156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45331 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_45331  predicted protein  100 
 
 		 340 aa  699    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0689578  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44043  predicted protein  28.89 
 
 		 348 aa  66.6  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.198797  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_35002  predicted protein  44.93 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.353104  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.56 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1626  hypothetical protein  40.54 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.220792 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_92615  predicted protein  33 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0038468  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0465  ribosomal L11 methyltransferase  38.16 
 
 		 292 aa  54.3  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.3 
 
 		 295 aa  53.5  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3208  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.62 
 
 		 300 aa  53.5  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0770215  decreased coverage  0.00369905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0388  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.33 
 
 		 293 aa  53.5  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000022526  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1210  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.33 
 
 		 306 aa  53.1  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191055  normal  0.886421 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0454  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.33 
 
 		 293 aa  53.5  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0196  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.48 
 
 		 317 aa  53.1  0.000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.886747  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  36 
 
 		 295 aa  53.1  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  36 
 
 		 295 aa  52.8  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92077  predicted protein  27.27 
 
 		 215 aa  52.8  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00026919  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  40.45 
 
 		 318 aa  52  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1576  ribosomal protein L11 methyltransferase-like protein  27.86 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0767269  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0475  hypothetical protein  40 
 
 		 227 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0149122 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.84 
 
 		 295 aa  52.4  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15391  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.57 
 
 		 303 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38927  predicted protein  38.27 
 
 		 300 aa  52.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1657  ribosomal L11 methyltransferase  40 
 
 		 247 aa  52.4  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  36 
 
 		 293 aa  52.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.04 
 
 		 294 aa  51.6  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1319  Lipocalin  38.46 
 
 		 260 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00248779 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1724  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.25 
 
 		 327 aa  51.2  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2435  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.03 
 
 		 315 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0183971  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32441  predicted protein  26.55 
 
 		 380 aa  50.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0241  ribosomal protein L11 methyltransferase  40 
 
 		 306 aa  50.8  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000356795  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07290  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 		 250 aa  50.4  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  36 
 
 		 295 aa  50.4  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3214  methyltransferase of 50S ribosomal subunit protein L11  38.03 
 
 		 311 aa  50.8  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0089  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.75 
 
 		 317 aa  50.1  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1969  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.48 
 
 		 317 aa  50.1  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_40967  predicted protein  25.62 
 
 		 458 aa  49.7  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1764  hypothetical protein  37.1 
 
 		 232 aa  49.3  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.27 
 
 		 286 aa  49.3  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.210387 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0540  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.5 
 
 		 293 aa  48.9  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1188  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.12 
 
 		 296 aa  48.9  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.158292  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0562  methyltransferase type 12  29.05 
 
 		 239 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1796  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.43 
 
 		 316 aa  49.3  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.508174  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92828  predicted protein  37.5 
 
 		 566 aa  48.9  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.25 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0225  ribosomal protein L11 methyltransferase  36 
 
 		 306 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1993  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.78 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1451  ribosomal protein L11 methyltransferase  30 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.279923  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2427  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.25 
 
 		 296 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.493009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.2 
 
 		 316 aa  48.1  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1665  ribosomal L11 methyltransferase  39.44 
 
 		 264 aa  48.5  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1738  ribosomal L11 methyltransferase  39.44 
 
 		 264 aa  48.5  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0228  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.78 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00278387  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10539  hypothetical protein  23.66 
 
 		 247 aa  47.8  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.041688  hitchhiker  0.000199182 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.19 
 
 		 296 aa  47.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1002  methyltransferase small  30.34 
 
 		 240 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1029  methyltransferase small  34.78 
 
 		 240 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2486  putative RNA methylase  41.94 
 
 		 207 aa  47.8  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2494  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.14 
 
 		 308 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00440175  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_41615  predicted protein  48.89 
 
 		 386 aa  47.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41150  predicted protein  22.36 
 
 		 347 aa  47.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.216905  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0580  Methyltransferase type 12  35.62 
 
 		 233 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.260933 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0187  ribosomal L11 methyltransferase  42.25 
 
 		 258 aa  47.8  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02500  Putative nicotinamide N-methyltransferase (EC 2.1.1.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BAD0]  28.06 
 
 		 262 aa  47  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00380138  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5617  ribosomal L11 methyltransferase  37.68 
 
 		 276 aa  47  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2376  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.25 
 
 		 296 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1943  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  36.71 
 
 		 299 aa  47.4  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0151109  normal  0.858484 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0529  methyltransferase small  34.65 
 
 		 211 aa  47  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3109  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.36 
 
 		 321 aa  47.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00713701  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5022  hypothetical protein  33.87 
 
 		 218 aa  47  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1015  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.13 
 
 		 312 aa  47  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0005  methyltransferase small  34.78 
 
 		 264 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125741 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2961  hypothetical protein  35.14 
 
 		 218 aa  47  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210334  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4393  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.13 
 
 		 312 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000946748  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0180  ribosomal protein L11 methyltransferase  40 
 
 		 296 aa  46.6  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0841101 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2955  hypothetical protein  34.92 
 
 		 237 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0919903  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0686  Methyltransferase type 12  25.79 
 
 		 236 aa  46.6  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4163  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.71 
 
 		 312 aa  46.6  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000153463  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0566  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.76 
 
 		 296 aa  46.2  0.0008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0178303  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0208  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.68 
 
 		 506 aa  46.2  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00971698  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1636  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.72 
 
 		 312 aa  46.2  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0215506  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1670  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.72 
 
 		 312 aa  46.2  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4445  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.59 
 
 		 312 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000232951  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0256  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.33 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0246  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  37.33 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0486812  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0651  methyltransferase related protein  25.45 
 
 		 201 aa  45.8  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.33 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0167166  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2983  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.39 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.599101  normal  0.251528 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3038  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.55 
 
 		 312 aa  45.8  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000244532  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1146  ribosomal protein L11 methyltransferase  22.86 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4049  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.59 
 
 		 312 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0005166  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4059  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.59 
 
 		 312 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000479623  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1760  hypothetical protein  35.62 
 
 		 229 aa  45.1  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3386  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  34.57 
 
 		 299 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0387461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4537  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.59 
 
 		 312 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104704  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3290  ribosomal L11 methyltransferase  41.33 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.448463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0092  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.62 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2959  ribosomal protein L11 methyltransferase  50 
 
 		 309 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000148567  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15141  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.71 
 
 		 300 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4334  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.59 
 
 		 312 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.10013e-48 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1098  methyltransferase small  28.57 
 
 		 210 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391663  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>