133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1760 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1760  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0686  Methyltransferase type 12  67.73 
 
 
236 aa  314  8e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1626  hypothetical protein  62.84 
 
 
231 aa  290  1e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.220792 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0562  methyltransferase type 12  60.18 
 
 
239 aa  285  2.9999999999999996e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0609  Methyltransferase type 12  61.3 
 
 
235 aa  280  1e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0580  Methyltransferase type 12  55.16 
 
 
233 aa  263  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.260933 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0515  Methyltransferase type 12  55.11 
 
 
235 aa  254  6e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1319  Lipocalin  40.36 
 
 
260 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00248779 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0824  methyltransferase type 12  38.81 
 
 
200 aa  115  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0475  hypothetical protein  33.01 
 
 
227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0149122 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1383  Methyltransferase type 12  37.5 
 
 
249 aa  106  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2955  hypothetical protein  30.05 
 
 
237 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0919903  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1764  hypothetical protein  31.69 
 
 
232 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0005  methyltransferase small  33.33 
 
 
264 aa  94.7  9e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125741 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1098  methyltransferase small  29.56 
 
 
210 aa  89.7  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391663  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0452  methyltransferase type 12  29.67 
 
 
244 aa  88.6  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1002  methyltransferase small  31.28 
 
 
240 aa  85.1  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1029  methyltransferase small  32.94 
 
 
240 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3232  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 
218 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.74588  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0211  Methyltransferase type 12  31.48 
 
 
214 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.873381  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4036  histidine kinase  28.04 
 
 
221 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4465  hypothetical protein  39.86 
 
 
217 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1737  Methyltransferase-16, putative  29.19 
 
 
246 aa  72.8  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.762946 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01421  hypothetical protein  38.66 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.232872  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0687  hypothetical protein  39.33 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1914  histidine kinase  28.76 
 
 
221 aa  70.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.116894  normal  0.357859 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2848  histidine kinase  26.15 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.531025  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2589  hypothetical protein  31.54 
 
 
240 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3267  histidine kinase  28.67 
 
 
219 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2861  histidine kinase  28.67 
 
 
219 aa  67  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3309  histidine kinase  28.67 
 
 
219 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3445  histidine kinase  28.67 
 
 
219 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303754 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1100  histidine kinase  28.67 
 
 
219 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000104684 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3014  hypothetical protein  28.97 
 
 
230 aa  64.7  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5022  hypothetical protein  36.64 
 
 
218 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06680  hypothetical protein  38.89 
 
 
219 aa  60.1  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0573  hypothetical protein  35.88 
 
 
216 aa  58.9  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0513  hypothetical protein  29.3 
 
 
220 aa  57.8  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92228  predicted protein  30.91 
 
 
214 aa  58.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0546  methyltransferase type 12  35.07 
 
 
218 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0640  hypothetical protein  29.68 
 
 
223 aa  55.8  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335057  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_92679  predicted protein  34.55 
 
 
216 aa  55.5  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2435  hypothetical protein  27.95 
 
 
237 aa  55.5  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.77423 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4015  putative methyltransferase protein  31.54 
 
 
215 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0557  methyltransferase type 12  35.07 
 
 
219 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3694  putative methyltransferase protein  29.23 
 
 
217 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1892  hypothetical protein  27.69 
 
 
218 aa  53.1  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92077  predicted protein  30.07 
 
 
215 aa  52.8  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00026919  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2961  hypothetical protein  28.48 
 
 
218 aa  53.1  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210334  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0564  methyltransferase type 12  34.33 
 
 
219 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
266 aa  52  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50590  predicted protein  26.42 
 
 
264 aa  51.2  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.495223 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1042  hypothetical protein  38.51 
 
 
220 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0363  hypothetical protein  30 
 
 
223 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1820  hypothetical protein  26.92 
 
 
218 aa  49.7  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.385222  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46702  predicted protein  38.53 
 
 
337 aa  49.3  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.761256  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30.16 
 
 
295 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0557  hypothetical protein  35.38 
 
 
218 aa  49.7  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.37 
 
 
232 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  32.41 
 
 
281 aa  48.9  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5354  hypothetical protein  33.55 
 
 
216 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190586  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.45 
 
 
232 aa  48.5  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000143556  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_41615  predicted protein  27.66 
 
 
386 aa  47.8  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.37 
 
 
232 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0970  hypothetical protein  26.92 
 
 
218 aa  48.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36186  predicted protein  25.58 
 
 
249 aa  47.8  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0043  hypothetical protein  27.75 
 
 
232 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11350  hypothetical protein  36.49 
 
 
220 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0604927  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1395  putative methyltransferase  32.54 
 
 
175 aa  47  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  34.82 
 
 
283 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1441  methyltransferase  32.54 
 
 
175 aa  47  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31 
 
 
247 aa  47  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3860  methyltransferase type 12  36.36 
 
 
219 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.79296  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02680  nicotinamide N-methyltransferase, putative  30 
 
 
273 aa  46.2  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15760  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.91 
 
 
232 aa  46.2  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.32 
 
 
237 aa  46.2  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25153  predicted protein  37.08 
 
 
338 aa  46.2  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00188354  hitchhiker  0.00255191 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.32 
 
 
237 aa  46.2  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0253  hypothetical protein  28.9 
 
 
220 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2066  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.52 
 
 
236 aa  45.8  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.10278  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1927  hypothetical protein  32.76 
 
 
216 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.0886446 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26025  predicted protein  27.08 
 
 
248 aa  45.4  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.904011 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.5 
 
 
234 aa  44.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1916  putative SAM-dependent methyltransferase  32.89 
 
 
299 aa  44.7  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2495  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.56 
 
 
238 aa  44.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92828  predicted protein  27.88 
 
 
566 aa  45.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5047  hypothetical protein  33.01 
 
 
232 aa  44.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45331  predicted protein  35.62 
 
 
340 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0689578  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.58 
 
 
1561 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.98 
 
 
234 aa  43.5  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0876  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.03 
 
 
245 aa  44.3  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000138589  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 
242 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.167435  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1311  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 
242 aa  43.9  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.310574  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2847  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 
242 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.170371  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1317  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  25.45 
 
 
229 aa  44.3  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124117  hitchhiker  3.42912e-24 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.24 
 
 
239 aa  44.3  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1742  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.98 
 
 
239 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0460  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.45 
 
 
421 aa  43.1  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  30.69 
 
 
299 aa  43.5  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2071  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.32 
 
 
236 aa  43.1  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000425101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>