119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0234 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0234  hypothetical protein  100 
 
 
275 aa  554  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.160183  normal  0.50681 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1894  methyltransferase FkbM  59.92 
 
 
268 aa  325  6e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0444  methyltransferase FkbM family  36.5 
 
 
275 aa  161  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6950  FkbM family methyltransferase  37.64 
 
 
283 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0706  FkbM family methyltransferase  36.53 
 
 
280 aa  159  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0495964 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7663  methyltransferase FkbM family  37.27 
 
 
283 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0376  FkbM family methyltransferase  36.13 
 
 
326 aa  156  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.589969  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0408  methyltransferase FkbM family  36.13 
 
 
313 aa  156  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482809 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2896  FkbM family methyltransferase  32.26 
 
 
287 aa  137  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.117356 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3000  FkbM family methyltransferase  30.88 
 
 
288 aa  89.4  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.22275  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4981  hypothetical protein  30.88 
 
 
625 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3712  FkbM family methyltransferase  33.33 
 
 
411 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2773  FkbM family methyltransferase  33.74 
 
 
263 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3682  FkbM family methyltransferase  32.04 
 
 
279 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.391907  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  29.57 
 
 
723 aa  72.8  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1470  FkbM family methyltransferase  28.02 
 
 
281 aa  71.2  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.684479  normal  0.1078 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0751  methyltransferase FkbM  28.24 
 
 
306 aa  69.7  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2142  FkbM family methyltransferase  35.64 
 
 
321 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1955  FkbM family methyltransferase  30.34 
 
 
283 aa  67.8  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00902633 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3374  FkbM family methyltransferase  28.32 
 
 
284 aa  67  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  37.3 
 
 
921 aa  65.9  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0294  FkbM family methyltransferase  38.82 
 
 
454 aa  63.2  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.314449  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5205  methyltransferase FkbM family  26.83 
 
 
303 aa  63.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4024  methyltransferase FkbM family  31.21 
 
 
351 aa  62.4  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4165  FkbM family methyltransferase  32.67 
 
 
278 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3719  methyltransferase FkbM  29.27 
 
 
288 aa  60.8  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0352  methyltransferase FkbM family  25.74 
 
 
256 aa  60.8  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000196185  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2360  methyltransferase FkbM  30.67 
 
 
260 aa  59.3  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0204457 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03158  putative methyltransferase  29.74 
 
 
266 aa  59.3  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0324771  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0207  methyltransferase FkbM  29.63 
 
 
235 aa  58.9  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339437  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2162  methyltransferase FkbM family  32.86 
 
 
256 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5570  methyltransferase FkbM family  32.54 
 
 
248 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3035  methyltransferase FkbM  33.53 
 
 
235 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0295  methyltransferase FkbM  31.91 
 
 
297 aa  58.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1567  FkbM family methyltransferase  32.56 
 
 
283 aa  57  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2091  FkbM family methyltransferase  34.01 
 
 
255 aa  57  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1244  methyltransferase FkbM  35.17 
 
 
254 aa  57  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3172  methyltransferase FkbM family  30.97 
 
 
295 aa  57  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  31.46 
 
 
792 aa  56.6  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4793  methyltransferase FkbM family  29.7 
 
 
294 aa  56.2  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.018486 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2362  methyltransferase FkbM  32.24 
 
 
258 aa  55.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0747821 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1754  FkbM family methyltransferase  21.8 
 
 
488 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3801  putative methyltransferase FkbM  35.71 
 
 
239 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.403441  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0764  methyltransferase FkbM  27.62 
 
 
283 aa  54.3  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0124652 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0618  FkbM family methyltransferase  30.77 
 
 
232 aa  54.3  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12969  hypothetical protein  35.17 
 
 
321 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1421  FkbH like protein  26.4 
 
 
3811 aa  53.9  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0123  methyltransferase FkbM family  29.51 
 
 
374 aa  53.9  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.785695  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4823  FkbM family methyltransferase  31.4 
 
 
285 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.80826  normal  0.0416972 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1836  methyltransferase FkbM family  32 
 
 
1673 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2894  methyltransferase FkbM  25.52 
 
