146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1029 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1029  methyltransferase small  100 
 
 
240 aa  485  1e-136  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0005  methyltransferase small  66.23 
 
 
264 aa  322  3e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125741 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1002  methyltransferase small  52.54 
 
 
240 aa  258  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1737  Methyltransferase-16, putative  41.28 
 
 
246 aa  180  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.762946 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0452  methyltransferase type 12  38.6 
 
 
244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0562  methyltransferase type 12  31.75 
 
 
239 aa  87.8  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0580  Methyltransferase type 12  28.36 
 
 
233 aa  85.1  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.260933 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1626  hypothetical protein  29.35 
 
 
231 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.220792 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0686  Methyltransferase type 12  30.24 
 
 
236 aa  84  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1760  hypothetical protein  32.94 
 
 
229 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1383  Methyltransferase type 12  37.01 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0609  Methyltransferase type 12  29.41 
 
 
235 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1098  methyltransferase small  33.1 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391663  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0515  Methyltransferase type 12  28.28 
 
 
235 aa  74.3  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1319  Lipocalin  31.94 
 
 
260 aa  66.2  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00248779 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1914  histidine kinase  28.95 
 
 
221 aa  62.4  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.116894  normal  0.357859 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3232  Methyltransferase type 11  31.09 
 
 
218 aa  62.4  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.74588  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92077  predicted protein  37.84 
 
 
215 aa  60.8  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00026919  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4036  histidine kinase  27.61 
 
 
221 aa  59.7  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3014  hypothetical protein  25.41 
 
 
230 aa  58.5  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2848  histidine kinase  24.26 
 
 
217 aa  57.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.531025  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2589  hypothetical protein  26.74 
 
 
240 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92828  predicted protein  35.2 
 
 
566 aa  57  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0687  hypothetical protein  34.15 
 
 
217 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5022  hypothetical protein  30.58 
 
 
218 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_92679  predicted protein  31.29 
 
 
216 aa  54.3  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0475  hypothetical protein  29.31 
 
 
227 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0149122 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1665  ribosomal L11 methyltransferase  33.33 
 
 
264 aa  52.8  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2955  hypothetical protein  41.89 
 
 
237 aa  52.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0919903  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1764  hypothetical protein  28.1 
 
 
232 aa  52.4  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1738  ribosomal L11 methyltransferase  33.33 
 
 
264 aa  52.4  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.33 
 
 
316 aa  51.6  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4465  hypothetical protein  30.15 
 
 
217 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2861  histidine kinase  30.17 
 
 
219 aa  50.4  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06680  hypothetical protein  34.53 
 
 
219 aa  50.1  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_35002  predicted protein  40 
 
 
302 aa  50.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.353104  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1107  hypothetical protein  31.97 
 
 
219 aa  49.3  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2197  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.89 
 
 
317 aa  48.9  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0855  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.47 
 
 
315 aa  48.5  0.00009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000257486  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10539  hypothetical protein  27.88 
 
 
247 aa  48.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.041688  hitchhiker  0.000199182 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0573  hypothetical protein  32.26 
 
 
216 aa  48.1  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  30 
 
 
318 aa  47.8  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0173  ribosomal protein L3 N-methyltransferase  38.03 
 
 
303 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18041  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4470  methyltransferase small  38.71 
 
 
223 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.820054 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0759  hypothetical protein  28.15 
 
 
219 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.580871 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0352  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  38.03 
 
 
303 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.576834  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2246  hypothetical protein  29.3 
 
 
219 aa  47.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0818704 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3148  tRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  29.93 
 
 
373 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_40967  predicted protein  29.55 
 
 
458 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2494  ribosomal protein L11 methyltransferase  25.69 
 
 
308 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00440175  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16816  predicted protein  27.61 
 
 
669 aa  47.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000655212 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45331  predicted protein  34.78 
 
 
340 aa  47.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0689578  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0211  Methyltransferase type 12  33.04 
 
 
214 aa  47.4  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.873381  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0129  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.37 
 
 
403 aa  47  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.483434  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1185  ribosomal protein L11 methyltransferase  24.32 
 
 
324 aa  47.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00304497 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0493  methyltransferase small  28.66 
 
 
372 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0959915  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0954  ribosomal protein L11 methyltransferase  30 
 
 
299 aa  47.8  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30928  predicted protein  35.4 
 
 
169 aa  47  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2709  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.17 
 
 
417 aa  47  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.443104  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01421  hypothetical protein  37.76 
 
 
129 aa  47  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.232872  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1993  ribosomal protein L11 methyltransferase  25.87 
 
 
278 aa  46.2  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3049  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.17 
 
 
418 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.43 
 
 
295 aa  46.2  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3063  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.17 
 
 
418 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1949  UDP-MurNac-pentapeptide presynthetase  31.07 
 
 
237 aa  46.2  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000302465  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3206  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.17 
 
 
428 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0273  16S RNA G1207 methylase RsmC  36.71 
 
 
211 aa  45.8  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3267  histidine kinase  28.17 
 
 
219 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1796  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.89 
 
 
316 aa  46.2  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.508174  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3309  histidine kinase  28.17 
 
 
219 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1314  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.17 
 
 
428 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.393675 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4383  homocysteine S-methyltransferase  34.25 
 
 
578 aa  46.2  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3445  histidine kinase  28.17 
 
 
219 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303754 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2758  methyltransferase small  32.99 
 
 
515 aa  46.2  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  decreased coverage  0.00000342693 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1309  methyltransferase small  32.04 
 
 
233 aa  46.2  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1100  histidine kinase  28.17 
 
 
219 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000104684 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2508  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  32.98 
 
 
394 aa  45.8  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_92615  predicted protein  36.36 
 
 
321 aa  45.4  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0038468  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07230  methylase of polypeptide chain release factors  35.24 
 
 
227 aa  45.4  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.242391  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2466  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.43 
 
 
426 aa  45.4  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1870  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.23 
 
 
299 aa  45.4  0.0009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3379  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.17 
 
 
418 aa  44.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1241  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.87 
 
 
418 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101333  normal  0.895253 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3031  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.48 
 
 
412 aa  44.7  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0425135  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1576  ribosomal protein L11 methyltransferase-like protein  28.92 
 
 
307 aa  45.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0767269  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11350  hypothetical protein  32.85 
 
 
220 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0604927  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1171  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.87 
 
 
418 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1003  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.38 
 
 
413 aa  44.7  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.510419  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3860  methyltransferase type 12  30.41 
 
 
219 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.79296  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0546  methyltransferase type 12  30.37 
 
 
218 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1042  hypothetical protein  31.97 
 
 
220 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2992  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  37.84 
 
 
421 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38927  predicted protein  23.81 
 
 
300 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0564  methyltransferase type 12  31.17 
 
 
219 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1927  hypothetical protein  27.83 
 
 
216 aa  45.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.0886446 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.73 
 
 
296 aa  43.9  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  29.76 
 
 
265 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1188  ribosomal protein L11 methyltransferase  32 
 
 
296 aa  43.9  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.158292  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1972  hypothetical protein  27.83 
 
 
216 aa  43.9  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1694  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.12 
 
 
296 aa  44.3  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.886603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>