258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1892 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1892  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  441  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1820  hypothetical protein  99.54 
 
 		 218 aa  439  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.385222  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0970  hypothetical protein  86.24 
 
 		 218 aa  386  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3694  putative methyltransferase protein  68.45 
 
 		 217 aa  291  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4015  putative methyltransferase protein  66.99 
 
 		 215 aa  290  8e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2961  hypothetical protein  65.22 
 
 		 218 aa  276  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5354  hypothetical protein  67.31 
 
 		 216 aa  271  5.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190586  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4139  hypothetical protein  63.89 
 
 		 219 aa  267  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5047  hypothetical protein  63.64 
 
 		 232 aa  265  4e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0640  hypothetical protein  60 
 
 		 223 aa  257  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1107  hypothetical protein  63.24 
 
 		 219 aa  254  8e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0043  hypothetical protein  56.76 
 
 		 232 aa  247  8e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2246  hypothetical protein  57.77 
 
 		 219 aa  246  3e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0818704 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0253  hypothetical protein  60.19 
 
 		 220 aa  241  6e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2248  hypothetical protein  60.55 
 
 		 220 aa  240  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00723109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1972  hypothetical protein  60.55 
 
 		 216 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1927  hypothetical protein  62.5 
 
 		 216 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.0886446 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0759  hypothetical protein  58.74 
 
 		 219 aa  237  9e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.580871 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0363  hypothetical protein  57.89 
 
 		 223 aa  237  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0573  hypothetical protein  54.33 
 
 		 216 aa  235  3e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0318  hypothetical protein  59.62 
 
 		 231 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0473  hypothetical protein  60.58 
 
 		 225 aa  228  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.303142  normal  0.215459 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0557  hypothetical protein  54.03 
 
 		 218 aa  218  7e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3111  hypothetical protein  48.31 
 
 		 215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3080  hypothetical protein  48.53 
 
 		 221 aa  178  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1878  methyltransferase-like protein  48.8 
 
 		 214 aa  177  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.627264  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3181  hypothetical protein  48.53 
 
 		 221 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169587  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2946  hypothetical protein  50 
 
 		 217 aa  174  7e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.669539 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2163  hypothetical protein  49.03 
 
 		 214 aa  171  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2983  hypothetical protein  48.04 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.651745  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1522  methyltransferase small  49.76 
 
 		 222 aa  161  8.000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1573  methyltransferase type 12  49.27 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.973711 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2021  methyltransferase small  45.74 
 
 		 221 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0400913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3122  methyltransferase small  44.04 
 
 		 226 aa  135  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  0.652615 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3352  methyltransferase small  44.04 
 
 		 226 aa  135  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.054842  hitchhiker  0.00782478 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1825  methyltransferase small  42.93 
 
 		 219 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056314 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5022  hypothetical protein  43.8 
 
 		 218 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0687  hypothetical protein  37.5 
 
 		 217 aa  112  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4465  hypothetical protein  36.93 
 
 		 217 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0564  methyltransferase type 12  39.53 
 
 		 219 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0546  methyltransferase type 12  37.93 
 
 		 218 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06680  hypothetical protein  43.17 
 
 		 219 aa  96.7  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0557  methyltransferase type 12  43.07 
 
 		 219 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1042  hypothetical protein  42.96 
 
 		 220 aa  92  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11350  hypothetical protein  42.22 
 
 		 220 aa  89  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0604927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3860  methyltransferase type 12  37.87 
 
 		 219 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.79296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3618  methyltransferase type 12  43.38 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.971669  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0515  Methyltransferase type 12  28.67 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_92679  predicted protein  34.9 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1626  hypothetical protein  34.95 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.220792 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1319  Lipocalin  30.3 
 
 		 260 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00248779 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01421  hypothetical protein  34.23 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.232872  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0855  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.78 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000257486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0580  Methyltransferase type 12  29.13 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.260933 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  58.33 
 
 		 299 aa  54.3  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2327  ribosomal L11 methyltransferase  32.97 
 
 		 285 aa  54.3  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1549  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.25 
 
 		 304 aa  53.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3208  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.24 
 
 		 300 aa  53.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0770215  decreased coverage  0.00369905 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.94 
 
 		 295 aa  53.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3963  ribosomal protein L11 methyltransferase  47.54 
 
 		 293 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00574631  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.78 
 
 		 294 aa  53.5  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2244  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.46 
 
 		 293 aa  53.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.924831  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1760  hypothetical protein  27.69 
 
 		 229 aa  53.1  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.94 
 
 		 295 aa  53.1  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0996  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.53 
 
 		 305 aa  53.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0562  methyltransferase type 12  25.51 
 
 		 239 aa  52.8  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  39.19 
 
 		 202 aa  52.4  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  54 
 
 		 295 aa  52.4  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3938  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.9 
 
 		 293 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000797733  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0566  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.94 
 
 		 296 aa  52  0.000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0178303  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1665  ribosomal L11 methyltransferase  31.31 
 
 		 264 aa  51.6  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25153  predicted protein  39.02 
 
 		 338 aa  52  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00188354  hitchhiker  0.00255191 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1491  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.5 
 
 		 307 aa  52  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1470  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.68 
 
 		 308 aa  51.6  0.000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.456616  unclonable  0.00000118267 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0859  ribosomal protein L11 methyltransferase  53.06 
 
 		 293 aa  51.6  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236714  normal  0.0659327 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4079  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.9 
 
 		 293 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0139274  normal  0.0416888 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0951  ribosomal protein L11 methyltransferase  50 
 
 		 294 aa  51.2  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  37.84 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3886  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.9 
 
 		 293 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.393855  hitchhiker  0.00000257617 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  36.49 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0540  ribosomal protein L11 methyltransferase  50 
 
 		 293 aa  50.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0395  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.26 
 
 		 293 aa  50.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0527  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.86 
 
 		 289 aa  50.1  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  50.98 
 
 		 295 aa  50.4  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0401  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.26 
 
 		 293 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0130632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0687  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  37.21 
 
 		 353 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3335  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  37.21 
 
 		 353 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.533815 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3624  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.26 
 
 		 293 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000162524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1738  ribosomal L11 methyltransferase  31.31 
 
 		 264 aa  50.4  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0400  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.26 
 
 		 293 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0151894  normal  0.0533338 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3447  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  37.21 
 
 		 353 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00223061 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2861  histidine kinase  25.56 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3214  methyltransferase of 50S ribosomal subunit protein L11  50 
 
 		 311 aa  50.1  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1648  ribosomal protein L11 methyltransferase  32 
 
 		 308 aa  49.7  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.411566  hitchhiker  0.000715669 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  49.02 
 
 		 293 aa  50.1  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1496  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.9 
 
 		 296 aa  49.3  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2867  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.89 
 
 		 297 aa  49.7  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712304  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2844  ribosomal L11 methyltransferase  45.61 
 
 		 272 aa  49.3  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.564771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1622  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.54 
 
 		 307 aa  49.3  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174777  unclonable  0.000000000413669 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  51.02 
 
 		 295 aa  49.3  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>