252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0640 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0640  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  445  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0363  hypothetical protein  62.44 
 
 		 223 aa  258  7e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1892  hypothetical protein  60 
 
 		 218 aa  257  1e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1820  hypothetical protein  59.51 
 
 		 218 aa  254  9e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.385222  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0573  hypothetical protein  53.99 
 
 		 216 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1107  hypothetical protein  62.62 
 
 		 219 aa  253  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2246  hypothetical protein  59.52 
 
 		 219 aa  249  3e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0818704 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0970  hypothetical protein  58.54 
 
 		 218 aa  246  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0043  hypothetical protein  55.71 
 
 		 232 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0253  hypothetical protein  55.19 
 
 		 220 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4015  putative methyltransferase protein  54.76 
 
 		 215 aa  229  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3694  putative methyltransferase protein  55.71 
 
 		 217 aa  228  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0318  hypothetical protein  54.84 
 
 		 231 aa  227  9e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5047  hypothetical protein  55.91 
 
 		 232 aa  227  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1972  hypothetical protein  57.21 
 
 		 216 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2248  hypothetical protein  55.2 
 
 		 220 aa  223  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00723109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1927  hypothetical protein  57.55 
 
 		 216 aa  222  4e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.0886446 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2961  hypothetical protein  54.29 
 
 		 218 aa  221  6e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4139  hypothetical protein  54.38 
 
 		 219 aa  221  7e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0759  hypothetical protein  55.87 
 
 		 219 aa  221  8e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.580871 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5354  hypothetical protein  56.13 
 
 		 216 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190586  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0473  hypothetical protein  54.34 
 
 		 225 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.303142  normal  0.215459 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3111  hypothetical protein  53.55 
 
 		 215 aa  206  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0557  hypothetical protein  52.11 
 
 		 218 aa  201  9e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3181  hypothetical protein  47.06 
 
 		 221 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169587  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3080  hypothetical protein  46.43 
 
 		 221 aa  192  3e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1878  methyltransferase-like protein  51.17 
 
 		 214 aa  189  4e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.627264  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2946  hypothetical protein  50 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.669539 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2983  hypothetical protein  47.87 
 
 		 221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.651745  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2163  hypothetical protein  45.24 
 
 		 214 aa  169  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2021  methyltransferase small  45.77 
 
 		 221 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0400913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1573  methyltransferase type 12  44.93 
 
 		 222 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.973711 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1522  methyltransferase small  44.44 
 
 		 222 aa  146  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1825  methyltransferase small  46.43 
 
 		 219 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056314 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3122  methyltransferase small  44.1 
 
 		 226 aa  134  9e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  0.652615 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3352  methyltransferase small  42.56 
 
 		 226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.054842  hitchhiker  0.00782478 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5022  hypothetical protein  42.86 
 
 		 218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0687  hypothetical protein  34.03 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4465  hypothetical protein  33.85 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0546  methyltransferase type 12  41.01 
 
 		 218 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06680  hypothetical protein  35.05 
 
 		 219 aa  85.9  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0564  methyltransferase type 12  41.91 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0557  methyltransferase type 12  39.57 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1042  hypothetical protein  40.71 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11350  hypothetical protein  40 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0604927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3860  methyltransferase type 12  40.29 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.79296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3618  methyltransferase type 12  43.48 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.971669  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0515  Methyltransferase type 12  31.54 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0580  Methyltransferase type 12  31.85 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.260933 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1760  hypothetical protein  29.68 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1319  Lipocalin  29.32 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00248779 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0562  methyltransferase type 12  31.03 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  28.95 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  29.77 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25153  predicted protein  49.09 
 
 		 338 aa  53.9  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00188354  hitchhiker  0.00255191 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3208  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.5 
 
 		 300 aa  53.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0770215  decreased coverage  0.00369905 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0951  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.38 
 
 		 294 aa  52.8  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1626  hypothetical protein  31.54 
 
 		 231 aa  52.8  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.220792 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1622  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.89 
 
 		 307 aa  52  0.000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174777  unclonable  0.000000000413669 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  56.25 
 
 		 294 aa  52  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0859  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.78 
 
 		 293 aa  52  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236714  normal  0.0659327 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1549  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.07 
 
 		 304 aa  51.6  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_92679  predicted protein  34.07 
 
 		 216 aa  51.6  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0925  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.37 
 
 		 311 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2751  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.24 
 
 		 304 aa  50.8  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3467  methylase  38.1 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14081  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.65 
 
 		 305 aa  50.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0500355  normal  0.0701563 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  31.45 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0855  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.07 
 
 		 315 aa  50.8  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000257486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3637  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.24 
 
 		 297 aa  50.4  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3447  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.58 
 
 		 300 aa  50.1  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.801921  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0180  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.23 
 
 		 296 aa  50.1  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0841101 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0455  ribosomal protein L11 methyltransferase  49.02 
 
 		 293 aa  50.1  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000781607  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  50 
 
 		 295 aa  49.7  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17811  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.67 
 
 		 311 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.578713  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0527  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.4 
 
 		 289 aa  49.3  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0503  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.4 
 
 		 289 aa  49.3  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2861  histidine kinase  27.7 
 
 		 219 aa  49.7  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3963  ribosomal protein L11 methyltransferase  48 
 
 		 293 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00574631  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1665  ribosomal L11 methyltransferase  39.13 
 
 		 264 aa  49.7  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1383  Methyltransferase type 12  30.6 
 
 		 249 aa  49.3  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3232  Methyltransferase type 11  27.22 
 
 		 218 aa  49.3  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.74588  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0331  ribosomal protein L11 methyltransferase  50 
 
 		 293 aa  48.9  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0201798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1738  ribosomal L11 methyltransferase  39.13 
 
 		 264 aa  48.9  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1470  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.36 
 
 		 308 aa  48.9  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.456616  unclonable  0.00000118267 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.08 
 
 		 295 aa  48.9  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1648  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.36 
 
 		 308 aa  48.9  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.411566  hitchhiker  0.000715669 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2947  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.25 
 
 		 297 aa  48.9  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1101  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.19 
 
 		 298 aa  48.5  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0205003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  50 
 
 		 299 aa  48.9  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3038  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.31 
 
 		 312 aa  48.9  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000244532  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05251  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.08 
 
 		 301 aa  48.9  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3445  histidine kinase  26.04 
 
 		 219 aa  48.5  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303754 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3309  histidine kinase  26.04 
 
 		 219 aa  48.5  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3267  histidine kinase  26.04 
 
 		 219 aa  48.5  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1100  histidine kinase  26.04 
 
 		 219 aa  48.5  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000104684 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  27.69 
 
 		 202 aa  48.1  0.00009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44043  predicted protein  25.16 
 
 		 348 aa  48.1  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.198797  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  50 
 
 		 295 aa  48.5  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0092  ribosomal protein L11 methyltransferase  51.06 
 
 		 292 aa  47.8  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>