 
296 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14081  hypothetical protein  24.79 
 
 
274 aa  52.8  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00860845  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2279  methyltransferase FkbM family  27.86 
 
 
245 aa  52.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18943  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0743  FkbM family methyltransferase  30.82 
 
 
661 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.70648  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1716  FkbM family methyltransferase  31.32 
 
 
274 aa  52.4  0.000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.174023  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1687  FkbM family methyltransferase  32.56 
 
 
296 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1869  methyltransferase FkbM family  26.84 
 
 
264 aa  52  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2215  methyltransferase, FkbM family  26.84 
 
 
264 aa  52  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125854  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2867  methyltransferase FkbM family  29.69 
 
 
386 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  hitchhiker  0.00138469 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0263  methyltransferase FkbM family  33.8 
 
 
261 aa  50.8  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4928  FkbM family methyltransferase  31.43 
 
 
332 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.925294  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3254  methyltransferase FkbM family  29.69 
 
 
386 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1702  methyltransferase FkbM family  29.41 
 
 
277 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4250  methyltransferase FkbM  26.56 
 
 
256 aa  50.4  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.155825 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34840  putative non-ribosomal peptide synthetase  29.22 
 
 
2125 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297864  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2624  FkbM family methyltransferase  26.92 
 
 
282 aa  49.3  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0453  methyltransferase FkbM family  28.81 
 
 
250 aa  49.3  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11547  hypothetical protein  34.64 
 
 
243 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4271  methyltransferase FkbM family  30.16 
 
 
268 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0061  FkbM family methyltransferase  28 
 
 
259 aa  48.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6324  methyltransferase FkbM family  26.01 
 
 
313 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07250  hypothetical protein  24 
 
 
284 aa  47.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.544273  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2636  RfbT protein  27.33 
 
 
286 aa  47.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2361  FkbM family methyltransferase  30.71 
 
 
270 aa  47.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000541582  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0395  methyltransferase FkbM family  26.57 
 
 
287 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0386  methyltransferase FkbM family  26.57 
 
 
287 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2699  methyltransferase FkbM family  33.08 
 
 
266 aa  47  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2370  methyltransferase FkbM  24.49 
 
 
348 aa  47  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.363109  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1323  FkbM family methyltransferase  29.03 
 
 
257 aa  47.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0619476  hitchhiker  0.000000000782975 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1459  methyltransferase FkbM family  28.65 
 
 
301 aa  47  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4789  methyltransferase FkbM family  28.57 
 
 
268 aa  46.6  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0197254 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0324  FkbM family methyltransferase  27.52 
 
 
256 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256046  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2076  FkbM family methyltransferase  33.33 
 
 
316 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.503081 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2093  methyltransferase FkbM  28.06 
 
 
252 aa  44.3  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0475221  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2750  methyltransferase FkbM  27.54 
 
 
263 aa  44.3  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14511  SAM-dependent methyltransferase  24.44 
 
 
287 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.559742  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1852  methyltransferase FkbM family  32.35 
 
 
297 aa  44.3  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2165  FkbM family methyltransferase  30.71 
 
 
242 aa  44.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112719  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2953  methyltransferase FkbM family  28.57 
 
 
271 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1321  methyltransferase FkbM family  31.21 
 
 
741 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.145752  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2673  methyltransferase FkbM family  29.26 
 
 
234 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0382849  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2760  methyltransferase FkbM family  27.08 
 
 
264 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  hitchhiker  0.00553627 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1688  FkbM family methyltransferase  28.3 
 
 
288 aa  43.9  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0527  FkbM family methyltransferase  29.06 
 
 
245 aa  43.5  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6633  FkbM family methyltransferase  24.83 
 
 
272 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00015631  hitchhiker  0.000119437 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1423  methyltransferase FkbM family  31.21 
 
 
739 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1312  methyltransferase FkbM family  33.56 
 
 
286 aa  43.5  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3684  methyltransferase FkbM  28.12 
 
 
262 aa  43.5  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0747  methyltransferase FkbM  27.61 
 
 
306 aa  43.1  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5478  methyltransferase FkbM family  30.71 
 
 
258 aa  43.5  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>