More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1825 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1825  methyltransferase small  100 
 
 		 219 aa  428  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056314 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2021  methyltransferase small  82.19 
 
 		 221 aa  323  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0400913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0043  hypothetical protein  48.15 
 
 		 232 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0640  hypothetical protein  46.43 
 
 		 223 aa  166  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0253  hypothetical protein  45.54 
 
 		 220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0363  hypothetical protein  45.31 
 
 		 223 aa  159  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3694  putative methyltransferase protein  47.37 
 
 		 217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3080  hypothetical protein  44.78 
 
 		 221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5047  hypothetical protein  47.51 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_004310  BR1892  hypothetical protein  42.93 
 
 		 218 aa  149  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5354  hypothetical protein  46.95 
 
 		 216 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190586  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0759  hypothetical protein  51.05 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.580871 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0473  hypothetical protein  47.12 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.303142  normal  0.215459 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3181  hypothetical protein  45.26 
 
 		 221 aa  148  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169587  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1107  hypothetical protein  47.64 
 
 		 219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4015  putative methyltransferase protein  45.26 
 
 		 215 aa  145  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1820  hypothetical protein  42.42 
 
 		 218 aa  146  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.385222  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0318  hypothetical protein  42.65 
 
 		 231 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2961  hypothetical protein  43.98 
 
 		 218 aa  144  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0573  hypothetical protein  42.86 
 
 		 216 aa  142  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0970  hypothetical protein  40.4 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2983  hypothetical protein  44.78 
 
 		 221 aa  138  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.651745  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4139  hypothetical protein  44.16 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2946  hypothetical protein  45.79 
 
 		 217 aa  135  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.669539 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2246  hypothetical protein  40.5 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0818704 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1927  hypothetical protein  47.96 
 
 		 216 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.0886446 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3122  methyltransferase small  50.54 
 
 		 226 aa  128  6e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  0.652615 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2163  hypothetical protein  41.88 
 
 		 214 aa  126  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2248  hypothetical protein  45.92 
 
 		 220 aa  125  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00723109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1573  methyltransferase type 12  47.87 
 
 		 222 aa  125  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.973711 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1972  hypothetical protein  46.46 
 
 		 216 aa  125  6e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1878  methyltransferase-like protein  46.03 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.627264  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3111  hypothetical protein  42.93 
 
 		 215 aa  122  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1522  methyltransferase small  47.34 
 
 		 222 aa  122  6e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3352  methyltransferase small  48.91 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.054842  hitchhiker  0.00782478 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0557  hypothetical protein  40.8 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5022  hypothetical protein  44.09 
 
 		 218 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0687  hypothetical protein  40.28 
 
 		 217 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06680  hypothetical protein  42.66 
 
 		 219 aa  87.4  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4465  hypothetical protein  39.01 
 
 		 217 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0546  methyltransferase type 12  44.88 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3860  methyltransferase type 12  47.24 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.79296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0557  methyltransferase type 12  44.88 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1042  hypothetical protein  44.88 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11350  hypothetical protein  44.09 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0604927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0564  methyltransferase type 12  44.26 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1760  hypothetical protein  31.1 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0515  Methyltransferase type 12  27.33 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1383  Methyltransferase type 12  39.64 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1320  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.77 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.740107  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11400  HemK-related putative methylase  45.07 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4383  homocysteine S-methyltransferase  42.53 
 
 		 578 aa  58.2  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3467  methylase  33.33 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25153  predicted protein  38.3 
 
 		 338 aa  57  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00188354  hitchhiker  0.00255191 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0452  methyltransferase type 12  33.62 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0562  methyltransferase type 12  31.13 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02680  nicotinamide N-methyltransferase, putative  29.2 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0951  ribosomal protein L11 methyltransferase  54.72 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1764  hypothetical protein  29.71 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1626  hypothetical protein  30.43 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.220792 
 
 
-
 
NC_002950  PG0635  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.65 
 
 		 311 aa  54.7  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.312814 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3232  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.74588  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1185  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.96 
 
 		 324 aa  54.3  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00304497 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1029  methyltransferase small  28.81 
 
 		 240 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38927  predicted protein  29.41 
 
 		 300 aa  53.9  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1665  ribosomal L11 methyltransferase  42.62 
 
 		 264 aa  53.5  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1738  ribosomal L11 methyltransferase  40.62 
 
 		 264 aa  53.1  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0580  Methyltransferase type 12  29.25 
 
 		 233 aa  53.5  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.260933 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2623  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.96 
 
 		 298 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.906319 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3033  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.96 
 
 		 298 aa  52.8  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.08 
 
 		 316 aa  52.8  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4030  protein of unknown function Met10  50 
 
 		 552 aa  52.4  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3637  ribosomal protein L11 methyltransferase  54 
 
 		 297 aa  52.8  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1821  putative SAM-dependent methyltransferase  42.65 
 
 		 394 aa  52  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00015725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4117  ribosomal protein L11 methyltransferase  50 
 
 		 293 aa  51.6  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0350894  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2788  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.96 
 
 		 298 aa  51.6  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0136  ribosomal L11 methyltransferase  38.82 
 
 		 214 aa  51.6  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000366624  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.28 
 
 		 299 aa  51.2  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0005  methyltransferase small  33.08 
 
 		 264 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125741 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3208  ribosomal protein L11 methyltransferase  55.77 
 
 		 300 aa  51.6  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0770215  decreased coverage  0.00369905 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2947  ribosomal protein L11 methyltransferase  52 
 
 		 297 aa  51.6  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1319  Lipocalin  32.58 
 
 		 260 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00248779 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1549  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.59 
 
 		 304 aa  50.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  53.06 
 
 		 294 aa  51.2  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.61 
 
 		 295 aa  51.6  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0506  ribosomal protein L11 methyltransferase  48.98 
 
 		 293 aa  50.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0662184  hitchhiker  0.00329443 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3320  ribosomal protein L11 methyltransferase, putative  50 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0609  Methyltransferase type 12  27.71 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0859  ribosomal protein L11 methyltransferase  54 
 
 		 293 aa  50.8  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236714  normal  0.0659327 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0686  Methyltransferase type 12  31.13 
 
 		 236 aa  50.1  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3618  methyltransferase type 12  42.86 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.971669  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0465  ribosomal L11 methyltransferase  34.59 
 
 		 292 aa  49.7  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0391  ribosomal protein L11 methyltransferase  48 
 
 		 293 aa  50.1  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000998179  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0180  ribosomal protein L11 methyltransferase  55.1 
 
 		 296 aa  50.1  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0841101 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0996  ribosomal protein L11 methyltransferase  49.06 
 
 		 305 aa  49.7  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2176  modification methylase, HemK family  41.67 
 
 		 288 aa  50.1  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697869  normal  0.919129 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1576  ribosomal protein L11 methyltransferase-like protein  39.19 
 
 		 307 aa  50.1  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0767269  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0925  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 		 311 aa  49.3  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2589  hypothetical protein  29.32 
 
 		 240 aa  49.7  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3505  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.1 
 
 		 302 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>