130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3181 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3181  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169587  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3080  hypothetical protein  98.19 
 
 
221 aa  418  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2983  hypothetical protein  95.93 
 
 
221 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.651745  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2946  hypothetical protein  77.67 
 
 
217 aa  303  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.669539 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0640  hypothetical protein  47.06 
 
 
223 aa  194  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335057  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0363  hypothetical protein  52.24 
 
 
223 aa  191  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2961  hypothetical protein  52.68 
 
 
218 aa  186  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210334  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3694  putative methyltransferase protein  50.24 
 
 
217 aa  185  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0573  hypothetical protein  49.28 
 
 
216 aa  185  6e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0043  hypothetical protein  47.83 
 
 
232 aa  181  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1107  hypothetical protein  50.71 
 
 
219 aa  181  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4015  putative methyltransferase protein  48.78 
 
 
215 aa  177  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_004310  BR1892  hypothetical protein  48.53 
 
 
218 aa  177  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1820  hypothetical protein  48.04 
 
 
218 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.385222  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2246  hypothetical protein  48.11 
 
 
219 aa  172  5e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0818704 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0970  hypothetical protein  47.06 
 
 
218 aa  169  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4139  hypothetical protein  49.51 
 
 
219 aa  169  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0253  hypothetical protein  45.59 
 
 
220 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0473  hypothetical protein  48.08 
 
 
225 aa  164  9e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.303142  normal  0.215459 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0759  hypothetical protein  47.25 
 
 
219 aa  162  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.580871 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1927  hypothetical protein  48.86 
 
 
216 aa  159  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.0886446 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0318  hypothetical protein  47.12 
 
 
231 aa  158  7e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1972  hypothetical protein  48.36 
 
 
216 aa  157  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5354  hypothetical protein  48.37 
 
 
216 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190586  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2248  hypothetical protein  49.03 
 
 
220 aa  157  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00723109  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5047  hypothetical protein  51.18 
 
 
232 aa  155  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0557  hypothetical protein  46.45 
 
 
218 aa  154  8e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3111  hypothetical protein  44.55 
 
 
215 aa  154  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1878  methyltransferase-like protein  45.12 
 
 
214 aa  146  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.627264  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2021  methyltransferase small  44.5 
 
 
221 aa  138  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0400913  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1573  methyltransferase type 12  45.67 
 
 
222 aa  131  9e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.973711 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1522  methyltransferase small  45.67 
 
 
222 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1825  methyltransferase small  45.26 
 
 
219 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0056314 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3122  methyltransferase small  42.66 
 
 
226 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  0.652615 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3352  methyltransferase small  44.9 
 
 
226 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.054842  hitchhiker  0.00782478 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2163  hypothetical protein  45.31 
 
 
214 aa  118  9e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5022  hypothetical protein  42.52 
 
 
218 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0687  hypothetical protein  48.08 
 
 
217 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4465  hypothetical protein  45.19 
 
 
217 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06680  hypothetical protein  52.48 
 
 
219 aa  78.6  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0557  methyltransferase type 12  44.62 
 
 
219 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0546  methyltransferase type 12  44.88 
 
 
218 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0564  methyltransferase type 12  43.08 
 
 
219 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1042  hypothetical protein  50.96 
 
 
220 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3860  methyltransferase type 12  50.96 
 
 
219 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.79296  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11350  hypothetical protein  47.12 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0604927  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25153  predicted protein  37 
 
 
338 aa  55.1  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00188354  hitchhiker  0.00255191 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0452  methyltransferase type 12  31.71 
 
 
244 aa  52.8  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3208  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.42 
 
 
300 aa  50.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0770215  decreased coverage  0.00369905 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  29.76 
 
 
202 aa  48.9  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3320  ribosomal protein L11 methyltransferase, putative  45.61 
 
 
198 aa  48.5  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2959  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.45 
 
 
309 aa  48.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000148567  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  31.65 
 
 
202 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0635  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.09 
 
 
311 aa  47.4  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.312814 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1383  Methyltransferase type 12  34.33 
 
 
249 aa  47  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1470  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.71 
 
 
308 aa  46.6  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.456616  unclonable  0.00000118267 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.94 
 
 
295 aa  46.6  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  30.38 
 
 
202 aa  46.6  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14081  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.23 
 
 
305 aa  46.6  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0500355  normal  0.0701563 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.14 
 
 
294 aa  46.6  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2861  histidine kinase  28.57 
 
 
219 aa  46.2  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0996  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.04 
 
 
305 aa  46.2  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0136  ribosomal L11 methyltransferase  39.29 
 
 
214 aa  45.8  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000366624  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0475  hypothetical protein  28.79 
 
 
227 aa  45.8  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0149122 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0718  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.03 
 
 
319 aa  45.4  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000247625  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.14 
 
 
295 aa  45.4  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0540  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.37 
 
 
293 aa  45.4  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01421  hypothetical protein  33.94 
 
 
129 aa  45.1  0.0009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.232872  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2327  ribosomal L11 methyltransferase  35.62 
 
 
285 aa  44.3  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0442  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.93 
 
 
294 aa  45.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2844  ribosomal L11 methyltransferase  38.46 
 
 
272 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.564771  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  43.84 
 
 
318 aa  44.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0810  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.41 
 
 
292 aa  44.7  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0859  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.67 
 
 
293 aa  44.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236714  normal  0.0659327 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_92679  predicted protein  30.95 
 
 
216 aa  44.3  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0208  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.09 
 
 
506 aa  44.3  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00971698  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3038  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.48 
 
 
312 aa  44.3  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000244532  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4163  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.48 
 
 
312 aa  44.3  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000153463  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.51 
 
 
295 aa  44.3  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4393  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.3 
 
 
312 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000946748  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0180  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.31 
 
 
296 aa  43.9  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0841101 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2866  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  37.7 
 
 
297 aa  43.9  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0092  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.66 
 
 
292 aa  44.3  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0951  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.17 
 
 
294 aa  43.9  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05251  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.32 
 
 
301 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6514  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.25 
 
 
285 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210209  normal  0.104822 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4479  ribosomal L11 methyltransferase  42.86 
 
 
305 aa  43.5  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0465  ribosomal L11 methyltransferase  36.84 
 
 
292 aa  43.9  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0228  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.67 
 
 
328 aa  43.9  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00278387  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4445  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.13 
 
 
312 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000232951  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4431  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.13 
 
 
312 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00225658  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4944  ribosomal L11 methyltransferase  42.86 
 
 
305 aa  43.5  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.478731 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1319  Lipocalin  26.35 
 
 
260 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00248779 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4211  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.13 
 
 
312 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000228671  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2947  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.58 
 
 
297 aa  43.1  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.18 
 
 
295 aa  43.5  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.22 
 
 
295 aa  43.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1809  FkbM family methyltransferase  42.55 
 
 
233 aa  43.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198862 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  50 
 
 
286 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.210387 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1764  hypothetical protein  27.69 
 
 
232 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>