21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1424 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1424  FkbM family methyltransferase  100 
 
 		 348 aa  708    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312344 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1809  FkbM family methyltransferase  57.41 
 
 		 233 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0983  FkbM family methyltransferase  30.33 
 
 		 416 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2545  methyltransferase FkbM  28.83 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3594  methyltransferase FkbM  32.48 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3134  FkbM family methyltransferase  31.09 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4187  FkbM family methyltransferase  29.89 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.174493  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3719  methyltransferase FkbM  27.6 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.171567 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4271  methyltransferase FkbM family  26.18 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4789  methyltransferase FkbM family  25.95 
 
 		 268 aa  54.3  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0197254 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  26.28 
 
 		 792 aa  49.3  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2559  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50 
 
 		 225 aa  46.6  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.164869  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3423  FkbM family methyltransferase  27.97 
 
 		 314 aa  46.2  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0570785 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.29 
 
 		 316 aa  44.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2145  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.81 
 
 		 221 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2162  methyltransferase FkbM family  26.79 
 
 		 256 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  25.89 
 
 		 566 aa  43.1  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2883  methyltransferase FkbM family  27.27 
 
 		 309 aa  43.1  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.241941  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1269  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyl transferase  42.11 
 
 		 381 aa  42.7  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1290  Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  38.1 
 
 		 382 aa  42.7  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1388  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  38.1 
 
 		 370 aa  42.7  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.493791 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>