45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_44043 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011671  PHATR_44043  predicted protein  100 
 
 
348 aa  726    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.198797  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07290  conserved hypothetical protein  30.15 
 
 
250 aa  67  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45331  predicted protein  28.89 
 
 
340 aa  65.1  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0689578  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45902  predicted protein  30.11 
 
 
410 aa  63.9  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.361272 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26025  predicted protein  32.77 
 
 
248 aa  63.2  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.904011 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92828  predicted protein  30.86 
 
 
566 aa  62  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54329  Putative S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase of the seven beta-strand family  30.46 
 
 
296 aa  60.1  0.00000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.103283  hitchhiker  0.00259781 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_35002  predicted protein  28.38 
 
 
302 aa  58.2  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.353104  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32441  predicted protein  25.44 
 
 
380 aa  55.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10539  hypothetical protein  25.93 
 
 
247 aa  54.3  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.041688  hitchhiker  0.000199182 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46930  predicted protein  33.03 
 
 
352 aa  53.5  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.769754  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06013  conserved hypothetical protein  24.71 
 
 
327 aa  53.1  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.882233 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09098  conserved hypothetical protein  25.84 
 
 
352 aa  50.8  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000689737  normal  0.411917 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28521  predicted protein  27.33 
 
 
229 aa  50.8  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.17089  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03851  conserved hypothetical protein  26.11 
 
 
356 aa  51.2  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355606  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92077  predicted protein  34.72 
 
 
215 aa  50.4  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00026919  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_41615  predicted protein  34.62 
 
 
386 aa  50.8  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16816  predicted protein  40 
 
 
669 aa  50.1  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000655212 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30928  predicted protein  27.97 
 
 
169 aa  49.7  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02500  Putative nicotinamide N-methyltransferase (EC 2.1.1.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BAD0]  24.52 
 
 
262 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00380138  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0640  hypothetical protein  25.16 
 
 
223 aa  48.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335057  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_40967  predicted protein  35.48 
 
 
458 aa  47.4  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38927  predicted protein  27.92 
 
 
300 aa  47  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1626  hypothetical protein  25 
 
 
231 aa  46.6  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.220792 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10134  glucose-inducible SAM-dependent methyltransferase Rrg1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16310)  30.22 
 
 
354 aa  46.2  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0273649  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0005  methyltransferase small  25 
 
 
264 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125741 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02680  nicotinamide N-methyltransferase, putative  27.69 
 
 
273 aa  45.4  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16663  predicted protein  29.12 
 
 
1048 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.207195 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0452  methyltransferase type 12  24.18 
 
 
244 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25153  predicted protein  38 
 
 
338 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00188354  hitchhiker  0.00255191 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0363  hypothetical protein  40 
 
 
223 aa  44.3  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29666  predicted protein  24.42 
 
 
281 aa  44.3  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.294797  normal  0.0130447 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38064  predicted protein  25 
 
 
283 aa  43.9  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00684271  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_93639  predicted protein  24.42 
 
 
281 aa  44.3  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.252566 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50590  predicted protein  25 
 
 
264 aa  43.9  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.495223 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41150  predicted protein  25.3 
 
 
347 aa  43.5  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.216905  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0970  hypothetical protein  24.46 
 
 
218 aa  43.5  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77724  putative Cytosine deaminase FCY1  32.65 
 
 
306 aa  43.5  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46371  predicted protein  25.15 
 
 
460 aa  43.1  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_92615  predicted protein  38 
 
 
321 aa  43.1  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0038468  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92231  predicted protein  25.53 
 
 
156 aa  43.1  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5022  hypothetical protein  40 
 
 
218 aa  43.1  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_004310  BR1892  hypothetical protein  35.38 
 
 
218 aa  42.7  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1820  hypothetical protein  35.38 
 
 
218 aa  42.7  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.385222  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0687  hypothetical protein  40 
 
 
217 aa  42.7  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>