33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1809 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1809  FkbM family methyltransferase  100 
 
 		 233 aa  475  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198862 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1424  FkbM family methyltransferase  57.41 
 
 		 348 aa  254  9e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312344 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2545  methyltransferase FkbM  30.43 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0983  FkbM family methyltransferase  33.18 
 
 		 416 aa  98.6  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3594  methyltransferase FkbM  30.37 
 
 		 237 aa  87.4  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4187  FkbM family methyltransferase  28.71 
 
 		 234 aa  78.2  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.174493  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3134  FkbM family methyltransferase  32.57 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3719  methyltransferase FkbM  29.94 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.171567 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1716  FkbM family methyltransferase  31.25 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.174023  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  27.46 
 
 		 792 aa  55.1  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0747  methyltransferase FkbM  26.62 
 
 		 306 aa  51.2  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4789  methyltransferase FkbM family  25.48 
 
 		 268 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0197254 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2162  methyltransferase FkbM family  28.76 
 
 		 256 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3423  FkbM family methyltransferase  28.8 
 
 		 314 aa  49.3  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0570785 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0352  methyltransferase FkbM family  23.08 
 
 		 256 aa  48.5  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000196185  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4271  methyltransferase FkbM family  23.64 
 
 		 268 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5205  methyltransferase FkbM family  22.35 
 
 		 303 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2760  methyltransferase FkbM family  22.51 
 
 		 264 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  hitchhiker  0.00553627 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2883  methyltransferase FkbM family  27.41 
 
 		 309 aa  46.2  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.241941  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4024  methyltransferase FkbM family  25.42 
 
 		 351 aa  45.4  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2163  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  45.83 
 
 		 207 aa  45.4  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000531315 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1155  FkbM family methyltransferase  26.94 
 
 		 301 aa  44.7  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0273  methyltransferase FkbM family  30.77 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1469  FkbM family methyltransferase  26.99 
 
 		 330 aa  45.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0251117 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2961  hypothetical protein  30.43 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6950  FkbM family methyltransferase  26.95 
 
 		 283 aa  43.5  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3181  hypothetical protein  42.55 
 
 		 221 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169587  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1687  FkbM family methyltransferase  22.44 
 
 		 296 aa  43.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0061  FkbM family methyltransferase  26.41 
 
 		 259 aa  42.7  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0511  FkbM family methyltransferase  25.93 
 
 		 262 aa  42.7  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.472129  normal  0.0197823 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2145  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  42.55 
 
 		 221 aa  42.4  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0294  FkbM family methyltransferase  29.09 
 
 		 454 aa  42  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.314449  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2340  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  28.47 
 
 		 222 aa  41.6  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>