145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0452 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0452  methyltransferase type 12  100 
 
 		 244 aa  497  1e-140  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1737  Methyltransferase-16, putative  41.35 
 
 		 246 aa  146  3e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.762946 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0005  methyltransferase small  36.48 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125741 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1029  methyltransferase small  38.6 
 
 		 240 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1002  methyltransferase small  32.26 
 
 		 240 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0562  methyltransferase type 12  28.83 
 
 		 239 aa  108  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1383  Methyltransferase type 12  33.5 
 
 		 249 aa  106  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1626  hypothetical protein  28.3 
 
 		 231 aa  102  5e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.220792 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0686  Methyltransferase type 12  30 
 
 		 236 aa  97.1  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0580  Methyltransferase type 12  24.32 
 
 		 233 aa  92  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.260933 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0609  Methyltransferase type 12  29.47 
 
 		 235 aa  89.7  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1760  hypothetical protein  29.67 
 
 		 229 aa  88.6  8e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0515  Methyltransferase type 12  25.82 
 
 		 235 aa  88.6  8e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3232  Methyltransferase type 11  25.91 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.74588  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1764  hypothetical protein  29.09 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1098  methyltransferase small  26.26 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1319  Lipocalin  32.56 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00248779 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0475  hypothetical protein  28.48 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0149122 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2955  hypothetical protein  26.46 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0919903  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2848  histidine kinase  23.53 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.531025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2589  hypothetical protein  29.77 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0824  methyltransferase type 12  31.4 
 
 		 200 aa  67  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1914  histidine kinase  30.43 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.116894  normal  0.357859 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0687  hypothetical protein  36.44 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4465  hypothetical protein  36.21 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0211  Methyltransferase type 12  28.83 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.873381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3014  hypothetical protein  27.71 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92077  predicted protein  33.33 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00026919  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06680  hypothetical protein  30.86 
 
 		 219 aa  62  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5022  hypothetical protein  32.76 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1100  histidine kinase  27.33 
 
 		 219 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000104684 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4036  histidine kinase  24.4 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3267  histidine kinase  27.33 
 
 		 219 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3309  histidine kinase  27.33 
 
 		 219 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3445  histidine kinase  27.33 
 
 		 219 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303754 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2861  histidine kinase  27.62 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2435  hypothetical protein  28.27 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.77423 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25153  predicted protein  35.23 
 
 		 338 aa  59.3  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00188354  hitchhiker  0.00255191 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3860  methyltransferase type 12  37.93 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.79296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3080  hypothetical protein  32.68 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0546  methyltransferase type 12  29.93 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0513  hypothetical protein  24.77 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1042  hypothetical protein  35.34 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92828  predicted protein  32.14 
 
 		 566 aa  53.1  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3694  putative methyltransferase protein  33.33 
 
 		 217 aa  52.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3181  hypothetical protein  31.71 
 
 		 221 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169587  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0557  methyltransferase type 12  35.11 
 
 		 219 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92228  predicted protein  24.26 
 
 		 214 aa  52  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0564  methyltransferase type 12  33.59 
 
 		 219 aa  52  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07290  conserved hypothetical protein  26.99 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0043  hypothetical protein  29.65 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  24.83 
 
 		 257 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2599  tellurite resistance protein TehB  34.65 
 
 		 298 aa  50.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4015  putative methyltransferase protein  33.33 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11350  hypothetical protein  34.48 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0604927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01421  hypothetical protein  27.62 
 
 		 129 aa  50.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.232872  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.94 
 
 		 259 aa  50.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48241  predicted protein  27.61 
 
 		 309 aa  50.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.360676  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0564  hypothetical protein  31.58 
 
 		 202 aa  49.7  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000796636  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0578  hypothetical protein  31.58 
 
 		 202 aa  49.7  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00141674  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2455  tellurite resistance protein TehB  32.67 
 
 		 298 aa  49.3  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0573  hypothetical protein  31.82 
 
 		 216 aa  49.7  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28521  predicted protein  27.81 
 
 		 229 aa  49.3  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.17089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3620  methyltransferase small  34.78 
 
 		 201 aa  49.3  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000543036  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01690  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.88 
 
 		 291 aa  48.9  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.160618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2367  ribosomal L11 methyltransferase  33.96 
 
 		 321 aa  48.5  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.234607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  31.86 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  30.09 
 
 		 360 aa  47.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 258 aa  46.6  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2880  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.17 
 
 		 273 aa  47  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  30.63 
 
 		 226 aa  47  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36186  predicted protein  26.85 
 
 		 249 aa  47  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1762  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.24 
 
 		 275 aa  46.6  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_40967  predicted protein  24.65 
 
 		 458 aa  46.2  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2044  methyltransferase type 12  32.26 
 
 		 369 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1717  Methyltransferase type 11  26.81 
 
 		 239 aa  46.6  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3378  methyltransferase small  37.5 
 
 		 207 aa  46.6  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.480246  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0182  hypothetical protein  24.82 
 
 		 202 aa  46.2  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.56568  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46371  predicted protein  26.14 
 
 		 460 aa  46.2  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0776  ribosomal L11 methyltransferase  34.21 
 
 		 300 aa  46.2  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.374062  normal  0.266147 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44043  predicted protein  24.18 
 
 		 348 aa  45.8  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.198797  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  25.62 
 
 		 255 aa  45.8  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2961  hypothetical protein  27.98 
 
 		 218 aa  45.8  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4031  ribosomal L11 methyltransferase  27.78 
 
 		 296 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0295987  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_92615  predicted protein  35.71 
 
 		 321 aa  45.8  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0038468  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45902  predicted protein  34.88 
 
 		 410 aa  45.4  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.361272 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1549  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.08 
 
 		 304 aa  45.4  0.0009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3434  methyltransferase type 11  30.5 
 
 		 286 aa  45.4  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012204 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1840  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.3 
 
 		 345 aa  45.4  0.0009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670431 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0217  ribosomal L11 methyltransferase  33.33 
 
 		 305 aa  45.4  0.0009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  36.62 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10134  glucose-inducible SAM-dependent methyltransferase Rrg1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16310)  29.25 
 
 		 354 aa  44.3  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0273649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2983  hypothetical protein  30.24 
 
 		 221 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.651745  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  31.4 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5617  ribosomal L11 methyltransferase  32.88 
 
 		 276 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2935  methyltransferase small  33.04 
 
 		 196 aa  44.3  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2010  methyltransferase small  41.07 
 
 		 199 aa  44.3  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10539  hypothetical protein  29.41 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.041688  hitchhiker  0.000199182 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  26.71 
 
 		 265 aa  43.5  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0188  methyltransferase small  39.66 
 
 		 196 aa  43.5  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>