130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0363 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0363  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  447  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0640  hypothetical protein  62.44 
 
 
223 aa  258  7e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335057  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0043  hypothetical protein  61.24 
 
 
232 aa  242  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0970  hypothetical protein  58.37 
 
 
218 aa  237  9e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4139  hypothetical protein  61.72 
 
 
219 aa  237  9e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1892  hypothetical protein  57.89 
 
 
218 aa  237  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1820  hypothetical protein  57.42 
 
 
218 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.385222  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0253  hypothetical protein  60.29 
 
 
220 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3694  putative methyltransferase protein  56.73 
 
 
217 aa  229  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0759  hypothetical protein  61.72 
 
 
219 aa  229  4e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.580871 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4015  putative methyltransferase protein  55.5 
 
 
215 aa  228  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1107  hypothetical protein  60.19 
 
 
219 aa  227  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2961  hypothetical protein  55.29 
 
 
218 aa  226  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210334  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1927  hypothetical protein  58.94 
 
 
216 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.0886446 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0318  hypothetical protein  61.24 
 
 
231 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2248  hypothetical protein  58.94 
 
 
220 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00723109  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0473  hypothetical protein  59.81 
 
 
225 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.303142  normal  0.215459 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1972  hypothetical protein  58.94 
 
 
216 aa  215  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5354  hypothetical protein  58.37 
 
 
216 aa  214  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190586  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2246  hypothetical protein  55.07 
 
 
219 aa  213  1.9999999999999998e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0818704 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0573  hypothetical protein  50.24 
 
 
216 aa  210  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5047  hypothetical protein  57.21 
 
 
232 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3111  hypothetical protein  54.76 
 
 
215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3181  hypothetical protein  52.24 
 
 
221 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169587  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3080  hypothetical protein  52.24 
 
 
221 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1878  methyltransferase-like protein  53.33 
 
 
214 aa  187  8e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.627264  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2983  hypothetical protein  51.74 
 
 
221 aa  175  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.651745  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2163  hypothetical protein  47.85 
 
 
214 aa  171  5.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0557  hypothetical protein  48.31 
 
 
218 aa  171  6.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2946  hypothetical protein  51.47 
 
 
217 aa  168  5e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.669539 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1522  methyltransferase small  48.56 
 
 
222 aa  153  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1573  methyltransferase type 12  48.08 
 
 
222 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.973711 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3122  methyltransferase small  47.52 
 
 
226 aa  148  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  0.652615 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3352  methyltransferase small  45.54 
 
 
226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.054842  hitchhiker  0.00782478 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2021  methyltransferase small  45.5 
 
 
221 aa  138  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0400913  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1825  methyltransferase small  45.31 
 
 
219 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0056314 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0687  hypothetical protein  36.31 
 
 
217 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5022  hypothetical protein  36.99 
 
 
218 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4465  hypothetical protein  34.64 
 
 
217 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0564  methyltransferase type 12  46.22 
 
 
219 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0557  methyltransferase type 12  40.41 
 
 
219 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06680  hypothetical protein  35.48 
 
 
219 aa  84  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0546  methyltransferase type 12  39.73 
 
 
218 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11350  hypothetical protein  38.89 
 
 
220 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0604927  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1042  hypothetical protein  38.89 
 
 
220 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3860  methyltransferase type 12  42.86 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.79296  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3618  methyltransferase type 12  35.21 
 
 
218 aa  71.6  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.971669  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0515  Methyltransferase type 12  32.47 
 
 
235 aa  62.4  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1319  Lipocalin  32.59 
 
 
260 aa  58.9  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00248779 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1764  hypothetical protein  27.44 
 
 
232 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25153  predicted protein  47.76 
 
 
338 aa  56.2  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00188354  hitchhiker  0.00255191 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0951  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.46 
 
 
294 aa  52.4  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0475  hypothetical protein  28.15 
 
 
227 aa  52.4  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0149122 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_92679  predicted protein  34.81 
 
 
216 aa  52  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1626  hypothetical protein  27.45 
 
 
231 aa  51.6  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.220792 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0562  methyltransferase type 12  28.3 
 
 
239 aa  51.6  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1760  hypothetical protein  30 
 
 
229 aa  51.2  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.16 
 
 
295 aa  51.2  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0855  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.78 
 
 
315 aa  50.4  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000257486  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1383  Methyltransferase type 12  27.03 
 
 
249 aa  50.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38927  predicted protein  30.43 
 
 
300 aa  50.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2848  histidine kinase  26.24 
 
 
217 aa  49.7  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.531025  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2861  histidine kinase  25 
 
 
219 aa  48.9  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0635  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.26 
 
 
311 aa  48.9  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.312814 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4036  histidine kinase  24.34 
 
 
221 aa  48.1  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3208  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.26 
 
 
300 aa  47.8  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0770215  decreased coverage  0.00369905 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0686  Methyltransferase type 12  33.98 
 
 
236 aa  47.8  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46702  predicted protein  33.09 
 
 
337 aa  47.8  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.761256  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0859  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.04 
 
 
293 aa  47  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236714  normal  0.0659327 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0506  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.06 
 
 
293 aa  47.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0662184  hitchhiker  0.00329443 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2435  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.76 
 
 
315 aa  46.6  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0183971  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1015  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.36 
 
 
312 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4117  ribosomal protein L11 methyltransferase  50 
 
 
293 aa  46.6  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0350894  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0136  ribosomal L11 methyltransferase  45.1 
 
 
214 aa  46.2  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000366624  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1549  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.03 
 
 
304 aa  46.2  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.24 
 
 
294 aa  46.2  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0824  methyltransferase type 12  34.85 
 
 
200 aa  45.8  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  50 
 
 
295 aa  45.8  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  50 
 
 
295 aa  45.8  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0954  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.06 
 
 
299 aa  45.8  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_5006  predicted protein  30.49 
 
 
270 aa  45.4  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0895863  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.47 
 
 
299 aa  45.1  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3320  ribosomal protein L11 methyltransferase, putative  48 
 
 
198 aa  44.3  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11400  HemK-related putative methylase  35.38 
 
 
218 aa  44.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0566  ribosomal protein L11 methyltransferase  50 
 
 
296 aa  44.3  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0178303  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3232  Methyltransferase type 11  26.14 
 
 
218 aa  44.7  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.74588  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3637  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.91 
 
 
297 aa  44.3  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2327  ribosomal L11 methyltransferase  32.35 
 
 
285 aa  45.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0391  ribosomal protein L11 methyltransferase  48 
 
 
293 aa  44.7  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000998179  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2947  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.91 
 
 
297 aa  44.7  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2788  ribosomal protein L11 methyltransferase  33 
 
 
298 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  50 
 
 
295 aa  43.9  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0718  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.53 
 
 
319 aa  43.9  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000247625  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2244  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.62 
 
 
293 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.924831  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  48 
 
 
293 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44043  predicted protein  40 
 
 
348 aa  44.3  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.198797  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0452  methyltransferase type 12  25.27 
 
 
244 aa  43.5  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  30.95 
 
 
202 aa  43.5  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  50 
 
 
295 aa  42.7  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1491  ribosomal protein L11 methyltransferase  47.92 
 
 
307 aa  42.7  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>