62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4271 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4271  methyltransferase FkbM family  100 
 
 
268 aa  558  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4789  methyltransferase FkbM family  53.56 
 
 
268 aa  323  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0197254 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2760  methyltransferase FkbM family  37.2 
 
 
264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  hitchhiker  0.00553627 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6684  putative methyltransferase  30.95 
 
 
256 aa  71.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1716  FkbM family methyltransferase  33.33 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.174023  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1251  FkbM family methyltransferase  23.44 
 
 
415 aa  67.4  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0112173 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1846  FkbM family methyltransferase  25 
 
 
303 aa  60.8  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000367724  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2142  FkbM family methyltransferase  32.08 
 
 
321 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3549  methyltransferase FkbM family  24.84 
 
 
279 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.169711  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1424  FkbM family methyltransferase  26.18 
 
 
348 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312344 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4928  FkbM family methyltransferase  30.6 
 
 
332 aa  53.9  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.925294  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3605  methyltransferase FkbM family  27.35 
 
 
308 aa  53.1  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2699  methyltransferase FkbM family  25.76 
 
 
266 aa  53.1  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34840  putative non-ribosomal peptide synthetase  28.43 
 
 
2125 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297864  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0864  methyltransferase FkbM family  27.05 
 
 
282 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3035  methyltransferase FkbM  30.11 
 
 
235 aa  52.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0706  FkbM family methyltransferase  27.32 
 
 
280 aa  52  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0495964 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4981  hypothetical protein  29.37 
 
 
625 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5205  methyltransferase FkbM family  25.73 
 
 
303 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2059  methyltransferase FkbM family  30.89 
 
 
318 aa  50.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5961  methyltransferase FkbM family  30.5 
 
 
292 aa  50.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0180421 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6950  FkbM family methyltransferase  31.45 
 
 
283 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2883  methyltransferase FkbM family  26.11 
 
 
309 aa  49.3  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.241941  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3712  FkbM family methyltransferase  25.63 
 
 
411 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0207  methyltransferase FkbM  26.67 
 
 
235 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339437  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0747  methyltransferase FkbM  26.86 
 
 
306 aa  48.1  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1793  methyltransferase FkbM  24.82 
 
 
283 aa  48.1  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.628642  normal  0.0129859 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7105  methyltransferase FkbM family  28.37 
 
 
292 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.233504 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7663  methyltransferase FkbM family  27.17 
 
 
283 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4250  methyltransferase FkbM  26 
 
 
256 aa  48.5  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.155825 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4276  methyltransferase FkbM  30.46 
 
 
239 aa  48.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00443119  normal  0.49625 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0234  hypothetical protein  30.16 
 
 
275 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.160183  normal  0.50681 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0405  FkbM family methyltransferase  25.86 
 
 
237 aa  48.5  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0658878  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  25.15 
 
 
792 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0444  methyltransferase FkbM family  29.24 
 
 
275 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1809  FkbM family methyltransferase  23.64 
 
 
233 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198862 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  24.29 
 
 
921 aa  47.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5478  methyltransferase FkbM family  28.08 
 
 
258 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1251  FkbM family methyltransferase  23.96 
 
 
262 aa  47.4  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000622553  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2894  methyltransferase FkbM  23.5 
 
 
296 aa  47  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0061  FkbM family methyltransferase  26.24 
 
 
259 aa  46.6  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3291  methyltransferase FkbM family  25.13 
 
 
264 aa  46.2  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3254  methyltransferase FkbM family  30.51 
 
 
386 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2867  methyltransferase FkbM family  30.51 
 
 
386 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  hitchhiker  0.00138469 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2844  methyltransferase FkbM  22.67 
 
 
312 aa  45.8  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0273  methyltransferase FkbM family  24.09 
 
 
278 aa  45.8  0.0008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0453  methyltransferase FkbM family  25.29 
 
 
250 aa  45.4  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14511  SAM-dependent methyltransferase  23.33 
 
 
287 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.559742  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2896  FkbM family methyltransferase  28.77 
 
 
287 aa  45.4  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.117356 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  28.12 
 
 
723 aa  44.3  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2279  methyltransferase FkbM family  26.71 
 
 
245 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18943  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1590  methyltransferase FkbM  20.79 
 
 
236 aa  44.3  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.646237  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0352  methyltransferase FkbM family  26.62 
 
 
256 aa  43.9  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000196185  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2400  methyltransferase FkbM  26.9 
 
 
267 aa  43.9  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0672075  normal  0.299288 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2734  methyltransferase FkbM family  25.5 
 
 
265 aa  43.9  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1687  FkbM family methyltransferase  24.31 
 
 
296 aa  43.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0408  methyltransferase FkbM family  27.38 
 
 
313 aa  42.7  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482809 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1955  FkbM family methyltransferase  24.31 
 
 
283 aa  42.7  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00902633 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0376  FkbM family methyltransferase  27.38 
 
 
326 aa  42.7  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.589969  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2624  FkbM family methyltransferase  23.47 
 
 
282 aa  42.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0295  methyltransferase FkbM  26.71 
 
 
297 aa  42.4  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1567  FkbM family methyltransferase  25.95 
 
 
283 aa  42.4  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>