37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2636 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2636  RfbT protein  100 
 
 		 286 aa  590  1e-167  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2162  methyltransferase FkbM family  27.16 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0294  FkbM family methyltransferase  27.8 
 
 		 454 aa  58.2  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.314449  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  29.8 
 
 		 792 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2896  FkbM family methyltransferase  28.21 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.117356 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7663  methyltransferase FkbM family  25.68 
 
 		 283 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1152  hypothetical protein  28.75 
 
 		 261 aa  52.8  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.609848  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0324  FkbM family methyltransferase  30.95 
 
 		 256 aa  52.8  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256046  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6950  FkbM family methyltransferase  25.15 
 
 		 283 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2953  methyltransferase FkbM family  27.94 
 
 		 271 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1459  methyltransferase FkbM family  27.08 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0295  methyltransferase FkbM  24.16 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0408  methyltransferase FkbM family  26.35 
 
 		 313 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482809 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03158  putative methyltransferase  26.85 
 
 		 266 aa  52  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0324771  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0376  FkbM family methyltransferase  26.35 
 
 		 326 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.589969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0444  methyltransferase FkbM family  26.35 
 
 		 275 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0706  FkbM family methyltransferase  27.78 
 
 		 280 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0495964 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1754  FkbM family methyltransferase  27.83 
 
 		 488 aa  50.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0515  FkbM family methyltransferase  32.68 
 
 		 385 aa  48.9  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1894  methyltransferase FkbM  27.7 
 
 		 268 aa  48.5  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1518  methyltransferase FkbM  30.15 
 
 		 237 aa  48.5  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4064  methyltransferase FkbM  22.65 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2279  methyltransferase FkbM family  25 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2142  FkbM family methyltransferase  29.12 
 
 		 321 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0234  hypothetical protein  27.33 
 
 		 275 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.160183  normal  0.50681 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4516  FkbM family methyltransferase  24.43 
 
 		 277 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0207  methyltransferase FkbM  23 
 
 		 235 aa  47.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339437  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3719  methyltransferase FkbM  27.27 
 
 		 288 aa  47  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3712  FkbM family methyltransferase  25.69 
 
 		 411 aa  45.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1687  FkbM family methyltransferase  26.81 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4793  methyltransferase FkbM family  24.31 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.018486 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2699  methyltransferase FkbM family  28.06 
 
 		 266 aa  43.9  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0297  FkbM family methyltransferase  26.35 
 
 		 279 aa  43.5  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34840  putative non-ribosomal peptide synthetase  27.62 
 
 		 2125 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0618  FkbM family methyltransferase  26.43 
 
 		 232 aa  43.1  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4024  methyltransferase FkbM family  27.04 
 
 		 351 aa  42.7  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0747  methyltransferase FkbM  26.97 
 
 		 306 aa  42.4  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>