325  methyltransferase FkbM family  30.2 
 
 
239 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.624692  normal  0.311227 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3533  putative methyltransferase  26.28 
 
 
446 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000121197 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6633  FkbM family methyltransferase  28.49 
 
 
272 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00015631  hitchhiker  0.000119437 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2699  methyltransferase FkbM family  31.37 
 
 
266 aa  50.4  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1852  methyltransferase FkbM family  30.51 
 
 
297 aa  50.4  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1836  methyltransferase FkbM family  29.63 
 
 
1673 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4928  FkbM family methyltransferase  30.51 
 
 
332 aa  50.1  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.925294  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0044  methyltransferase FkbM family  28.17 
 
 
278 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.170743  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0046  methyltransferase FkbM family  28.17 
 
 
278 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  28.3 
 
 
921 aa  49.3  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2219  methyltransferase FkbM family  27.94 
 
 
382 aa  49.3  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>