108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0573 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0573  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  427  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0640  hypothetical protein  53.99 
 
 		 223 aa  253  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335057  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1892  hypothetical protein  54.33 
 
 		 218 aa  235  3e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1820  hypothetical protein  53.85 
 
 		 218 aa  232  3e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.385222  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4015  putative methyltransferase protein  53.99 
 
 		 215 aa  227  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2246  hypothetical protein  55.24 
 
 		 219 aa  226  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0818704 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0970  hypothetical protein  52.88 
 
 		 218 aa  226  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3694  putative methyltransferase protein  54.72 
 
 		 217 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1107  hypothetical protein  55.24 
 
 		 219 aa  223  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2961  hypothetical protein  52.36 
 
 		 218 aa  216  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0363  hypothetical protein  50.24 
 
 		 223 aa  210  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5047  hypothetical protein  56.28 
 
 		 232 aa  209  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3111  hypothetical protein  54.76 
 
 		 215 aa  209  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5354  hypothetical protein  54.98 
 
 		 216 aa  202  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190586  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4139  hypothetical protein  51.42 
 
 		 219 aa  202  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0043  hypothetical protein  48.83 
 
 		 232 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1878  methyltransferase-like protein  53.55 
 
 		 214 aa  198  5e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.627264  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0557  hypothetical protein  51.66 
 
 		 218 aa  191  7e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0253  hypothetical protein  46.48 
 
 		 220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1927  hypothetical protein  51.64 
 
 		 216 aa  186  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.0886446 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3080  hypothetical protein  49.76 
 
 		 221 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3181  hypothetical protein  49.28 
 
 		 221 aa  185  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169587  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0759  hypothetical protein  50.46 
 
 		 219 aa  184  8e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.580871 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2248  hypothetical protein  51.89 
 
 		 220 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00723109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1972  hypothetical protein  52.13 
 
 		 216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0318  hypothetical protein  48.36 
 
 		 231 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0473  hypothetical protein  49.3 
 
 		 225 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.303142  normal  0.215459 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2983  hypothetical protein  49.28 
 
 		 221 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.651745  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2946  hypothetical protein  51.44 
 
 		 217 aa  175  4e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.669539 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2163  hypothetical protein  47.62 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2021  methyltransferase small  46.35 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0400913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3122  methyltransferase small  45.6 
 
 		 226 aa  138  7e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  0.652615 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1573  methyltransferase type 12  45.79 
 
 		 222 aa  134  8e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.973711 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1522  methyltransferase small  45.79 
 
 		 222 aa  132  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3352  methyltransferase small  44.04 
 
 		 226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.054842  hitchhiker  0.00782478 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1825  methyltransferase small  42.86 
 
 		 219 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056314 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5022  hypothetical protein  44.29 
 
 		 218 aa  105  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0687  hypothetical protein  37.77 
 
 		 217 aa  101  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4465  hypothetical protein  36.7 
 
 		 217 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06680  hypothetical protein  38.76 
 
 		 219 aa  93.2  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0564  methyltransferase type 12  48.03 
 
 		 219 aa  92  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0557  methyltransferase type 12  47.24 
 
 		 219 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3860  methyltransferase type 12  48.82 
 
 		 219 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.79296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0546  methyltransferase type 12  46.46 
 
 		 218 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1042  hypothetical protein  48.03 
 
 		 220 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11350  hypothetical protein  47.24 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0604927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1319  Lipocalin  34.85 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00248779 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0515  Methyltransferase type 12  35.11 
 
 		 235 aa  62  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3618  methyltransferase type 12  38.1 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.971669  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1760  hypothetical protein  35.88 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25153  predicted protein  44.26 
 
 		 338 aa  57.4  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00188354  hitchhiker  0.00255191 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1764  hypothetical protein  31.71 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0475  hypothetical protein  28.75 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0149122 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2861  histidine kinase  27.27 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0580  Methyltransferase type 12  30.6 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.260933 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0562  methyltransferase type 12  33.98 
 
 		 239 aa  53.1  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2955  hypothetical protein  27.95 
 
 		 237 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0919903  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_92679  predicted protein  32.58 
 
 		 216 aa  52.4  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1626  hypothetical protein  34.62 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.220792 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3208  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.8 
 
 		 300 aa  50.8  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0770215  decreased coverage  0.00369905 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0686  Methyltransferase type 12  31.3 
 
 		 236 aa  50.1  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1098  methyltransferase small  25.95 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0452  methyltransferase type 12  31.82 
 
 		 244 aa  49.7  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0609  Methyltransferase type 12  32.82 
 
 		 235 aa  48.5  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2848  histidine kinase  26.49 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.531025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1029  methyltransferase small  32.26 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4030  protein of unknown function Met10  35.44 
 
 		 552 aa  47  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0412  hypothetical protein  33.86 
 
 		 398 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4764  hypothetical protein  33.86 
 
 		 398 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.095661 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4036  histidine kinase  25 
 
 		 221 aa  45.1  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1821  putative SAM-dependent methyltransferase  38.67 
 
 		 394 aa  45.1  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00015725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01421  hypothetical protein  31.82 
 
 		 129 aa  45.1  0.0009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.232872  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  29.89 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0951  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.31 
 
 		 294 aa  44.3  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2435  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.95 
 
 		 315 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0183971  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6514  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.88 
 
 		 285 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210209  normal  0.104822 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1849  methyltransferase small  31.61 
 
 		 398 aa  43.9  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0824  methyltransferase type 12  34.81 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04640  hypothetical protein  34.92 
 
 		 398 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0447  hypothetical protein  34.92 
 
 		 398 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.368535  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0996  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.37 
 
 		 305 aa  43.5  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1383  Methyltransferase type 12  30.69 
 
 		 249 aa  43.9  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1015  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.88 
 
 		 312 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  40 
 
 		 316 aa  43.1  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3267  histidine kinase  24.65 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  28.74 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4199  SAM-dependent methyltransferase  37.5 
 
 		 399 aa  43.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  28.92 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3309  histidine kinase  24.65 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3445  histidine kinase  24.65 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303754 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1100  histidine kinase  24.65 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000104684 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3232  Methyltransferase type 11  30.15 
 
 		 218 aa  42.7  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.74588  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1491  ribosomal protein L11 methyltransferase  47.92 
 
 		 307 aa  42.7  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3987  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.75 
 
 		 301 aa  43.1  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000114299 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1549  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.21 
 
 		 304 aa  42.7  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02680  nicotinamide N-methyltransferase, putative  25.42 
 
 		 273 aa  42.4  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  28.74 
 
 		 202 aa  42.4  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0859  ribosomal protein L11 methyltransferase  44 
 
 		 293 aa  42  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236714  normal  0.0659327 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45331  predicted protein  43.75 
 
 		 340 aa  42.4  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0689578  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0614  methylase of polypeptide chain release factor  32.97 
 
 		 271 aa  42  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>