67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2545 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2545  methyltransferase FkbM  100 
 
 		 242 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1809  FkbM family methyltransferase  30.53 
 
 		 233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198862 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1424  FkbM family methyltransferase  29.28 
 
 		 348 aa  99.4  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312344 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0983  FkbM family methyltransferase  32.99 
 
 		 416 aa  94.7  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3594  methyltransferase FkbM  28.38 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4793  methyltransferase FkbM family  31.85 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.018486 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3719  methyltransferase FkbM  30.3 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.171567 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  30.09 
 
 		 792 aa  63.9  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2162  methyltransferase FkbM family  31.25 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4024  methyltransferase FkbM family  24.51 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0352  methyltransferase FkbM family  28.19 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000196185  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2142  FkbM family methyltransferase  33.82 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3134  FkbM family methyltransferase  26.46 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4187  FkbM family methyltransferase  28.57 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.174493  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0207  methyltransferase FkbM  31.15 
 
 		 235 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339437  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3719  methyltransferase FkbM  33.96 
 
 		 288 aa  53.9  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2953  methyltransferase FkbM family  27.91 
 
 		 271 aa  53.1  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1687  FkbM family methyltransferase  30.4 
 
 		 296 aa  53.1  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1152  hypothetical protein  30.83 
 
 		 261 aa  51.2  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.609848  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1244  methyltransferase FkbM  29.26 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1312  methyltransferase FkbM family  29.3 
 
 		 286 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1754  FkbM family methyltransferase  25.48 
 
 		 488 aa  50.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0751  methyltransferase FkbM  27.93 
 
 		 306 aa  50.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5205  methyltransferase FkbM family  25.3 
 
 		 303 aa  49.7  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2867  methyltransferase FkbM family  30.83 
 
 		 386 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  hitchhiker  0.00138469 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1155  FkbM family methyltransferase  40 
 
 		 301 aa  49.3  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3254  methyltransferase FkbM family  30.83 
 
 		 386 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1716  FkbM family methyltransferase  29.48 
 
 		 274 aa  48.9  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.174023  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1453  FkbM family methyltransferase  30.95 
 
 		 293 aa  48.9  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.214095  hitchhiker  0.000083365 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3219  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.43 
 
 		 307 aa  48.5  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607744  hitchhiker  0.0000170628 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4516  FkbM family methyltransferase  30 
 
 		 277 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0123  methyltransferase FkbM family  50.98 
 
 		 374 aa  47.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.785695  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2165  FkbM family methyltransferase  28.93 
 
 		 242 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2362  methyltransferase FkbM  30.34 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747821 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0234  hypothetical protein  29.75 
 
 		 275 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.160183  normal  0.50681 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2883  methyltransferase FkbM family  27.91 
 
 		 309 aa  47  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.241941  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4165  FkbM family methyltransferase  28.09 
 
 		 278 aa  47  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1955  FkbM family methyltransferase  31.97 
 
 		 283 aa  46.2  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00902633 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0618  hypothetical protein  27.56 
 
 		 264 aa  45.8  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.510827 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2883  methyltransferase FkbM  28.17 
 
 		 323 aa  45.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.722379  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2894  methyltransferase FkbM  24.82 
 
 		 296 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2673  methyltransferase FkbM family  28.67 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0382849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2360  methyltransferase FkbM  23.87 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0204457 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.83 
 
 		 316 aa  45.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.32 
 
 		 299 aa  44.7  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  41.94 
 
 		 318 aa  45.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3801  putative methyltransferase FkbM  31.85 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.403441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0747  methyltransferase FkbM  31.94 
 
 		 306 aa  43.9  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4789  methyltransferase FkbM family  25.81 
 
 		 268 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0197254 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1009  amino acid adenylation domain-containing protein  35.9 
 
 		 2706 aa  43.5  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1470  FkbM family methyltransferase  28.95 
 
 		 281 aa  43.5  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.684479  normal  0.1078 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6950  FkbM family methyltransferase  34.27 
 
 		 283 aa  43.5  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1459  methyltransferase FkbM family  29.66 
 
 		 301 aa  42.7  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3071  amino acid adenylation domain protein  40.58 
 
 		 3291 aa  43.1  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0942  methyltransferase FkbM  31.3 
 
 		 287 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0159897  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2760  methyltransferase FkbM family  21.47 
 
 		 264 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  hitchhiker  0.00553627 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1491  FkbM family methyltransferase  26.16 
 
 		 341 aa  43.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.20081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2327  ribosomal L11 methyltransferase  29.03 
 
 		 285 aa  42.7  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0021  protein of unknown function Met10  38.1 
 
 		 328 aa  42.7  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03158  putative methyltransferase  25.84 
 
 		 266 aa  42.7  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0324771  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0515  FkbM family methyltransferase  30.37 
 
 		 385 aa  42.4  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1174  FkbM family methyltransferase  37.14 
 
 		 299 aa  42.4  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.830745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0959  FkbM family methyltransferase  31.3 
 
 		 257 aa  42.4  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801487  normal  0.774702 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4431  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.5 
 
 		 312 aa  42  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00225658  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3038  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.29 
 
 		 312 aa  42  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000244532  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1015  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.5 
 
 		 312 aa  42  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1567  FkbM family methyltransferase  33.61 
 
 		 283 aa  42  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>